Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 593 cluster # 593       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_593#0 length = 673 sequences # 2  

consensusID : consensus_593#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 673
fasta sequence
                              [GGCAATACTACTGTATCTGGTCTGAAATATTTTTGAACATATATAAATTCAGTCTGCAAGGCTGTGCTAAACCAAGATCTAATTCAAGGATACCTGATTTTCTTGGGTGTATATCGTATCAAACTACTGTCTACTTTAAATCTTCATCACATGGAAGTGATAATAACTCAGGCGACTTTTATAATTGTATTTGACTATTTCCTACTGTTTATAATACCTAATAGCATTTCGTAGTTACTTTCACACAGACTGATCATATATTATATTATTCACACCAAGTTTCATTCCAAATCGTGCGTTGTGTACGTTGCATCTATGTTGATGTAATTGCGCGTATTTGATGTGGAGCATTCTACTGATGTTGTTTTGTGTCATTGTTTCAGGGT-GATATCTTTCCGGAATTGTGAATCGGACATTGCGACGTGGTGTGATGGTGTCGTTTGAGACGATAGGGGGAGTTGTTTGGACAGGTTATAGTGTCCTTATTTTCCGGAATTGTGAATCGGACATTGCGACGTGGTGTGATGGTGTCGTTTGAGACGATAGGGGGAGTTGTTTGGACAGGTTATAGGTGAGTTAGTTGTATTGTAGAGTGTTGGTGGTGGTATAGTTGTAGTATAGGATTTGATTGTTGATGATGAATATCAGATTACCGCCCCAGTCTGAGTTTTGA]

[+] EMBL CD060088             [GGCAATACTACTGTATCTGGTCTGAAATATTTTTGAACATATATAAATTCAGTCTGCAAGGCTGTGCTAAACCAAGATCTAATTCAAGGATACCTGATTTTCTTGGGTGTATATCGTATCAAACTACTGTCTACTTTAAATCTTCATCACATGGAAGTGATAATAACTCAGGCGACTTTTATAATTGTATTTGACTATTTCCTACTGTTTATAATACCTAATAGCATTTCGTAGTTACTTTCACACAGACTGATCATATATTATATTATTCACACCAAGTTTCATTCCAAATCGTGCGTTGTGTACGTTGCATCTATGTTGATGTAATTGCGCGTATTTGATGTGGAGCATTCTACTGATGTTGTTTTGTGTCATTGTTTCAGGGT GATATC                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD071363             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATGTTGATGTAATTGCGCGTATTTGATGTGGAGCATTCTACTGATGTTGTTTTGTGTTATTGTTTCAGTGTCCTTAT TTTCCGGAATTGTGAATCGGACATTGCGACGTGGTGTGATGGTGTCGTTTGAGACGATAGGGGGAGTTGTTTGGACAGGTTATAGTGTCCTTATTTTCCGGAATTGTGAATCGGACATTGCGACGTGGTGTGATGGTGTCGTTTGAGACGATAGGGGGAGTTGTTTGGACAGGTTATAGGTGAGTTAGTTGTATTGTAGAGTGTTGGTGGTGGTATAGTTGTAGTATAGGATTTGATTGTTGATGATGAATATCAGATTACCGCCCCAGTCTGAGTTTTGA]


>consensus_593#0 GGCAATACTACTGTATCTGGTCTGAAATATTTTTGAACATATATAAATTCAGTCTGCAAG GCTGTGCTAAACCAAGATCTAATTCAAGGATACCTGATTTTCTTGGGTGTATATCGTATC AAACTACTGTCTACTTTAAATCTTCATCACATGGAAGTGATAATAACTCAGGCGACTTTT ATAATTGTATTTGACTATTTCCTACTGTTTATAATACCTAATAGCATTTCGTAGTTACTT TCACACAGACTGATCATATATTATATTATTCACACCAAGTTTCATTCCAAATCGTGCGTT GTGTACGTTGCATCTATGTTGATGTAATTGCGCGTATTTGATGTGGAGCATTCTACTGAT GTTGTTTTGTGTCATTGTTTCAGGGTGATATCTTTCCGGAATTGTGAATCGGACATTGCG ACGTGGTGTGATGGTGTCGTTTGAGACGATAGGGGGAGTTGTTTGGACAGGTTATAGTGT CCTTATTTTCCGGAATTGTGAATCGGACATTGCGACGTGGTGTGATGGTGTCGTTTGAGA CGATAGGGGGAGTTGTTTGGACAGGTTATAGGTGAGTTAGTTGTATTGTAGAGTGTTGGT GGTGGTATAGTTGTAGTATAGGATTTGATTGTTGATGATGAATATCAGATTACCGCCCCA GTCTGAGTTTTGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)