cluster # 5932

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Schistosoma mansoni
cluster # 5932 cluster # 5932 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5932#0 length = 760 sequences # 3

consensusID : consensus_5932#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 760
fasta sequence

                              [GAGGCCAAAAAAGACATAATGCCCGAAGGGACATCCTGGGTAGATTAATAAATTTTGGCGTCGCTAGGACCAAATATGCAACGGATTGTATTGGAATTTTATTAAGAGAGATGCGTCTCCTATCATCTAATCCTGGTGGCCCTCCTTGTTTATTGGTCATCGATGGTGTAAATTCCTTATGGTGTCGTGGAACTTTATTAAAGGATAAAACTCTTTCCGTTAATGTTACTACCGATCGATTGGCGATTGTACATCATTTGAAACGTGCATTGAGGGGAGACTGGCGTCATGGTGTCATAGTTACCTCTACAAATATTCGGGCGGCTTGGCCTACAGACAGAGAACAATATACTCCTGGTTATCTTTTGGGGAAATCCGGTTTCGAATATATGGATCCATTCATTCCTGTTCTCGCTGAAAATTACACCCCAACAGAAATTAATGCCTTATTAAGATTTTATGCAGAGAATAATTGGCTTACAAATCCCGCTGCTTTTACACCAAATGGACAAGCTGAATTAATATTTTTGTCTGATTATAATCCTCTGGAACTTAGCCGTTTAGCTGCTGAATGGTAGACTAATCGAACTATTAAAATATTAACTGAGTTGAAAATTATTAACCTATTGTCTGTATATTTAAAAGACTAAATAACAGTAATCTCTGTCCTCTTTT-AATTGGATATTGTAAATATCAGTGAAAT-ATCCTTTNAAATC-TTTGTACAGTTNTAACTTTNNTGATA-TTAGTAAAACATAAGTTA]

[+] EMBL CD081859             [GAGGCCAAAAAAGACATAATGCCCGAAGGGACATCCTGGGTAGATTAATAAATTTTGGCGTCGCTAGGACCAAATATGCAACGGATTGTATTGGAATTTTATTAAGAGAGATGCGTCTCCTATCATCTAATCCTGGTGGCCCTCCTTGTTTATTGGTCATCGATGGTGTAAATTCCTTATGGTGTCGTGGAACTTTATTAAAGGATAAAACTCTTTCCGTTAATGTTACTACCGATCGATTGGCGATTGTACATCATTTGAAACGTGCATTGAGGGGAGACTGGCGTCATGGTGTCATAGTTACCTCTACAAATATTCGGGCGGCTTGGCCTACAGACAGAGAACAATATACTCCTGGTTATCTTTTGGGGAAATCCGGTTTCGAATATATGGATCCATTCATTCCTGTTCTCGCTGAAAATTACACCCCAACAGAAATTAATGCCTTATTAAGATTTTATGCAGAGAATAATTGGCTTACAAATCCCGCTGCTTTTACACCAAATGGACAAGCTGAATTAATATTTTTGTCTGATTATAATCCTCTGGAACTTAGCCGTTTAGCTGCTGAATGGTAGACTAATCGAACTATTAAAATATTAACTGAGTTGAAAATTATTAACCTATTGTCTGTATATTTAAAAGACTAAATAACAGTAATCTCTGTCCTCTTTT AATTGGATATTGTAAATATCAGTGAAAT ATCCTTTNAAATC TTTGTACAGTTNTAACTTTNNTGATA TTAGTAAAACATAAGT  ]
[-] EMBL CD075573             [                                                                                                                                                                                                 TTTATTAAAGGATAAAACTCTTTCCGTTAATGTTACTACCGATCGATTGGCGATTGTACATCATTTGAAACGTGCATTGAGGGGAGACTGGCGTCATGGTGTCATAGTTACCTCTACAAATATTCGGGCGGCTTGGCCTACAGACAGAGAACAATATACTCCTGGTTATCTTTTGGGGAAATCCGGTTTCGAATATATGGATCCATTCATTCCTGTTCTCGCTGAAAATTACACCCCACCAGAAATTAATGCCTTATTAAGATTTTATGCAGAGAATAATTGGCTTACAAATCCCGCTGCTTTTACACCAAATGGACAAGCTGAATTAATATTTTTGTCTGATTATAATCCTCTGGAACTTACCCGTTTAGCTGCTGAATGGTAGACTAATCGAACTATTAAAATATTAACTGAGTTGAAAATTATTAACCTATTGTCTGTATATTTAAAAGACTAAATACCAGTAATCTCTGTCCTCTTTTAAATTGGATATTGTAAATATCAGTGAAATAATCCTTT AAATCTTTTGTACAGTTTTAACTTT TTGATATTTAGTAACCAATAAagta]
[-] EMBL CD112241             [                                                                                                                                                                                                                                                                                            CGTCATGGTGTCATAGTTACCTCTACAAATATTCGGGCGGCTTGGCCTACAGACAGAGAACAATATACTCCTGGTTATCTTTTGGGGAAATCCGGTTTCGAATATATGGATCCATTCATTCCTGTTCTCGCTGAAAATTACACCCCAACAGAAATTAATGCCTTATTAAGATTTTATGCAGAGAATAATTGGCTTACAAATCCCG                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]




>consensus_5932#0
GAGGCCAAAAAAGACATAATGCCCGAAGGGACATCCTGGGTAGATTAATAAATTTTGGCG
TCGCTAGGACCAAATATGCAACGGATTGTATTGGAATTTTATTAAGAGAGATGCGTCTCC
TATCATCTAATCCTGGTGGCCCTCCTTGTTTATTGGTCATCGATGGTGTAAATTCCTTAT
GGTGTCGTGGAACTTTATTAAAGGATAAAACTCTTTCCGTTAATGTTACTACCGATCGAT
TGGCGATTGTACATCATTTGAAACGTGCATTGAGGGGAGACTGGCGTCATGGTGTCATAG
TTACCTCTACAAATATTCGGGCGGCTTGGCCTACAGACAGAGAACAATATACTCCTGGTT
ATCTTTTGGGGAAATCCGGTTTCGAATATATGGATCCATTCATTCCTGTTCTCGCTGAAA
ATTACACCCCAACAGAAATTAATGCCTTATTAAGATTTTATGCAGAGAATAATTGGCTTA
CAAATCCCGCTGCTTTTACACCAAATGGACAAGCTGAATTAATATTTTTGTCTGATTATA
ATCCTCTGGAACTTAGCCGTTTAGCTGCTGAATGGTAGACTAATCGAACTATTAAAATAT
TAACTGAGTTGAAAATTATTAACCTATTGTCTGTATATTTAAAAGACTAAATAACAGTAA
TCTCTGTCCTCTTTTAATTGGATATTGTAAATATCAGTGAAATATCCTTTNAAATCTTTG
TACAGTTNTAACTTTNNTGATATTAGTAAAACATAAGTTA

clustalw multiple alignements is not computed in this case