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Schistosoma mansoni
cluster # 5935 cluster # 5935       Sequences # 3       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5935#0 length = 360 sequences # 3  
consensusID : consensus_5935#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 360
fasta sequence 
                              [TTATTATGTTCTTCATGTCGAGAACAAAGAGTAAACACTAGAGTATATTACTGTTTTGAAGTAGTACTAGTAATAATAATAATAGTAATGATAAGAAAAAAGATAATACTAGTAATGATTTTCAGTAGTTTATTTAATTCAGTAATAATAAGTTTTCTTGGTAAAAGAATGTTTAAACGATATGATTACTTTGAAAATTTCTATATTTGAGTCGTAATGTTGATATAATGTATGTATTTTCAAAATGATTTGTCTTTGATATCCATTAATTTGATATTTCTGTCTAGGATTATTTAC-AACTAGT-GTTATGATTTGTTTGGTAATTTCAGTGCTATAGGTAGATAAGTATGTAATTGAAAA]

[+] EMBL CD152114             [TTATTATGTTCTTCATGTCGAGAACAAAGAGTAAACACTAGAGTATATTACTGTTTTGAAGTAGTACTAGTAATAATAATAATAGTAATGATAAGAAAAAAGATAATACTAGTAATGATTTTCAGTAGTTTATTTAATTCAGTAATAATAAGTTTTCTTGGTAAAAGAATGTTTAAACGATATGATTACTTTGAAAATTTCTATATTTGAGTCGTAATGTTGATATAATGTATGTATTTTCAAAATGATTTGTCTTTGATATCCATTAATTTGATATTTCTGTCTAGGATTATTTAC AACTAGT GTTATGATTTGTTTGGTAATTTCAGTGCTATAGGTAGATCAGTATGTAATTGAAAA]
[+] EMBL CD152158             [  ATTATGTACTTCATGTC CGAACAAAGAGTAAACACTAGAGTATATTACTGTTTTGAAGTAGTACTAGTAATAATAATAATAGTAATGATAAGAAAAAAGATAATACTAGTAATGATTTTCAGTAGTTTATTTAATTCAGTAATAATAAGTTTTCTTGGTAGAAGAATGTTTATACGATATGATTACTTTGAAAATTTCTATATTTGAGTCGTAATGTTGATATAATGTATGTATTTTCAAAATGATTTGTCTTTGATATCCATTAATTTGATATTTCTGTCTAGGATTATTTAC CACTAGTGGTCTTGATTTGTTTGGTACTTTCAGTGCTATAGGTAGATAAGTATGTCATTGAAAA]
[+] EMBL CD152050             [                                                                aACTAGTAATAATAATAATAGTACTGATAAGAATAAAGATAATACTAGTAATGATTTTCAGTAGTTTATTTAATTCAGTAATAATAAGTTTTCTTGGTAAAAGAATGTTTAAACGATATGATTACTTTGAAAATTTCTATATTTGAGTCGTAATGTTGATATAATGTATGTATTTTCAAAATGATTTGTCTTTGATATCCATTAATTTGATATTTCTGTCTAGGACTATTTACAAACTAGT G TATGATTNGNTTNGCTATTTCAGGGCTATAGGTAGATAAGTATGTATTTGAca ]




>consensus_5935#0
TTATTATGTTCTTCATGTCGAGAACAAAGAGTAAACACTAGAGTATATTACTGTTTTGAA
GTAGTACTAGTAATAATAATAATAGTAATGATAAGAAAAAAGATAATACTAGTAATGATT
TTCAGTAGTTTATTTAATTCAGTAATAATAAGTTTTCTTGGTAAAAGAATGTTTAAACGA
TATGATTACTTTGAAAATTTCTATATTTGAGTCGTAATGTTGATATAATGTATGTATTTT
CAAAATGATTTGTCTTTGATATCCATTAATTTGATATTTCTGTCTAGGATTATTTACAAC
TAGTGTTATGATTTGTTTGGTAATTTCAGTGCTATAGGTAGATAAGTATGTAATTGAAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)