cluster # 5955

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Schistosoma mansoni
cluster # 5955 cluster # 5955 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5955#0 length = 599 sequences # 3

consensusID : consensus_5955#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 599
fasta sequence

                              [ATACTTTGTATAGACGTTTTGCCAAGCAAGTAAACAACATGACAACTTTAGAACTTACAGTGTCCTCACCTCGTTTGCATGAATATGGACAAGATTGGCAGTTAGCAGTACCTGGAAGTTATGAGCCTCACCGACCACTTGTAAGAATAGCATCAATTAAGAATTGTTTAACTTTTATCACCTCCAAACAACGTCCACGTAAATTAACGATCACAGGTTCAAATGGTCACCAATACGTGTTTTTGTTAAAAGGACATGAAGATACTCGTCAAGATGAACGTATTATGCAATTTTTCGGACTTGTAAACACATTGTTAATCAATAATCCGGAAACGTTACGTCGTAATTTAACAATTCAACGGATGTCTGTTATTCCATTATCTACATACACTGGATTGATTGGTTGGGTTCCAAACAGTGACACATTCCATAATTTAATACGTGATTATCGGGAAAAAGCTGATGTTGTGCTAAACAAAGAGAATCGTGAGATGCTTCGTTTGGCACCAGATTTCGATCGTCTAAATGTTATACAAAAAACTGAAATATTTGAAGCTGGGTTAAGAGAGTCATCTGGGAGAGATCTAGCTAATATTTTA]

[+] EMBL CD094541             [ATACTTTGTATAGACGTTTTGCCAAGCAAGTAAACAACATGACAACTTTAGAACTTACAGTGTCCTCACCTCGTTTGCATGAATATGGACAAGATTGGCAGTTAGCAGTACCTGGAAGTTATGAGCCTCACCGACCACTTGTAAGAATAGCATCAATTAAGAACTGTTTAACTTTTATCACCTCCAAACAACGTCCACGTAAATTAACGATCACAGGTTCAAATGGTCACCAATACGTGTTTTTGTTAAAAGGACATGAAGATACTCGTCAAGATGAACGTATTATGCAATTTTTCGGACTTGTAAACACATTGTTAATCAATAATCCGGAAACGTTACGTCGTAATTTAACAATTCAACGGATGTCTGTTATTCCATTATCTACATACACTGGATTGATTGGTTGGGTTCCAAACAGTGACACATTCCATAATTTAATACGTGATTATCGGGAAAAAGCTGATGTTGTGCTAAACAAAGAGAATCGTGAGATGCTTCGTTTGGCACCAGATTTCGATCGTCTAAATGTTATACAAAAAACTGAAATATTTGAAGCTGGGTTAAGAGAGTCATCTGGGAGAGATCTAGCTAATATTTTA]
[+] EMBL CD094469             [ATACTTTGTATAGACGTTTTGCCAAGCAAGTAAACAACATGACAACTTTAGAACTTACAGTGTCCTCACCTCGTTTGCATGAATATGGACAAGATTGGCAGTTAGCAGTACCTGGAAGTTATGAGCCTCACCGACCACTTGTAAGAATAGCATCAATTAAGAATTGTTTAACTTTTATCACCTCCAAACAACGTCCACGTAAATTAACGATCACAGGTTCAAATGGTCACCAATACGTGTTTTTGTTAAAAGGACATGAAGATACTCGTCAAGATGAACGTATTATGCAATTTTTCGGACTTGTAAACACATTGTTAATCAATAATCCGGAAACGTTACGTCGTAATTTAACAATTCAACGGATGTCTGTTATTCCATTATCTACATACACTGGATTGATTGGTTGGGTTCCAAACAGTGACACATTCCATAATTTAATACGTGATTATCGGGAAAAAGCTGATGTTGTGCTAAACAAAGAGAATCGTGAGAT                                                                                                          ]
[-] EMBL CD146993             [                                                                  CACCTCGTTTGCATGAATATGGACAAGATTGGCAGTTAGCAGTACCTGGAAGTTATGAGCCTCACCGACCACTTGTAAGAATAGCATCAATTAAGAATTGTTTAACTTTTATCACCTCCAAACAACGTCCACGTAAATTAACGATCACAGGTTCAAATGGTCACCAATACGTGTTTTTGTTAAAAGGACATGAAGATACTCGTCAAGATGAACGTATTATGCAATTTTTCGGACTTGTAAACACATTGTTAATCAATAATCCGGAAACGTTACGTCGTAATTTAACAATTCAACGGATGTCTGTTATTCCATTATCTACATACACTGGATTGATTGGTTGGGTTCCAAACAGTGACACATTCCATAATTTAATACGTGATTATCGGGAAAAAGCTGATGTTGTGCTAAACAAAGAGAATCGTGAGATGCTTCGTTTGGCACCAGATTTCGATCGTCTAAATGTTATACAAAAAACTGAA                                                      ]




>consensus_5955#0
ATACTTTGTATAGACGTTTTGCCAAGCAAGTAAACAACATGACAACTTTAGAACTTACAG
TGTCCTCACCTCGTTTGCATGAATATGGACAAGATTGGCAGTTAGCAGTACCTGGAAGTT
ATGAGCCTCACCGACCACTTGTAAGAATAGCATCAATTAAGAATTGTTTAACTTTTATCA
CCTCCAAACAACGTCCACGTAAATTAACGATCACAGGTTCAAATGGTCACCAATACGTGT
TTTTGTTAAAAGGACATGAAGATACTCGTCAAGATGAACGTATTATGCAATTTTTCGGAC
TTGTAAACACATTGTTAATCAATAATCCGGAAACGTTACGTCGTAATTTAACAATTCAAC
GGATGTCTGTTATTCCATTATCTACATACACTGGATTGATTGGTTGGGTTCCAAACAGTG
ACACATTCCATAATTTAATACGTGATTATCGGGAAAAAGCTGATGTTGTGCTAAACAAAG
AGAATCGTGAGATGCTTCGTTTGGCACCAGATTTCGATCGTCTAAATGTTATACAAAAAA
CTGAAATATTTGAAGCTGGGTTAAGAGAGTCATCTGGGAGAGATCTAGCTAATATTTTA

clustalw multiple alignements is not computed in this case