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Schistosoma mansoni
cluster # 5965 cluster # 5965       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5965#0 length = 679 sequences # 3  

consensusID : consensus_5965#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 679
fasta sequence
                              [TGAACATTTTTAACAGACTCCATTAAAGAAGCTCCACGTGCGTGTATTTTTGTAATAATATCTCTATATTG-TTAACAGGTACCCCAGTTTCACCAACTGCGCGTAAAACAACTTGAAATAATAATTCTGATTGGTCAAAATTAATTGAATTAATAGCCATAGCACATATTCGAAGTAAATTTTTCATATCACCCCAATTCTGTTCAAATTGAATATAAGGTATCCAGTATTCAGCTCGACTCCCATGTCCAGGTAACTTTATTAAACTTGTCCACAGAGAACGAGCGCGTTCTTTATCTTCAACATACTTTGCTTCAACAAATGCATAATAATTTAAAAGTGACCAATCAACATTTGATTGAGAGTGTAGTGATTCAAAACAATATTCTATAGCTCGACCAAATGTCGCCCGAAGTAATGACAGACGATATTCCCACGATAAAGAAGCCTTATCTAATAAACAAAGTCTACGAAAATGATGATCGCAATAACTACGCCAAATTTTCAATACATCATTTGGATTAGTGAAACCAGCTGCTAGAGCTGTTTCATATATACCATCAACCTCTTTAATAGATCAGACTCATTGGAAACAGATTCCTGTTGTGCTCCATTGGNTATTTGATTGAATGAGATATTTTCAAGAATCACAGTTTCGGTGACTAATGCATAACGCTGC]

[+] EMBL CD124565             [TGAACATTTTTAACAGACTCCATTAAAGAAGCTCCACGTGCGTGTATTTTTGTAATAATATCTCTATATTGTTTAACAGGTACCCCAGTTTCACCAACTGCGCGTAAAACAACTTGAAATAATAATTCTGATTGGTCAAAATTAATTGAATTAATAGCCATAGCACATATTCGAATTAAATTTTTCATATCACCCCAATTCTGATCAAATTGAATATAACGTATCCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD129719             [                                                                        tagcgAGGTACCCCAGTTTCACCAACTGCGCGTAAAACAACTTGAAATAATAATTCTGATTGGTCAAAATTAATTGAATTAATAGCCATAGCACATATTCGAAGTAAATTTTTCATATCACCCCAATTCTGTTCAAATTGAATATAAGGTATCCAGTATTCAGCTCGACTCCCATGTCCAGGTAACTTTATTAAACTTGTCCACAGAGAACGAGCGCGTTCTTTATCTTCAACATACTTTGCTTCAACAAATGCATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD094329             [                                                                                                                                                                 AGCACATATTCGAAGTAAATTTTTCATATCACCCCAATTCTGTTCAAATTGAATATAAGGTATCCAGTATTCAGCTCGACTCCCATGTCCAGGTAACTTTATTAAACTTGTCCACAGAGAACGAGCGCGTTCTTTATCTTCAACATACTTTGCTTCAACAAATGCATAATAATTTAAAAGTGACCAATCAACATTTGATTGAGAGTGTAGTGATTCAAAACAATATTCTATAGCTCGACCAAATGTCGCCCGAAGTAATGACAGACGATATTCCCACGATAAAGAAGCCTTATCTAATAAACAAAGTCTACGAAAATGATGATCGCAATAACTACGCCAAATTTTCAATACATCATTTGGATTAGTGAAACCAGCTGCTAGAGCTGTTTCATATATACCATCAACCTCTTTAATAGATCAGACTCATTGGAAACAGATTCCTGTTGTGCTCCATTGGNTATTTGATTGAATGAGATATTTTCAAGAATCACAGTTTCGGTGACTAATGCATAACGCTGC]


>consensus_5965#0 TGAACATTTTTAACAGACTCCATTAAAGAAGCTCCACGTGCGTGTATTTTTGTAATAATA TCTCTATATTGTTAACAGGTACCCCAGTTTCACCAACTGCGCGTAAAACAACTTGAAATA ATAATTCTGATTGGTCAAAATTAATTGAATTAATAGCCATAGCACATATTCGAAGTAAAT TTTTCATATCACCCCAATTCTGTTCAAATTGAATATAAGGTATCCAGTATTCAGCTCGAC TCCCATGTCCAGGTAACTTTATTAAACTTGTCCACAGAGAACGAGCGCGTTCTTTATCTT CAACATACTTTGCTTCAACAAATGCATAATAATTTAAAAGTGACCAATCAACATTTGATT GAGAGTGTAGTGATTCAAAACAATATTCTATAGCTCGACCAAATGTCGCCCGAAGTAATG ACAGACGATATTCCCACGATAAAGAAGCCTTATCTAATAAACAAAGTCTACGAAAATGAT GATCGCAATAACTACGCCAAATTTTCAATACATCATTTGGATTAGTGAAACCAGCTGCTA GAGCTGTTTCATATATACCATCAACCTCTTTAATAGATCAGACTCATTGGAAACAGATTC CTGTTGTGCTCCATTGGNTATTTGATTGAATGAGATATTTTCAAGAATCACAGTTTCGGT GACTAATGCATAACGCTGC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)