cluster # 5966

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Schistosoma mansoni
cluster # 5966 cluster # 5966 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5966#0 length = 769 sequences # 3

consensusID : consensus_5966#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 769
fasta sequence

                              [AGCAATCCACTAAGTTAAAAAACGAAGATATTTTTTTAAGATGTGGCAGGAATTACAAAACGAAGGAAAATACAGAGACTATGCGGTTTAAGGAAGTTTGGCAGCATAATATAGCTTTGCACCGGAATGAGTTAATTAGCAGAGAAAAAGAGAGCCCATGACATGATAAATTAAAGAACTTAGTCGTTGTGATAACAAAATCGACTGCGTAAAAACAATTTAGACAGAATATTCAGAAAGGTAACCACAAAAGTATAGTTATATCTAGAATTATTAAAGGAAAATGCAATCAACAACAAGACACGAGAATTAGAAAGACTAACTCATAATAGCTTGTGATAAACAGCCAGAATTATTCAGAGTTCAAAATAATTAAATAAGACGGAATAAGTATATATTCATACACGATAAAGAGTAGCAGAATAACCTAACTTGAGTTTTAGATTGACCATTGTGCAGAGAAAAAACTGGATGCAACAATTACAATCAAAGTACATAACAGATGACCATTTGATTGGAAATGTTTACATATCTCAATAATTGGCGGAGTTTAAAAAAAATTAAATAACAATTATATATATATATATATATATATATATATATATAAAAGTTTTTCATGATAATGAAGTTATGTAATTTCGGATGGATCTGCAAAAATTAAGCATTTCTAATGACAGAGTAGATTATAGTTCTTTTATTATAATTATTAAGTGATAATTTGATAATATGATGCACACTTATTGAGGTCAGAAGAAAATGTATTATTAAC]

[-] EMBL CD065394             [AGCAATCCACTAAGTTAAAAAACGAAGATATTTTTTTAAGATGTGGCAGGAATTACAAAACGAAGGAAAATACAGAGACTATGCGGTTTAAGGAAGTTTGGCAGCATAATATAGCTTTGCACCGGAATGAGTTAATTAGCAGAGAAAAAGAGAGCCCATGACATGATAAATTAAAGAACTTAGTCGTTGTGATAACAAAATCGACTGCGTAAAAACAATTTAGACAGAATATTCAGAAAGGTAACCACAAAAGTATAGTTATATCTAGAATTATTAAAGGAAAATGCAATCAACAACAAGACACGAGAATTAGAAAGACTAACTCATAATAGCTTGTGATAAACAGCCAGAATTATTCAGAGTTCAAAATAATTAAATAAGACGGAATAAGTATATATTCATACACGATAAAGAGTAGCAGAATAACCTAACTTGAGTTTTAGATTGACCATTGTGCAGAGAAAAAACTGGATGCAACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD119226             [ GCAATCCACTAAGTTAAAAAACGAAGATATTTTTTTAAGATGTGGCAGGAATTACAAAACGAAGGAAAATACAGAGACTATGCGGTTTAAGGAAGTTTGGCAGCATAATATAGCTTTGCACCGGAATGAGTTAATTAGCAGAGAAAAAGAGAGCCCATGACATGATAAATTAAAGAACTTAGTCGTTGTGATAACAAAATCGACTGCGTAAAAACAATTTAGACAGAATATTCAGAAAGGTAACCACAAAAGTATAGTTATATCTAGAATTATTAAAGGAAAATGCAATCAACAACAAGACACGAGAATTAGAAAGACTAACTCATAATAGCTTGTGATAAACAGCCAGAATTATTCAGAGTTCAAAATAATTAAATAAGACGGAATAAGTATATATTCATACACGATAAAGAGTAGCAGAATAACCTAACTTGAGTTTTAGATTGACCATTGTGCAGAGAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD169111             [                                                                                                                                                                ACATGATAAATTAAAGAACTTAGTCGTTGTGATAACAAAATCGACTGCGTAAAAACAATTTAGACAGAATATTCAGAAAGGTAACCACAAAAGTATAGTTATATCTAGAATTATTAAAGGAAAATGCAATCAACAACAAGACACGAGAATTAGAAAGACTAACTCATAATAGCTTGTGATAAACAGCCAGAATTATTCAGAGTTCAAAATAATTAAATAAGACGGAATAAGTATATATTCATACACGATAAAGAGTAGCAGAATAACCTAACTTGAGTTTTAGATTGACCATTGTGCAGAGAAAAAACTGGATGCAACAATTACAATCAAAGTACATAACAGATGACCATTTGATTGGAAATGTTTACATATCTCAATAATTGGCGGAGTTTAAAAAAAATTAAATAACAATTATATATATATATATATATATATATATATATATAAAAGTTTTTCATGATAATGAAGTTATGTAATTTCGGATGGATCTGCAAAAATTAAGCATTTCTAATGACAGAGTAGATTATAGTTCTTTTATTATAATTATTAAGTGATAATTTGATAATATGATGCACACTTATTGAGGTCAGAAGAAAATGTATTATTAAC]




>consensus_5966#0
AGCAATCCACTAAGTTAAAAAACGAAGATATTTTTTTAAGATGTGGCAGGAATTACAAAA
CGAAGGAAAATACAGAGACTATGCGGTTTAAGGAAGTTTGGCAGCATAATATAGCTTTGC
ACCGGAATGAGTTAATTAGCAGAGAAAAAGAGAGCCCATGACATGATAAATTAAAGAACT
TAGTCGTTGTGATAACAAAATCGACTGCGTAAAAACAATTTAGACAGAATATTCAGAAAG
GTAACCACAAAAGTATAGTTATATCTAGAATTATTAAAGGAAAATGCAATCAACAACAAG
ACACGAGAATTAGAAAGACTAACTCATAATAGCTTGTGATAAACAGCCAGAATTATTCAG
AGTTCAAAATAATTAAATAAGACGGAATAAGTATATATTCATACACGATAAAGAGTAGCA
GAATAACCTAACTTGAGTTTTAGATTGACCATTGTGCAGAGAAAAAACTGGATGCAACAA
TTACAATCAAAGTACATAACAGATGACCATTTGATTGGAAATGTTTACATATCTCAATAA
TTGGCGGAGTTTAAAAAAAATTAAATAACAATTATATATATATATATATATATATATATA
TATATAAAAGTTTTTCATGATAATGAAGTTATGTAATTTCGGATGGATCTGCAAAAATTA
AGCATTTCTAATGACAGAGTAGATTATAGTTCTTTTATTATAATTATTAAGTGATAATTT
GATAATATGATGCACACTTATTGAGGTCAGAAGAAAATGTATTATTAAC

clustalw multiple alignements is not computed in this case