Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 5982 cluster # 5982       Sequences # 3       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5982#0 length = 1202 sequences # 3  
consensusID : consensus_5982#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1202
fasta sequence 
                              [GAATTCGGCACGAGGTGTCTATGGACCTATGGATTGTTGCACATGCTCATGTGCTTTTCGAAAAATTAGTACTAAAGTTGTTTTTAACAAAATTGAATAGAAGATTATGTGCTTCAGCTTCACTCTTGATCAGTGCAAAACTGAATGATGTAAAAGGTTCACAATTATATGGTTTACTCCAAGAATTGGAGACAACGTTTCGTATCTCACGTCGTGATTTAATCAACACAGAATTAGATGTTGCATTGGGTTTAGAGTTTTCTCTAATTCCATCTGAATATGAAATTCTACCACATTATCAAAGGTTATATAAAAGTTTGAATTTAACTCTACCATTTCTACCAGCTGTGCTAACCACGAGTAATACCATTGGTGTTAATTGTTGTGTTGTTACATCGACTAATATAAATAATAATATTGATGACGATAATAATAATAATGCTAATAATAACAATACTAATTGTACAGTGAATCGTGAAAATCAACCATGTCTTGTATATACTGCTTCATCAAATATTTACAGCCCACAATTGAATCATTCAGTTACAAATTTACCACTTAACCTATGTAATCGTGTTGAAATATGAGTATCTTACTGTCCTCATNGGTTGTTGTTATTGAAATAGACTCCGGTTTTGGTAAACCTGTATATTTTGTGGGCTAGATTTATCGATCTCATATCTAGCGCAGGTCACTACTAACAGGTTACCACGAACACTCTTCGCTGTCTTTTATTATTTATTCCTTTACCACTATTATGTTACAT-TTTTTTTTATGTTGTCACTACTTATTTATACAGTCATGGTGATCATCCATTCTAGTCTATCAAGTTTCTCCTTAGTTCCTTACTGATTTTCTTGTTTATCATTGATACTCCTATATCTGACTGAACAAAAATGATTATGGTCGTTCTTGGTTCGACTGTATCGGTGTTTTATTTGTTGCCTTTTATTTCACACTACTCTTGTTATTATTTCTTGTTCCTGTTTTATGGATATTTCAACGTATCCATGAGGATGTGAAAGATTACTACTAACTACATTTGTGTGTTTTTCACAGTGTACATTTCATGTACTTGCATACAATTTGTTTCCTATCGAATATAAATAATGAATTATTAATGTATTTATTTAGTTATGAGTTGTGTACATAATCCATTTTCTGTTATTATATGCTACATAACATAGTGGTGAATAATCCTT]

[+] EMBL CD081898             [GAATTCGGCACGAGGTGTCTATGGACCTATGGATTGTTGCACATGCTCATGTGCTTTTCGAAAAATTAGTACTAAAGTTGTTTTTAACAAAATTGAATAGAAGATTATGTGCTTCAGCTTCACTCTTGATCAGTGCAAAACTGAATGATGTAAAAGGTTCACAATTATATGGTTTACTCCAAGAATTGGAGACAACGTTTCGTATCTCACGTCGTGATTTAATCAACACAGAATTAGATGTTGCATTGGGTTTAGAGTTTTCTCTAATTCCATCTGAATATGAAATTCTACCACATTATCAAAGGTTATATAAAAGTTTGAATTTAACTCTACCATTTCTACCAGCTGTGCTAACCACGAGTAATACCATTGGTGTTAATTGTTGTGTTGTTACATCGACTAATATAAATAATAATATTGATGACGATAATAATAATAATGCTAATAATAACAATACTAATTGTACAGTGAATCGTGAAAATCAACCATGTCTTGTATATACTGCTTCATCAAATATTTACAGCCCACAATTGAATCATTCAGTTACAAATTTACCACTTAACCTATGTAATCGTGTTGAAATATGAGTATCTTACTGTCCTCATNGGTTGTTGTTATTGAAATAGACTCCGGTTNTGGTAAACCTGTATATTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD077241             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TGAAATATGAGTATCTTACTGTCNTCAT GGTTGTTGTTATTGAAATAGACTCCGGTTTTGGTAAACCTGTATATTTTGTGGGCTAGATTTATCGATCTCATATCTAGCGCAGGTCACTACTAACAGGTTACCACGAACACTCTTCGCTGTCTTTTATTATTTATTCCTTTACCACTATTATGTTACATATTTTTTTTATGTTGTCACTACTTATTTATACAGTCATGGTGATCATCCATTCTAGTCTATCAAGTTTCTCCTTAGTTCCTTACTGATTTTCTTGTTTATCATTGATACTCCTATATCTGACTGAACAAAAATGATTATGGTCGTTCTTGGTTCGACTGTATCGGTGTTTTATTTGTTGCCTTTTATTTCACACTACTCTTGTTATTATTTCTTGTTCCTGTTTTATGGATATTTCAACGTATCCATGAGGATGTGAAAGATTACTACTAACTACATTTGTGTGTTTTTCACAGTGTACATTTCATGTACTTGCATACAATTTGTTTCCTATCGAATATAAATAATGAATTATTAATGTATTTATTTAGTTATGAGTTGTGTACATAATCCATTTTCTGTTATTATATGCTACATAACATAGTGGTGAATAATC   ]
[-] EMBL CD075600             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gTGTTGTTATTGAAATAGACTCCGGTTTTGGTAAACCTGTATATTTTGTGGGCTAGATTTATCGATCTCATATCTAGCGCAGGACACTACTAACAGGTTACCACTAACACTCTTCGCTGTCTTTTATTATTTATTCCTTTACCACTATTATGTTACAT TTTTTTTTATGTTGTCACTACTTATTTATACAGTCATGGTGATCATCCATTCTAGTCTATCAAGTTTCTCCTTAGTTCCTTACTGATTTTTTTGTTTATCATTGATACTCCTATATCTGACTGAACAAAAATGATTATGGTCGTTCTTGGTTCGACTGTATCGGTGTTTTATTTGTTGCCTTTTATTTCACACTACTCTTGTTATTATTTCTTGTTCCTGTTTTATGGATATTTCAACGTATCCATGAGGATGTGAAAAATTACTACTAACTACATTTGTGTGTTTTTCACAGTGTACATTTCATGTACTTGCATACAATTTGTTTCCTATCGAATATAAATAATGAATTATTAATGTATTTATTTAGTTATGAGTTGTGTACATAATCCATTTTCTGTTATTATATGCTACATAACATATTGGTGAATAAATCTT]




>consensus_5982#0
GAATTCGGCACGAGGTGTCTATGGACCTATGGATTGTTGCACATGCTCATGTGCTTTTCG
AAAAATTAGTACTAAAGTTGTTTTTAACAAAATTGAATAGAAGATTATGTGCTTCAGCTT
CACTCTTGATCAGTGCAAAACTGAATGATGTAAAAGGTTCACAATTATATGGTTTACTCC
AAGAATTGGAGACAACGTTTCGTATCTCACGTCGTGATTTAATCAACACAGAATTAGATG
TTGCATTGGGTTTAGAGTTTTCTCTAATTCCATCTGAATATGAAATTCTACCACATTATC
AAAGGTTATATAAAAGTTTGAATTTAACTCTACCATTTCTACCAGCTGTGCTAACCACGA
GTAATACCATTGGTGTTAATTGTTGTGTTGTTACATCGACTAATATAAATAATAATATTG
ATGACGATAATAATAATAATGCTAATAATAACAATACTAATTGTACAGTGAATCGTGAAA
ATCAACCATGTCTTGTATATACTGCTTCATCAAATATTTACAGCCCACAATTGAATCATT
CAGTTACAAATTTACCACTTAACCTATGTAATCGTGTTGAAATATGAGTATCTTACTGTC
CTCATNGGTTGTTGTTATTGAAATAGACTCCGGTTTTGGTAAACCTGTATATTTTGTGGG
CTAGATTTATCGATCTCATATCTAGCGCAGGTCACTACTAACAGGTTACCACGAACACTC
TTCGCTGTCTTTTATTATTTATTCCTTTACCACTATTATGTTACATTTTTTTTTATGTTG
TCACTACTTATTTATACAGTCATGGTGATCATCCATTCTAGTCTATCAAGTTTCTCCTTA
GTTCCTTACTGATTTTCTTGTTTATCATTGATACTCCTATATCTGACTGAACAAAAATGA
TTATGGTCGTTCTTGGTTCGACTGTATCGGTGTTTTATTTGTTGCCTTTTATTTCACACT
ACTCTTGTTATTATTTCTTGTTCCTGTTTTATGGATATTTCAACGTATCCATGAGGATGT
GAAAGATTACTACTAACTACATTTGTGTGTTTTTCACAGTGTACATTTCATGTACTTGCA
TACAATTTGTTTCCTATCGAATATAAATAATGAATTATTAATGTATTTATTTAGTTATGA
GTTGTGTACATAATCCATTTTCTGTTATTATATGCTACATAACATAGTGGTGAATAATCC
TT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)