cluster # 5983

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 5983 cluster # 5983 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5983#0 length = 749 sequences # 3

consensusID : consensus_5983#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 749
fasta sequence

                              [TTATCGAATGAATTCACTTAGTAACAAAAATAATAATAATAGAGATTCTATTCTATCAAATGGTAGTGTAAGTAGTGCAACTAGTTCACTTATTGCTACAAATGATTTACCAAAATTATTCAATAATACATTACAAAATCGATCGAATTCACTTGATCAATCCGTTATTCAACTTGAACATGGAACAAGTGTACAATGTTCAACAATAAAATTATTACCATTCACTTCATTTTTCAATACATTATATGTATCCCCAAAGTCGTTGAATATGTCAGGGAAACACAATTTTCCAAGGGCTCGAAATTTATCATGTTTCATTGAATTACGAAGTAATGATAATTTGGATAATGCCA-CTGCATTAAAGGTGTTTTACA-CTCGTCCAAGTATTCGTCAGCCAATATTTGATTCATGGTTTAATACTGCCGTAATATATCATGATAATTATCCAAATTTCAGTGAACAAGCTAAAATTTGTTTACCGCTAAATTTAACTTCAAAACATCATTTATTATTTCGTTTTTATCATGTAAGCTGTGAGACAGCTTCAACAAATTTATTAACTTCGAAAGAGAAATCTAACAACAATAGTAGTATTAGTAGTAGTAATACTACTAATAATAAAAAACCTGTTGAATCAAGTACAGGCTATTCATGGATTCCAATACTTGGAACAGATGGAAATTTAAATGTTGGAACATTTCAACTTCGTATTGCATCAACTATTCATCCGGGTTATTTACAACAATCAA]

[-] EMBL CD065492             [TTATCGAATGAATTCACTTAGTAACAAAAATAATAATAATAGAGATTCTATTCTATCAAATGGTAGTGTAAGTAGTGCAACTAGTTCACTTATTGCTACAAATGATTTACCAAAATTATTCAATAATACATTACAAAATCGATCGAATTCACTTGATCAATCCGTTATTCAACTTGAACATGGAACAAGTGTACAATGTTCAACAATAAAATTATTACCATTCACTTCATTTTTCAATACATTATATGTATCCCCAAAGTCGTTGAATATGTCAGGGAAACACAATTTTCCAAGGGCTCGAAATTTATCATGTTTCATTGAATTACGAAGTAATGATAATTTGGATAATGCCAGCTGCATTAAAGGTGTTTTACA CTCGTCCAAGTATTCGTCAGCC ATATTTGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD140835             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TATCATGTTTCATTGAATTACGAAGTAATGATAATTTGGATAATGCCA CTGCATTAATGGTGTTTTACACCTCGTCCAAGTATTCGTCAGCCAATATTTGATTCATGGTTTAATACTGCCGTAATATATCATGATAATTATCCAAATTTCAGTGAACAAGCTAAAATTTGTTTACCGCTAAATTTAACTTCAAAACATCATTTATTATTTCGTTTTTATCATGT                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD197745             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TCATTGAATTACGAAGTAATGATAATTTGGATAATGCCA CTGCATTAAAGGTGTTTTACA CTCGTCCAAGTATTCGTCAGCCAATATTTGATTCATGGTTTAATACTGCCGTAATATATCATGATAATTATCCAAATTTCAGTGAACAAGCTAAAATTTGTTTACCGCTAAATTTAACTTCAAAACATCATTTATTATTTCGTTTTTATCATGTAAGCTGTGAGACAGCTTCAACAAATTTATTAACTTCGAAAGAGAAATCTAACAACAATAGTAGTATTAGTAGTAGTAATACTACTAATAATAAAAAACCTGTTGAATCAAGTACAGGCTATTCATGGATTCCAATACTTGGAACAGATGGAAATTTAAATGTTGGAACATTTCAACTTCGTATTGCATCAACTATTCATCCGGGTTATTTACAACAATCAA]




>consensus_5983#0
TTATCGAATGAATTCACTTAGTAACAAAAATAATAATAATAGAGATTCTATTCTATCAAA
TGGTAGTGTAAGTAGTGCAACTAGTTCACTTATTGCTACAAATGATTTACCAAAATTATT
CAATAATACATTACAAAATCGATCGAATTCACTTGATCAATCCGTTATTCAACTTGAACA
TGGAACAAGTGTACAATGTTCAACAATAAAATTATTACCATTCACTTCATTTTTCAATAC
ATTATATGTATCCCCAAAGTCGTTGAATATGTCAGGGAAACACAATTTTCCAAGGGCTCG
AAATTTATCATGTTTCATTGAATTACGAAGTAATGATAATTTGGATAATGCCACTGCATT
AAAGGTGTTTTACACTCGTCCAAGTATTCGTCAGCCAATATTTGATTCATGGTTTAATAC
TGCCGTAATATATCATGATAATTATCCAAATTTCAGTGAACAAGCTAAAATTTGTTTACC
GCTAAATTTAACTTCAAAACATCATTTATTATTTCGTTTTTATCATGTAAGCTGTGAGAC
AGCTTCAACAAATTTATTAACTTCGAAAGAGAAATCTAACAACAATAGTAGTATTAGTAG
TAGTAATACTACTAATAATAAAAAACCTGTTGAATCAAGTACAGGCTATTCATGGATTCC
AATACTTGGAACAGATGGAAATTTAAATGTTGGAACATTTCAACTTCGTATTGCATCAAC
TATTCATCCGGGTTATTTACAACAATCAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case