cluster # 5986

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Schistosoma mansoni
cluster # 5986 cluster # 5986 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5986#0 length = 794 sequences # 3

consensusID : consensus_5986#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 794
fasta sequence

                              [TAAAACACGAGGTTCTGGAAGGACACCATTTATTGGATTCATACTAGTTGATGATATTGTAACATTGTTAATATAAGATCCAGTTGATGAACCCCATTCGAATGGATTTAAACGTCTAAGTAGGTCAAGTACAGCACTAACCCATGATACATTTGTATCAGCATTGAAATTAGATATAACTAATTCTTCTTGAATATCAGCAGGTATATTTTGATTATTTGTTTGTGAATAGAAATCGGGTAAAACAATTGAATTCACTTGAAATGCACTAGTTAATCGGGAAATTAATCGTGTCAAAATATTATTCTGCTCTAAAAGTTGACGTGCCAAACTGATAACGGTGTAAAATTGACAACTTAAACCACACAGACTGTCTCCGACTAAATGATCATCATAAATATGATTTTGAATTAATGATGAATATGATCTGGTAAATTTAATTGCAAATACACATCGATAAAAGTTATCTTTTAAGAGTACACTCATAATAAGACGTAACATTTCTTGTCGAACAGATCTCCATGTTAAACTATGACGTTCCAATATATGATTTAAAAATGAATCTTCTTTAACAGTTTCTCCGGGCAGTAATATTGGCAATATATCATTTGATTGACTGGATTCACTAACATCGATACTATTTTTATCAGCTGGTAGATGACCCAAAATAGCATGACAAATAATCGGTCGTAAACTAGGTACTTGATCACAGAAACGACGTAACCAACGAATAAATAATGTGAAGAAAACTTCCATTGAATAAACATCCGTATGTTGAGCTGCACAATTTATTG]

[+] EMBL CD146932             [TAAAACACGAGGTTCTGGAAGGACACCATTTATTGGATTCATACTAGTTGATGATATTGTAACATTGTTAATATAAGATCCAGTTGATGAACCCCATTCGAATGGATTTAAACGTCTAAGTAGGTCAAGTACAGCACTAACCCATGATACATTTGTATCAGCATTGAAATTAGATATAACTAATTCTTCTTGAATATCAGCAGGTATATTTTGATTATTTGTTTGTGAATAGAAATCGGGTAAAACAATTGAATTCACTTGAAATGCACTAGTTAATCGGGAAATTAATCGTGTCAAAATATTATTCTGCTCTAAAAGTTGACGTGCCAAACTGATAACGGTGTAAAATTGACAACTTAAACCACACAGACTGTCTCCGACTAAATGATCATCATAAATATGATTTTGAATTAATGATGAATATGATCTGGTAAATTTAATTGCAAATACACATCGATAAAAGTTATCTTTTAAGAGTACACTCATAATAAGACGTAACATTTCTTGTCGAACAGATCTCCATGTTAAACTATGACGTTCCAATATATGATTTAAAAATGAATCTTCTTTAACAGTTTCTCCGGGC                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD083346             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ctgCTGCTCTAAAAGTTGACGTGCCAAACTGATAACGGTGTAAAATTGACAACTTAAACCACACAGACTGTCTCCGACTAAATGATCATCATAAATATGATTTTGAATTAATGATGAATATGATCTGGTAAATTTAATTGCAAATACACATCGATAAAAGTTATCTTTTAAGAGTACACTCATAATAAGACGTAACATTTCTTGTCGAACAGATCTCCATGTTAAACTATGACGTTCCAATATATGATTTAAAAATGAATCTTCTTTAACAGTTTCTCCGGGCAGTAATATTGGCAATATATCATTTGATTGACTGGATTCACTAACATCGATACTATTTTTATCAGCTGGTAGATGACCCAAAATAGCATGACAAATAATCGGTCGTAAACTAGGTACTTGATCACAGAAACGACGTAACCAACGAATAAATAATGTGAAGAAAACTTCCATTGAATAAACATCCGTATGTTGAGCTGCACAATTTATTG]
[+] EMBL CD163499             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACGTGCCAAACTGATAACGGTGTAAAATTGACAACTTAAACCACACAGACTGTCTCCGACTAAATGATCATCATAAATATGATTTTGAATTAATGATGAATATGATCTGGTAAATTTAATTGCAAATACACATCGATAAAAGTTATCTTTTAAGAGTACACTCATAATAAGACGTAACATTTCTTGTCGAACAGATCTCCATGTTAAACTATGACGTTCCAATATATGATTTAAAAATGAATCTTCTTTAACAGTTTCTCCGGGCAGTAATATTGGCAATATATCATTTGATTGACTGGATTCACTAACATCGATACTATTTTTATCAGCTGGTAGATGACCCAAAATAGCATGACAAATAATCGGTCGTAAACTAGGTACTTGATCACAGAAACGACGTAACCAACGAATAAATAATGTGAAGAAAACTTCCATTGAATAAA                              ]




>consensus_5986#0
TAAAACACGAGGTTCTGGAAGGACACCATTTATTGGATTCATACTAGTTGATGATATTGT
AACATTGTTAATATAAGATCCAGTTGATGAACCCCATTCGAATGGATTTAAACGTCTAAG
TAGGTCAAGTACAGCACTAACCCATGATACATTTGTATCAGCATTGAAATTAGATATAAC
TAATTCTTCTTGAATATCAGCAGGTATATTTTGATTATTTGTTTGTGAATAGAAATCGGG
TAAAACAATTGAATTCACTTGAAATGCACTAGTTAATCGGGAAATTAATCGTGTCAAAAT
ATTATTCTGCTCTAAAAGTTGACGTGCCAAACTGATAACGGTGTAAAATTGACAACTTAA
ACCACACAGACTGTCTCCGACTAAATGATCATCATAAATATGATTTTGAATTAATGATGA
ATATGATCTGGTAAATTTAATTGCAAATACACATCGATAAAAGTTATCTTTTAAGAGTAC
ACTCATAATAAGACGTAACATTTCTTGTCGAACAGATCTCCATGTTAAACTATGACGTTC
CAATATATGATTTAAAAATGAATCTTCTTTAACAGTTTCTCCGGGCAGTAATATTGGCAA
TATATCATTTGATTGACTGGATTCACTAACATCGATACTATTTTTATCAGCTGGTAGATG
ACCCAAAATAGCATGACAAATAATCGGTCGTAAACTAGGTACTTGATCACAGAAACGACG
TAACCAACGAATAAATAATGTGAAGAAAACTTCCATTGAATAAACATCCGTATGTTGAGC
TGCACAATTTATTG

clustalw multiple alignements is not computed in this case