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Schistosoma mansoni
cluster # 6002 cluster # 6002       Sequences # 3       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6002#0 length = 1160 sequences # 3  
consensusID : consensus_6002#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1160
fasta sequence 
                              [AATGTTTTGATGGACAGCGAAGGTCATATTAAACTAACTGATTATGGAATGTGTAAAGAAGGAATCATCGGAGATATGACTACAACTACATTTTGTGGTACACCGAATTATATTGCTCCTGAAATACTGAAAGGAGAAAGTTATAGTTTCAGTGTTGACTGGTGGGCTTTAGGCGTACTTATGTTTGAGATGTTAGCTGGTCGATCTCCTTGGGAAGGTGTTGGACAGTCAGCTAATCCAGATCAAAATACTGAGGATTATTTATTTCAAATCATTCTCAGTCGTCCAATTCGTTTTCCACGTTCTATTTCTGTTCGTGCAACTAGCATACTCAATGCATTTCTCCAAAAGGTGCCAACTGAACGGCTTGGATGTGCGCCAAATTCAAGTTTTGGTGATATTATGGAGCATGGATTTTTCAAACCAATCGATTGGGTAGCTTTAGAAAGGAAGGAAGTTCATC-CTCCTTATCGTCCAACATGTGGAGGCGATAGAGATCTGATACATTTCGACCCTGCATTCACCGATGAACCTGTAGTGCTTACACCAGATAACGAGGCAGTGATGTCACGTATGGATCAAACAGAATTCGATGGTTTCGAATATGTGAATCCTTTGCTCATGTCGTTAGACGAACAAGTTTAGTTGGGATTTTCGTTCTCTCTTCAATTCTCTTCCCCAATAACTTGTGTTAATCTACCTACGATCTGTGTCTTCTTTTTTTTTATCACTTGTATTCAGTACTGCCACCATATCTTTTGAAAACTTAATAAGTAGTATTTTATATTAAATTTCTCTCTTATAATTTACTGTAAACATTCCATATGATTCTACTAGCAAAATAAAAAAAAATTGTTTAAATCATTTACCAACAGTTCAATGTTAAATTAACTCAAAAAAAAAACATATCAAATATTAAAATATTTTCACTTTTATTGATTTTAGGGTATAATTCTTGAATTGTTTTTTTTATTAAAAAAAAATATTGCTTACTTCGAAGTTTATACTATTTTAAGCACACACACACACATATATATAAATATTTTTTAGGAAAATTCATTTTGTTTGTTTATTACCAAACCAGCTTACTTCATGGCTCCGTGTTCTTTTTGTTTTTGATGAACAAACTTGTTTGATTTTTTTCTCTCAATAAATGCTGA]

[+] EMBL CD082822             [AATGTTTTGATGGACAGCGAAGGTCATATTAAACTAACTGATTATGGAATGTGTAAAGAAGGAATCATCGGAGATATGACTACAACTACATTTTGTGGTACACCGAATTATATTGCTCCTGAAATACTGAAAGGAGAAAGTTATAGTTTCAGTGTTGACTGGTGGGCTTTAGGCGTACTTATGTTTGAGATGTTAGCTGGTCGATCTCCTTGGGAAGGTGTTGGACAGTCAGCTAATCCAGATCAAAATACTGAGGATTATTTATTTCAAATCATTCTCAGTCGTCCAATTCGTTTTCCACGTTCTATTTCTGTTCGTGCAACTAGCATACTCAATGCATTTCTCCAAAAGGTGCCAACTGAACGGCTTGGATGTGCGCCAAATTCAAGTTTTGGTGATATTATGGAGCATGGATTTTTCAAACCAATCGATTGGGTAGCTTTAGAAAGGAAGGAAGTTCATC CTCCTTATCGTCCAACATGTGGAGGCGATAGAGATCTGATACATTTCGACCCTGCATTCACCGATGAACCTGTAGTGCTTACACCAGATAACGAGGCAGTGATGTCACGTATGGATCANACAGAATTCGATGGTTTCGAATATGTGAATCCTTTGCTCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD084370             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CTCAATGCATTTCTCCAAAAGGTGCCAACTGAACGGCTTGGATGTGCGCCAAATTCAAGTTTTGGTGATATTATGGAGCATGGATTTTTCAAACCAATCGATTGGGTAGCTTTAGAAAGGAAGGAAGTTCATCNCTCCTTATCGTCCAACATGTGGAGGCGATAGAGATCTGATACATTTCGACCCTGCATTCACCGATGAACCTGTAGTGCTTACACCAGATAACGAGGCAGTGATGTCACGTATGGATCAAACAGAATTCGATGGTTTCGAATATGTGAATCCTTTGCTCATGTCGTTAGACGAACAAGTTTAGTTGGGATTTTCGTTCTCTCTTCAATTCTCTTCCCCAATAACTTGTGTTAATCTACCTACGATCTGTGTCTTCTTTTTTTTTATCACTTGTATTCAGTACTGCCACCATATCTTTTGAAAACTTAATAAGTAGTATTTTATATTAAATTTCTCTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD076411             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CAGTGATGTCACGTATGGATCAAACAGAATTCGATGGTTTCGAATATGTGAATCCTTTGCTCATGTCGTTAGACGAACAAGTTTAGTTGGGATTTTCGTTCTCTCCTCAATTCTCTTCCCCAATAACTTGTGTTAATCTACCTACGATCTGTGTCTTC TTTTTTTTATCACTTCTATTCAGTACTACCCCCATATCTATTGAAAACTTAATAAGTAGTATTTTATATTAAATTTTTTTTTTATAATTTACTGTAAACATTCCATATGATTCTACTAGCAAAATAAAAAAAAATTGTTTAAATCATTTACCAACAGTTCAATGTTAAATTAACTCAAAAAAAAAACATATCAAATATTAAAATATTTTCACTTTTATTGATTTTAGGGTATAATTCTTGAATTGTTTTTTTTATTAAAAAAAAATATTGCTTACTTCGAAGTTTATACTATTTTAAGCACACACACACACATATATATAAATATTTTTTAGGAAAATTCATTTTGTTTGTTTATTACCAAACCAGCTTACTTCATGGCTCCGTGTTCTTTTTGTTTTTGATGAACAAACTTGTTTGATTTTTTTCTCTCAATAAATGCTGA]




>consensus_6002#0
AATGTTTTGATGGACAGCGAAGGTCATATTAAACTAACTGATTATGGAATGTGTAAAGAA
GGAATCATCGGAGATATGACTACAACTACATTTTGTGGTACACCGAATTATATTGCTCCT
GAAATACTGAAAGGAGAAAGTTATAGTTTCAGTGTTGACTGGTGGGCTTTAGGCGTACTT
ATGTTTGAGATGTTAGCTGGTCGATCTCCTTGGGAAGGTGTTGGACAGTCAGCTAATCCA
GATCAAAATACTGAGGATTATTTATTTCAAATCATTCTCAGTCGTCCAATTCGTTTTCCA
CGTTCTATTTCTGTTCGTGCAACTAGCATACTCAATGCATTTCTCCAAAAGGTGCCAACT
GAACGGCTTGGATGTGCGCCAAATTCAAGTTTTGGTGATATTATGGAGCATGGATTTTTC
AAACCAATCGATTGGGTAGCTTTAGAAAGGAAGGAAGTTCATCCTCCTTATCGTCCAACA
TGTGGAGGCGATAGAGATCTGATACATTTCGACCCTGCATTCACCGATGAACCTGTAGTG
CTTACACCAGATAACGAGGCAGTGATGTCACGTATGGATCAAACAGAATTCGATGGTTTC
GAATATGTGAATCCTTTGCTCATGTCGTTAGACGAACAAGTTTAGTTGGGATTTTCGTTC
TCTCTTCAATTCTCTTCCCCAATAACTTGTGTTAATCTACCTACGATCTGTGTCTTCTTT
TTTTTTATCACTTGTATTCAGTACTGCCACCATATCTTTTGAAAACTTAATAAGTAGTAT
TTTATATTAAATTTCTCTCTTATAATTTACTGTAAACATTCCATATGATTCTACTAGCAA
AATAAAAAAAAATTGTTTAAATCATTTACCAACAGTTCAATGTTAAATTAACTCAAAAAA
AAAACATATCAAATATTAAAATATTTTCACTTTTATTGATTTTAGGGTATAATTCTTGAA
TTGTTTTTTTTATTAAAAAAAAATATTGCTTACTTCGAAGTTTATACTATTTTAAGCACA
CACACACACATATATATAAATATTTTTTAGGAAAATTCATTTTGTTTGTTTATTACCAAA
CCAGCTTACTTCATGGCTCCGTGTTCTTTTTGTTTTTGATGAACAAACTTGTTTGATTTT
TTTCTCTCAATAAATGCTGA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)