cluster # 6006

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Schistosoma mansoni
cluster # 6006 cluster # 6006 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6006#0 length = 628 sequences # 3

consensusID : consensus_6006#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 628
fasta sequence

                              [TAATTAATATTGTTTAAAACAATATGATATAGATTTGTACAAAAAAATTTAAATTNGTTCATTTATAGCTAAAGCAATTTGAATTCAAGCAACAACAAAAACAAATGAAAGAAGATATTGGTTTGTTCTTCTTTTTTTTGAAGTACATAAATGAGTAGTATATTTCATGCTTGGAAACTGTTTATATATGTGTATGTATATATGTATGTAGTTTAGCTTAATGTTTCAGCTTTCATGATAGTGAGTATGTCTTTGTGTGTGGGGGTGTGTGTGCGT--GTGTGTGTGTGTGTGTATGAGAGATAGAGAGAGAACAGTATATATGCTTTATAAGTAAATAAGTAGTCAAAAATATTTTGATAAATATTTGTTCACTTAAACCAGTAACCCCTCAAAAAAGGTAGAGATTAAACAAACATAAATATAAATATAACTATCACTTAAGCAACCCATATCTATATATTTATATATATATATAGNCCTTAGAAAAAAAGATTTATAGGCTTCTATAGAAAAACATCATTACATCAACTGACTTATTATCATTATTACTTATAGAATTAAGTAATATATATCAATCAAGTTCAATTATAGAATAAAACTATTCACTGAATAGATATTTATCATTTAA]

[+] EMBL CD075899             [TAATTAATATTGTTTAAAACAATATGATATAGATTTGTACAAAAAAATTTAAATTCGTTCATTTATAGCTAAAGCAATTTGAATTCAAGCAACAACAAAAACAAATGAAAGAAGATATTGGTTTGTTCTTCTTTTTTTTGAAGTACATAAATGAGTAGTATATTTCATGCTTGGAAACTGTTTATATATGTGTATGTATATATGTATGTAGTTTAGCTTAATGTTTCAGCTTTCATGATAGTGAGTATGTCTTTGTGTGTGGGGGTGTGTGTGCGTGCGTGCGTGTGTGTGTGTATGAGAGATAGAGAGAGAACAGTATATATGCTTTATAAGTAAATAAGTAGTCAAAAATATTTTGATAAATATTTGTTCACTTAAACCAGTAACCCCTCAAAAAAGGTAGAGATTAAACAAACATAAATATAAATATAACTATCACTTAAGCAACCCATATCTATATATTTATATATATATATAGNCCTTAGAAAAAAAGATTTATAGGCTTCTATAGAAAAACATCATTACATCAACTGACTTATTATCATTATTACTTATAGAATTAAGTAATATATATCAATCAAGTTCAATTATAGAATAAAACTATTCACTGAATAGATATTTATCATTTAA]
[-] EMBL AI111110             [ AATTAATATTGTTTAAAACAATATGATATAGATTTGTACAAAAAAATTTAAATTNGTTNATTTATAGCTAAAGCAATTTGAATTCAAGCAACAACAAAAACAAATGAAAGNAGATATTGGTTTGTTCTTCTTTTTTTTGAAGTACATAAATGAGTAGTATATTTCATGCTTGGAAACNGTTTATATATGNGTATGTATATATGTATGTAGTTTAGCTTAATGTTTCAGCTTTCATGATAGTGAGTATGTNTTTGTGTGTGGGGGTGTGTGTGCGT  GTGTGTGTGTGTGTGTATGAGAGATAGAGAGAGAACAGTATATATGCTTTATAAGTAAATAAGTAGTCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL AI111044             [ AATTAATATTGTTTAAAACAATATGATATAGATTTGTACAAAAAAATTTAAATTNGTTCATTTATAGCTAAAGCAATTTGAATTCAAGCAACAACAAAAACAAATGAAAGAAGATATTGGTTTGTTCTTNTTTTTTTTGAAGTACATAAATGAGTAGTATATTTCATGCTTGGAAACTGTTTATATATGTGTATGTATATATGTATGTAGTTTAGCTTAATGTTTCAGCTTTCATGATAGTGAGTATGTCTTTGTGTGTGGGGGTGTGTGTGCGT  GTGTGTGTGTGTGTGTATGAGAGATAGAGAGAGAACAGTATATATGCTTTATAAGTAAATAAGTAGTCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]




>consensus_6006#0
TAATTAATATTGTTTAAAACAATATGATATAGATTTGTACAAAAAAATTTAAATTNGTTC
ATTTATAGCTAAAGCAATTTGAATTCAAGCAACAACAAAAACAAATGAAAGAAGATATTG
GTTTGTTCTTCTTTTTTTTGAAGTACATAAATGAGTAGTATATTTCATGCTTGGAAACTG
TTTATATATGTGTATGTATATATGTATGTAGTTTAGCTTAATGTTTCAGCTTTCATGATA
GTGAGTATGTCTTTGTGTGTGGGGGTGTGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGAGAGA
TAGAGAGAGAACAGTATATATGCTTTATAAGTAAATAAGTAGTCAAAAATATTTTGATAA
ATATTTGTTCACTTAAACCAGTAACCCCTCAAAAAAGGTAGAGATTAAACAAACATAAAT
ATAAATATAACTATCACTTAAGCAACCCATATCTATATATTTATATATATATATAGNCCT
TAGAAAAAAAGATTTATAGGCTTCTATAGAAAAACATCATTACATCAACTGACTTATTAT
CATTATTACTTATAGAATTAAGTAATATATATCAATCAAGTTCAATTATAGAATAAAACT
ATTCACTGAATAGATATTTATCATTTAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case