cluster # 6008

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Schistosoma mansoni
cluster # 6008 cluster # 6008 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_6008#0 length = 954 sequences # 3

consensusID : consensus_6008#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 954
fasta sequence

                              [TCGTCACGAGACCTTACTGTCACCCGCAAGTCTAGGTTTTGTTCTCAAGATAGACCCAAATTACTTAGCCTGTGAAACTGATCGAGCTGAAATGAGAGCGGCCATTCGTTTGTCACGCGAAATATTTGCTCAGCCTGCATTAGCGAAAGAATTTGCAGGCAAAGAACTAGCTCCAGGTGAGGATAAAATATCAGACTCGCAACTGGATGAATTTGTACGTTCTTTTGGTGATAGCGCATACCATCCTTCTTGCACTTGCCGTATGGGTAAAAATCCTGATGGTCGTAAAGCCGGAAGTGATGATGAGATACATAGTGGTTATTTGGGTAATGGAAGAATAGGAGCAGCAGTTACGCAGTCAGACTGTAAAGTATGGGGTATCGACAATCTTCGTATTGTTGATGCAAGTATAATGCCATCAATTGTTTCAGGTAATTTAAATGCACCTGTCATTATGATGGCTGAAAAAGCTGCAGACATTATTGTCAGTTCTCGAGATGGAGTGTCAGTTGTTTTGCCAGCCGATTTAAATCTCTCTTACTGGAAACCACAACATCCTGATAAACAACGTGATGGTATT-CCACTTGTATCTCATC-ATTTGATTTAACTAAGGTGAAGACAAAAAAAATT-GAGTAAATCTATTCAGTATATTAACTCCCTAGTTTTGGGCATACTTTATCACACTCCCAAAATAGTTTCTTTCAAATAAATGCCTTACTTGTATTTCTTTCTTTCTATTTTGTCAAAGACTTCTAAAACTCTTGATATCAGTACTTTNTAAAATTACATTGGCATATTGAAAGTGCTTNATTAT-AAATTACAAGAAATTCTATTGAATTAGATTTTTCCAAATCTCCGTGCTTTTTTTAATACTTTTCTTGTCTTGTTTGCTTAAATTAATAACAGTTTTTATGATTATTTCAATTTCATACAGTAAAATGGTAATAAATAAAG]

[+] EMBL CD082323             [TCGTCACGAGACCTTACTGTCACCCGCAAGTCTAGGTTTTGTTCTCAAGATAGACCCAAATTACTTAGCCTGTGAAACTGATCGAGCTGAAATGAGAGCGGCCATTCGTTTGTCACGCGAAATATTTGCTCAGCCTGCATTAGCGAAAGAATTTGCAGGCAAAGAACTAGCTCCAGGTGAGGATAAAATATCAGACTCGCAACTGGATGAATTTGTACGTTCTTTTGGTGATAGCGCATACCATCCTTCTTGCACTTGCCGTATGGGTAAAAATCCTGATGGTCGTAAAGCCGGAAGTGATGATGAGATACATAGTGGTTATTTGGGTAATGGAAGAATAGGAGCAGCAGTTACGCAGTCAGACTGTAAAGTATGGGGTATCGACAATCTTCGTATTGTTGATGCAAGTATAATGCCATCAATTGTTTCAGGTAATTTAAATGCACCTGTCATTATGATGGCTGAAAAAGCTGCAGACATTATTGTCAGTTCTCGAGATGGAGTGTCAGTTGTTTTGCCAGCCGATTTAAATCTCTCTTACTGGAAACCACAACATCCTGATAAACAACGTGATGGTATT CCACTTGTATCTCATC ATTTGATTTAACTAAGGTGAAGAC AAAAAAATT GAGTAAATCTATTCAGTATATTAACTCCCTAGTTNTGGGCATACTTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL AI976140             [                                                                                                                                                                                                                                                      TTCTTGCACTTGCCGTATGGGTAAAAATCCTGATGGTCGTAAAGCCGGAAGTGATGATGAGATACATAGTGGTTATTTGGGTAATGGAAAAATAGGAGCAGCAGTTACGCAGTCAGACTGTAAAGTATGGGGTATCGACAATCTTCGTATTGTTGATGCAAGTATAATGCCATCAATTGTTTCAGGTAATTTAAATGCACCTGTCATTATGATGGCTGAAAAAGCTGCAGACATTATTGTCAGTTCTCGAGATGGAGTGTCAGTTGTTTTGCCAGCCGATTTAAATCTCTCTTACTGGAAACCACAACATCCTGATAAACAACGTGATGGTATT CCACTTGTATCTCATC ATTTGATTTAACTAAGGTGAAGACAAAAAAAATT GAGTAAATCTATTCAGTATATTAACTCCCTAGTTTTGGGCATACTTTATCACACTCCCAAAATAGTTTCTTTCAAATAAATGCCTTACTTGTATTTCTTTCTTTCTATTTTGTCAAAGACTTCTAAAACTCTTGATATCAGTACTTTNTAAAATTACATTGGCATATTGAAAGTGCTTNATTAT AAATTACAAGAAATTCTA                                                                                                                          ]
[-] EMBL AA999375             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aacCGTGATGGTATTCCCACTTGTATCTCATCAATTTGATTTAACTAAGGTGAGGACAAAAAAAATTGGAGTAAATCTATTCAGTATATTAACTCCCTAGTTTTGGGCATACTTTATCACACTCCCAAAATAGTTTCTTTCAAATAAATGCCTTACTTGTATTTCTTTCTTTCTATTTTGTCAAAGACTTCTAAAAAACTTGATATCAGTACTTTTTAAAATTACATTGGCATATTGAAAGTGCTT ATTATAAAATTACAAGAAATTCTATTGAATTAGATTTTTCCAAATCTCCGTGCTTTTTTTAATACTTTTCTTGTCTTGTTTGCTTAAATTAATAACAGTTTTTATGATTATTTCAATTTCATACAGTAAAATGGTAATAAATAAAG]




>consensus_6008#0
TCGTCACGAGACCTTACTGTCACCCGCAAGTCTAGGTTTTGTTCTCAAGATAGACCCAAA
TTACTTAGCCTGTGAAACTGATCGAGCTGAAATGAGAGCGGCCATTCGTTTGTCACGCGA
AATATTTGCTCAGCCTGCATTAGCGAAAGAATTTGCAGGCAAAGAACTAGCTCCAGGTGA
GGATAAAATATCAGACTCGCAACTGGATGAATTTGTACGTTCTTTTGGTGATAGCGCATA
CCATCCTTCTTGCACTTGCCGTATGGGTAAAAATCCTGATGGTCGTAAAGCCGGAAGTGA
TGATGAGATACATAGTGGTTATTTGGGTAATGGAAGAATAGGAGCAGCAGTTACGCAGTC
AGACTGTAAAGTATGGGGTATCGACAATCTTCGTATTGTTGATGCAAGTATAATGCCATC
AATTGTTTCAGGTAATTTAAATGCACCTGTCATTATGATGGCTGAAAAAGCTGCAGACAT
TATTGTCAGTTCTCGAGATGGAGTGTCAGTTGTTTTGCCAGCCGATTTAAATCTCTCTTA
CTGGAAACCACAACATCCTGATAAACAACGTGATGGTATTCCACTTGTATCTCATCATTT
GATTTAACTAAGGTGAAGACAAAAAAAATTGAGTAAATCTATTCAGTATATTAACTCCCT
AGTTTTGGGCATACTTTATCACACTCCCAAAATAGTTTCTTTCAAATAAATGCCTTACTT
GTATTTCTTTCTTTCTATTTTGTCAAAGACTTCTAAAACTCTTGATATCAGTACTTTNTA
AAATTACATTGGCATATTGAAAGTGCTTNATTATAAATTACAAGAAATTCTATTGAATTA
GATTTTTCCAAATCTCCGTGCTTTTTTTAATACTTTTCTTGTCTTGTTTGCTTAAATTAA
TAACAGTTTTTATGATTATTTCAATTTCATACAGTAAAATGGTAATAAATAAAG

clustalw multiple alignements is not computed in this case