cluster # 6010

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Schistosoma mansoni
cluster # 6010 cluster # 6010 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6010#0 length = 739 sequences # 4

consensusID : consensus_6010#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 739
fasta sequence

                              [GAACCAACATTGGGTTATAGTAGACGTGGCTGGTTTATACATCCATTCGATAATAATCCATGGTGGACATCCATTGTTGCCATCGGACCATCATTACTGGCAGTTATTTTAATTTTTATGGATCAACAAATTACAGCAGTTATTGTGAATCGACGTGAGCATAAATTAAAGAAAGGAGCTGGTTACCATTTAGATTTACTTGTTGTCTCAGTTACTATATTAAGTAATTCAATTCTT-GGAATCCCATGGTTTGTTGCAGCAACTGTCCTGTCGATTAATCATGTTTTATCATTGAAAAAAGAATCCGAAACAAATGCTCCTGGTGAACGACCAGTTTATTTAGGCTGTAGAGAACAACGTGTCACTGGAGTATTGATTTTCCTATTTATTGGTTTATCTGTATTCATGACACCCCTATTATCACGTATTCCAATGCCTGTACTGTATGGAATATTTCTATTCAT-GGTATATCATCTATGCGTGGCATTCAAATGTTTGAACGTCTTAGTTTACTATTTATGCCGGTTAAATATCAGCCAGACTATCCGTATTTGAGACATGTTTCTCTACGTCGAGTTCATTTATTCACGATAATACAAGTTGCTTGTTTGGTTATGCTATGGGTTATTAAATCCATTGAAGTACTTGCTATTCTCTTCCCTAATATGGTTTTAGCCATGTGTTTTATACGTAAAGGATTAGATTTTATATTTACTCAAGAAGAATTAAAATGGTTAGA]

[+] EMBL CD113130             [GAACCAACATTGGGTTATAGTAGACGTGGCTGGTTTATACATCCATTCGATAATAATCCATGGTGGACATCCATTGTTGCCATCGGACCATCATTACTGGCAGTTATTTTAATTTTTATGGATCAACAAATTACAGCAGTTATTGTGAATCGACGTGAGCATAAATTAAAGAAAGGAGCTGGTTACCATTTAGATTTACTTGTTGTCTCAGTTACTATATTAAGTAATTCAATTCTT GGAATCCCATGGTTTGTTGCAGCAACTGTCCTGTCGATTAATCATGTTTTATCATTGAAAAAAGAATCCGAAACAAATGCTCCTGGTGAACGACCAGTTTATTTAGGCTGTAGAGAACAACGTGTCACTGGAGTATTGATTTTCCTATTTATTGGTTTATCTGTATTCATGACACCCCTATTATCACGTATTCCAATGCCTGTACTGTATGGAATATTTCTATTCAT GGTATATCATCTATGCGTGGCATTCAAATGTTTGAACGTCTTAGTTTACTATTTATGCCGGTTAAATATCAGCCAGACTATCCGTATTTGAGACATGTTTCTCTACGTCGAGTTCATTTATTCACGATAATAC                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD196288             [                                 aatacgCATCCATTCGATAATAATCCATGGTGGACATCCATTGTTGCCATCGGACCATCATTACTGGCAGTTATTTTAATTTTTATGGATCAACAAATTACAGCAGTTATTGTGAATCGACGTGAGCATAAATTAAAGAAAGGAGCTGGTTACCATTTAGATTTACTTGTTGTCTCAGTTACTATATTAAGTAATTCAATTCTT GGAATCCCATGGTTTGTTGCAGCAACTGTCCTGTCGATTAATCATGTTTTATCATTGAAAAAAGAATCCGAAACAAATGCTCCTGGTGAACGACCAGTTTATTTAGGCTGTAGAGAAC ACGTGTCACTGGAGTATTGATTTTCCTATTTATTGG TTATCTGTATTCATGAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD194023             [                                                GATAATAATCCATGGTGGACATCCATTGTTGCCATCGGACCATCATTACTGGCAGTTATTTTAATTTTTATGGATCAACAAATTACAGCAGTTATTGTGAATCGACGTGAGCATAAATTAAAGAAAGGAGCTGGTTACCATTTAGATTTACTTGTTGTCTCAGTTACTATATTAAGTAATTCAATTCTT GGAATCCCATGGTTTGTTGCAGCAACTGTCCTGTCGATTAATCATGTTTTATCATTGAAAAAAGAATCCGAAACAAATGCTCCTGGTGAACGACCAGTTTATTTAGGCTGTAGAGAAC ACGTGTCACTGGAGTATTGATTTTCCTATTTATTGGNTTATCTGTATTCATGACACCCCTATTATCACGTATTCCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD200924             [                                                                                                                                                                                       TACCATTTAGATTTACTTGTTGTCTCAGTTACTATATTAGGTAATTCAATTCTTGGGAATCCCATGGTTTGTTGCAGCAACTGTCCTGTCGATTAATCATGTTTTATCATTGAAAAAAGAATCCGAAACAAATGCTCCTGGTGAACGACCAGTTTATTTAGGCTGTAGAGAACAACGTGTCACTGGAGTATTGATTTTCCTATTTATTGGTTTATCTGTGTTCATGACACCCCTATTATCACGTATTCCAATGCCTGTACTGTATGGAATATTTCTATTCATGGGTATATCATCTATGCGTGGCATTCAAATGTTTGAACGTCTTAGTTTACTATTTATGCCGGTTAAATATCAGCCAGACTATCCGTATTTGAGACATGTTTCTCTACGTCGAGTTCATTTATTCACGATAATACAAGTTGCTTGTTTGGTTATGCTATGGGTTATTAAATCCATTGAAGTACTTGCTATTCTCTTCCCTAATATGGTTTTAGCCATGTGTTTTATACGTAAAGGATTAGATTTTATATTTACTCAAGAAGAATTAAAATGGTTAGA]




>consensus_6010#0
GAACCAACATTGGGTTATAGTAGACGTGGCTGGTTTATACATCCATTCGATAATAATCCA
TGGTGGACATCCATTGTTGCCATCGGACCATCATTACTGGCAGTTATTTTAATTTTTATG
GATCAACAAATTACAGCAGTTATTGTGAATCGACGTGAGCATAAATTAAAGAAAGGAGCT
GGTTACCATTTAGATTTACTTGTTGTCTCAGTTACTATATTAAGTAATTCAATTCTTGGA
ATCCCATGGTTTGTTGCAGCAACTGTCCTGTCGATTAATCATGTTTTATCATTGAAAAAA
GAATCCGAAACAAATGCTCCTGGTGAACGACCAGTTTATTTAGGCTGTAGAGAACAACGT
GTCACTGGAGTATTGATTTTCCTATTTATTGGTTTATCTGTATTCATGACACCCCTATTA
TCACGTATTCCAATGCCTGTACTGTATGGAATATTTCTATTCATGGTATATCATCTATGC
GTGGCATTCAAATGTTTGAACGTCTTAGTTTACTATTTATGCCGGTTAAATATCAGCCAG
ACTATCCGTATTTGAGACATGTTTCTCTACGTCGAGTTCATTTATTCACGATAATACAAG
TTGCTTGTTTGGTTATGCTATGGGTTATTAAATCCATTGAAGTACTTGCTATTCTCTTCC
CTAATATGGTTTTAGCCATGTGTTTTATACGTAAAGGATTAGATTTTATATTTACTCAAG
AAGAATTAAAATGGTTAGA

clustalw multiple alignements is not computed in this case