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Schistosoma mansoni
cluster # 6027 cluster # 6027       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6027#0 length = 1055 sequences # 4  

consensusID : consensus_6027#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1055
fasta sequence
                              [TACAGAAAACATTAATGATGTGAATTTTTCGAATCAAAATATTATCCTATTAAAAAGTGATAATTCAACTTTATATTTAACCAGGGATATAGCGGCGGCGATTTCTCGTTACGAAAAATATCATTTCGATAGGATACATTATGTGGTTGAAATCGGACAGCGTTTACACTTTCAACAACCTCAACTATGTTCTCCTTAAAATGGGTTATAATTGGCCCGGTTATATCTATGATCGGTGATGATGTTTATGATAATACTGATAATGATCAATGTAGTCAATGTGCTCGTAATCTTCTACATATTCCATTCGGTCGAATTATGGGGATGAGTACTAGGAAAGGTGAAGGTTTATTTCTATTGGATATTTTAAATAATGCTCAACAATTTATGCTGAATCGAATGAAAGGTTCACAAAATACCCGACTAACTCAAAATGAATCAGTTAATCCGTCATTGTTATGTCAAAATGAAATAGCTGATCATTTAGGTGTAACATGTTTGGTAACAACAATGTTTGCCTATCCACGTCAAAAACCAATTAATTTGCAGACATTTCTTGGTTTACCAGTGACATCAACACCAACAATGAAATGTAGTCATTTGTTGAAATCATCACCTGTAAGCGAATTATGCGGATTAACTCTGCAATATTGTCATGCAAGACTGTGCAGCCTAGAATCTCGTTCAATTTCCTCCGGTCTATTTCCATTCAAGGTTAATAACAGTGATCCAACATCAATGGCGTTTGACACAGATCAACTTATTCATGTATTTGATCAATTTACAGAATGGCCTTCAACGACAGTTAATGAAAAATCTTTTGTGAAATTGGCTGATCAGTTGTGCAGATTTTCTACTGTGCTTCATACTGCTTATTCAAAATACGAACCACATTACGTACTACAATATGCATTACAACTTACTTCTGATGTAAACTCAGCTTGGAAGCATTTGCCAGTTTTGACATGCACAAATAAAGAAGATCAACTAATACGTCTATTCATCTTTCTAGCGTCTAGAAATGTACTTGCCTCATGTGTTACGTTTAATGGGAA]

[+] EMBL BF936192             [TACAGAAAACATTAATGATGTGAATTTTTCGAATCAAAATATTATCCTATTAAAAAGTGATAATTCAACTTTATATTTAACCAGGGATATAGCGGCGGCGATTTCTCGTTACGAAAAATATCATTTCGATAGGATACATTATGTGGTTGAAATCGGACAGCGTTTACACTTTCAACAACCTCAACTATGTTCTCCTTAAAATGGGTTATAATTGGCCCGGTTATATCTATGATCGGTGATGATGTTTATGATAATACTGATAATGATCAATGTAGTCAATGTGCTCGTAATCTTCTACATATTCCATTCGGTCGAATTATGGGGATGAGTACTAGGAAAGGTGAAGGTTTATTTCTATTGGATATTTTAAATAATGCTCAACAATTTATGCTGAATCGAATGAAAGGTTCACAAAATACCCGACTAACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD113553             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATGGGGATGAGTACTAGGAAAGGTGAAGGTTTATTTCTATTGGATATTTTAAATAATGCTCAACAATTTATGCTGAATCGAATGAAAGGTTCACAAAATACCCGACTAACTCAAAATGAATCAGTTAATCCGTCATTGTTATGTCAAAATGAAATAGCTGATCATTTAGGTGTAACATGTTTGGTAACAACAATGTTTGCCTATCCACGTCAAAAACCAATTAATTTGCAGACATTTCTTGGTTTACCAGTGACATCAACACCAACAATGAAAAGTAGTCGTTTGTTGAAATCATCACCTGTAAGCGAATTATGCGGATTAACTCTGCAATATTGTCATGCAAGACTGTGCAGCCTAGAATCTCGTTCAATTTCCTCCGGTCTATTTCCATTCAGGGTTAATAACAGTGATCCAACATCAATGGCGTTTGACACAGATCAACTTATTCATGTATTTGATCAATTTACAGAATGGCCTTCAACGACAGTTAATGAAAAATCTTTTGTGAAATTGGCTGATCAGTTGTGC                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL BF936406             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CAGTTAATCCGTCATTGTTATGTCAAAATGAAATAGCTGATCATTTAGGTGTAACATGTTTGGTAACAACAATGTTTGCCTATCCACGTCAAAAACCAATTAATTTGCAGACATTTCTTGGTTTACCAGTGACATCAACACCAACAATGAAATGTAGTCATTTGTTGAAATCATCACCTGTAAGCGAATTATGCGGATTAACTCTGCAATATTGTCATGCAAGACTGTGCAGCCTAGAATCTCGTTCAATTTCCTCCGGTCTATTTCCATTCAAGGTTAATAACAGTGATCCAACATCAATGGCGTTTGACACAGATCAACTTATTCATGTATTTGATCAATTTACAGAATGGCCTTCAACGACAGTTAATGAAAAATCTTTTGTGAAATTGGCTGATCAGTTGTGCAGATTTTCTACTGTGCTTCATACTGCTTATTCAAAATACGAACCACATTACGTACTACAATATGCATTACAACTTACTTCTGATGTAAACTCAGCTTGGAAGCATTTGCCAGTTTTGACATGCACAAATAAAGAAGATCAACTAATACGTCTATTCATCTTTCTAGCGTCTAGAAATGTACTTGCCTCATGTGTTACGTTTAATGGGAA]
[+] EMBL AI975574             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CAGTTAATCCGTCATTGTTATGTCAAAATGAAATAGCTGATCATTTAGGTGTAACATGTTTGGTAACAACAATGTTTGCCTATCCACGTCAAAAACCAATTAATTTGCAGACATTTCTTGGTTTACCAGTGACATCAACACCAACAATGAAATGTAGTCATTTGTTGAAATCATCACCTGTAAGCGAATTATGCGGATTAACTCTGCAATATTGTCATGCAAGACTGTGCAGCCTAGAATCTCGTTCAATTTCCTCCGGTCTATTTCCATTCAAGGTTAATAACAGTGATCCAACATCAATGGCGTTTGACACAGATCAACTTATTCATGTATTTGATCAATTTACAGAATGGCCTTCAACGACAGTTAATGAAAAATCTTTTGTGAAATTGGCTGATCAGTTGTGCAGATTTTCTACTGTGCTTCATACTGCTTATTCAAAATACGAACCACATTACGTACTACAATATGCATTACAACTTACTTCTGATGTACACTCAG                                                                                                                   ]


>consensus_6027#0 TACAGAAAACATTAATGATGTGAATTTTTCGAATCAAAATATTATCCTATTAAAAAGTGA TAATTCAACTTTATATTTAACCAGGGATATAGCGGCGGCGATTTCTCGTTACGAAAAATA TCATTTCGATAGGATACATTATGTGGTTGAAATCGGACAGCGTTTACACTTTCAACAACC TCAACTATGTTCTCCTTAAAATGGGTTATAATTGGCCCGGTTATATCTATGATCGGTGAT GATGTTTATGATAATACTGATAATGATCAATGTAGTCAATGTGCTCGTAATCTTCTACAT ATTCCATTCGGTCGAATTATGGGGATGAGTACTAGGAAAGGTGAAGGTTTATTTCTATTG GATATTTTAAATAATGCTCAACAATTTATGCTGAATCGAATGAAAGGTTCACAAAATACC CGACTAACTCAAAATGAATCAGTTAATCCGTCATTGTTATGTCAAAATGAAATAGCTGAT CATTTAGGTGTAACATGTTTGGTAACAACAATGTTTGCCTATCCACGTCAAAAACCAATT AATTTGCAGACATTTCTTGGTTTACCAGTGACATCAACACCAACAATGAAATGTAGTCAT TTGTTGAAATCATCACCTGTAAGCGAATTATGCGGATTAACTCTGCAATATTGTCATGCA AGACTGTGCAGCCTAGAATCTCGTTCAATTTCCTCCGGTCTATTTCCATTCAAGGTTAAT AACAGTGATCCAACATCAATGGCGTTTGACACAGATCAACTTATTCATGTATTTGATCAA TTTACAGAATGGCCTTCAACGACAGTTAATGAAAAATCTTTTGTGAAATTGGCTGATCAG TTGTGCAGATTTTCTACTGTGCTTCATACTGCTTATTCAAAATACGAACCACATTACGTA CTACAATATGCATTACAACTTACTTCTGATGTAAACTCAGCTTGGAAGCATTTGCCAGTT TTGACATGCACAAATAAAGAAGATCAACTAATACGTCTATTCATCTTTCTAGCGTCTAGA AATGTACTTGCCTCATGTGTTACGTTTAATGGGAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)