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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6028#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 641 fasta sequence
[TGACGTGAGTCTCAACGGTGTTTGTTTTTTCCTCTGATATTCTGTAAGTGGCTTGTTGATT-TGCAGATTACAACTGGTATTTAAATGAGTTGTAATCCATTGATGGTCACCTATGTTGTCT-GTCCCCGATGTGTGGGGGTGAAAGCAAACGTGATTGGTCAGTGAGGGTGGCCAAACAGGAACTCAGCTTACGAACTATTTTCCCCCATTTGACAACCGATTCGCTCTATTATGATTGAACTGTTTGCAGTAATCACTCATAGATTGGTTTGGAAGTGGTTTAATTTTTCTCACAGAATTTAATTATGTCACTATAATCTGTATGTATGATGAGT-TTCATTCTTCAAACATCGATTAGTATCAGAATGTGTTCTTTGAGTAAAGCAATTCTGGACATCTGACCTGTTGGTGACAGGGAAATACAGTCAGGCTATTATGAATAACAGAGTTGTATTTACTTGTATGCACCAATGCCGTAGTAGAAGAAACACAATGTTTTCACCCAGCTTTTGTCTTCTATAACTCTGTGTAATTCGGTTGGTTAAATATAGAAGTGTATGTTGATAACTGAATTGGACAGCAACACACGAAAGTCATCACCACTGCTGAACTATTCAAGTAAAGTATCCTGTGCTTTCCAC]
[+] EMBL CD085576 [TGACGTGAGTCTCAACGGTGTTTGTTTTTTCCTCTGATATTCTGTAAGTGGCTTGTTGATT TGCAGATTACAACTGGTATTCAAATGAGTTGTAATCCATTGATGGTCACCTATGTTGTCT GTCCCCGATGTGTGGGGGTGAAAGCAAACGTGATTGGTCAGTGAGGGTGGCCAAACAGGAACTCAGCTTACGAACTATTTTCCCCCATTTGACAACCGATTCGCTCTATTATGATTGAACTGTTTGCAGTAATCACTCATAGATTGGTTTGGAAGTGGTTTAATTTTTCTCACAGAATTTAATTATGTCACTATAATCTGTATGTATGATGAGT TTCATTCTTCAAACATCGATTAGTATCAGAATGTGTTCTTTGAGTAAAGCAATTCTGGACATCTGACCTGTTGGTGACAGGGAAATACAGTCAGGCTATTATGAATAACAGAGTTGTATTTACTTGTATGCACCAATGCCGTAGTAGAAGAAACACAATGTTTGCACCCAGCTTTTGTCTCTTATAACTCTGTGTAATTCGGTTGGTTAAATATAGAAGTGTATGTTGATAACTGAATTGGACAGNCACACACGANAGTCATCACCACTGCTGAACTATTCNAGTA ]
[+] EMBL CD085425 [TGACGTGAGTCTCAGCGGTGTTTGTTTTTTCCTCTGATATTCTGTAAGTGGCTTGTTGATT TGCAGATTACAACTGGTATTTAAATGAGTTGTAATCCATTGATGGTCACCTATGTTGTCT GTCCCCGACGTGTGGGGGTGAAAGCAAACGTGATTGGTCAGTGAGGGTGGCCAAACAGGAACTCAGCTTACGAACTATTTTCCCCCATTTGACAACCGATTCGCTCTATTATGATTGAACTGTTTGCAGTAATCACTCATAGATTGGTTTGGAAGTGGTTTAATTTTTCTCACAGAATTTAATTATGTCACTATAATCTGTATGTATGATGAGTCTTCATTCTTCAAACATCGATTAGTATCAGAATGTGTTCTTTGAGTAAAGCAATTCTGGA ]
[-] EMBL CD085573 [ TGTTGATTNTGCAGATTACAACTGGTATTTAAATGAGTTGTAATCCATTGATGGTCACCTATG TGTCTGGTCNCCGATGTGTGNGGGTGAAAGCAAACGTGATTGGTCAGTGAGGGTGGCCAAACAGGAACTCAGCTTACGAACTATTTTCCCCCATTTGACAACCGATTCGCTCTATTATGATTGAACTGTTTGCAGTAATCACTCATAGATTGGTTTGGAAGTGGTTTAATTTTTCTCACAGAATTTAATTATGTCACTATAATCTGTATGTATGATGAGT TTCATTCTTCAAACATCGATTAGTATCAGAATGTGTTCTTTGAGTAAAGCAATTCTGGACATCTGACCTGTTGGTGACAGGGAAATACAGTCAGGCTATTATGAATAACAGAGTTGTATTTACTTGTATGCACCAATGCCGTAGTAGAAGAAACACAATGTTTTCACCCAGCTTTTGTCTTCTATAACTCTGTGTAATTCGGTTGGTTAAATATAGAAGTGTATGTTGATAACTGAATTGGACAGCAACACACGAAAGTCATCACCACTGCTGAACTATTCAAGTAAAGTATCCTGTGCTTTCCAC]
[-] EMBL CD085596 [ CACCTATGNTGTCT GTCNCCGATGTGTGGGGGTGAAAGCAAACGTGATTGGTCAGTGAGGGTGGCCAAACAGGAACTCAGCTTACGAACTATTTTCCCCCATTTGACAACCGATTCGCTCTATTATGATTGAACTGTTTGCAGTAATCACTCATAGATTGGTTTGGAAGTGGTTTAATTTTTCTCACAGAATTTAATTATGTCACTATAATCTGTATGTATGATGAGT TTCATTCTTCAAACATCGATTAGTATCAGAATGTGTTCTTTGAGTAAAGCAATTCTGGACATCTGACCTGTTGGTGACAGGGAAATACAGTCAGGCTATTATGAATAACAGAGTTGTATTTACTTGTATGCACCAATGCCGTAGTAGAAGAAACACAATGTTTTCACCCAGCTTTTGTCTTCTATAACTCCGTGTAATTCGGTTGGTTAAATATAGAAGTGTATGTTGATAACTGAATTGGACAGCAACACACGAAAGTCATCACCACTGCTGAACTATTCAAGTAAAGTATCCTGTGCTTTCCAC]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||