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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6037#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 786 fasta sequence
[TTAAATAAAGATGATCGTCCAATGCTACTACTTGATCAGTTACGTGAAGAATCAGCTAGAATATCACAATTTACTCGATTCGAATTACGTTTTGTTGAAGATCCCCCTATCAGTCCTAGTGTCTCCTTGTTTGTAGGTAATCTTAAAGAAAATCTATCACAACGATTATATGAACGTGTATTATTAGACAAATTAGGTGAGAAATGTCGTTGGGATTCAATTGAAGTAATATATTATGAAAGTGGTTGTCTCGTTTTAAATTATCACTCAAGTGAAAAAGCTGAACAAGCTTATGAATTACTAAATGAATCTATATTTATGGATAAACCACTGANCTGCTCTACTTCTTCCAACAATTCGTCCACAAAGTTTGCCTAAAGGAATTCAACCACTTTTAGTATTTGTTAATTTAAAATCTGGCGGTTGTCAAGGTGNCGATTTAATTGTTGCTTTTCGTCGATTACTCAATCCATTTCAAGTATTTAACCTTGA-TTATGGTGGTCCTTTACCTGGCCTATATTGCTTTCGTCATTTAGTCTCATATAAGATTCTTGTTTGTGGTGGAGATGGTACAGTAGGGTGGACATTGTCATGTTTGGATATTGTTGGACAGGATGCAGCATGTAACGCTCCTCCTATTGCTCCTCTTCCTCTTGGAACTANTAATGATCTATCTCGTG-TCTTCGATGGGGTTCTGGTTATTCGTCAGCTGATGATCCTCTAACTATTTTAAAGGGATGTATTGCCGCTGAAAAATTGAAGTTANNACGGATGACGTTGATTGTT]
[+] EMBL CD130691 [TTAAATAAAGATGATCGTCCAATGCTACTACTTGATCAGTTACGTGAAGAATCAGCTAGAATATCACAATTTACTCGATTCGAATTACGTTTTGTTGAAGATCCCCCTATCAGTCCTAGTGTCTCCTTGTTTGTAGGTAATCTTAAAGAAAATCTATCACAACGATTATATGAACGTGTATTATTAGACAAATTAGGTGAGAAATGTCGTTGGGATTCAATTGAAGTAATATATTATGAAAGTGGTTGTCTCGTTTTAAATTATCACTCAAGTGAAAAAGCTGAACAAGCTTATGAATTACTAAATGAATCTATATTTATGGATAAACCACTGANCTGCTCTACTTCTTCCAACAATTCGTCCACAAAGTTTGCCTAAAGGAATTCAACCACTTTTAGTATTTGTTAATTTAAAATCTGGCGGTTGTCAAGGTGTCGATTTAATTGTTGCTTTTCGTCGATTACTCAATCCATTTCAAGTATTTAACCTTGATTTATGGTGGTCCTTTACCTGGCCTATATTGCTTTCGTCATTTAGTCTCATATAAGATTCTTGTTTGTGGTGGAGGTGGTACTGTAGGGTGGACATTGTCATGTTTGGATATTGGTGGACAGGATGCANCATGTAACGCTCCTNCTATTGCTCCTCTTCCTCTTGGAACTANTAATGATCTATCTCGTG TCTTCGATGGGGTTCTGGTTATTCGTCAGCTGATGATCCTCTAACTATTTTAAAGGGATGTATTGCCGCTGAAAAATTGAAGTTANNACGGATGACGTTGATTGTT]
[+] EMBL CD195902 [ ATATATTATGAAAGTGGTTGTCTTGTTTTAAATTATCACTCGAGTGAAAAAGCTGAACAAGCTTATGAATTACTAAATGAATCTATATTTATGGATAAACCACTGA CTGCTCTACTTCTTCCAACAATTCGTCCACAAAGTTTGCCTAAAGGAATTCAACCACTTTTAGTATTTGTTAATTTANAATCTGGCGGNTGTCAAGGTGNCGA ]
[-] EMBL CD114002 [ AAAATCTGGCGGTTGTCAAGGTGCCGATTTAATTGTTGCTATTCGTCGATTACTCAATCCATTTCAAGTATTTAACCTTGA TTATGGTGGTCCTTTACCTGGCCGATATAGCTTTCGTCATTTAGTCTCATATAAGATTCTCGTTTGTGGTGGAGATGGTACAGTAGGGTGGACATTGTCATGTTTGGATATTGTTGGACAGGATGCAGCATGTAACGCTCCTCCTATTGCTCCTCTTCCTCTTGGAACTGGTAATGATCTATCTCGTGTTCTTCGATGGGGCTCTGGTTATTCGTCAGCTGATGATCCTATAACTATTTTAAA GGATGTAgt ]
[-] EMBL CD195714 [ TGTTGCTTTTCGTCGATTACTCAATCCATTTCAAGTATTTAACCTTGA TTATGGTGGTCCTTTACCTGGCCTATATTGCTTTCGTCATTTAGTCTCATATAAGATTCTTGTTTGTGGTGGAGATGGTACAGTAGGGTGGACATTGTCATGTTTGGATATTGTTGGACAGGATGCAGCATGTAACGCTCCTCCTATTGCTC ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||