cluster # 6039

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Schistosoma mansoni
cluster # 6039 cluster # 6039 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6039#0 length = 645 sequences # 4

consensusID : consensus_6039#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 645
fasta sequence

                              [TACCAGTTTAACCGCTTTCATTAACTGNTCCTTCAAAATGAGTGCTAGTAGAGAGG-ACCCACCATATCCAAAGTCTACAGAAGTCGATGGTTTCCCGCAACCATATCCCCCTCAATATCCTGATACAGTAATTGCGGAACAGCCTTGTCCAGTAATCACCGATTCACATTTTGCTCCTGGACCAGATCCAGTAAATACCATGTGTCCATACTGTCATAAAGATATAACAACTGTTGTGACCTACAAAATAGGTATATTAACATGGGTGGGATGTTTCGGGA-TTTTTCTAGTTGGAGGAATATTCGGTTGCTGTCTTATACCATTCTGTTGTGATTCCTGTATAGACGCTGATCATCGTTGTCCAGTATGCAACCGTGACTTAGGTTTATACCGTCGCTGTTAGAATCGACATTAAAGCAAAATCAAGTTTATCAGTCAATTTTCATTGACACTACTTTTTTATAAAGATGATATTATCATTCATAAATTTTTATTTAATACATTATCTATGGTGTTAACGATTCAATTTTATTCCGAGGCAAATGAAGTAAAGGGCGATTGAATGTTGAATTTAATCATGGTCATTAAAATTATTTCATGAAACAAAAAACTGTGATTATTGATTTAAATGTAATAATATTTGAG]

[+] EMBL CD082379             [TACCAGTTTAACCGCTTTCATTAACTGNTCCTTCAAAATGAGTGCTAGTAGAGAGG ACCCACCATATCCAAAGTCTACAGAAGTCGATGGTTTCCCGCAACCATATCCCCCTCAATATCCTGATACAGTAATTGCGGAACAGCCTTGTCCAGTAATCACCGATTCACATTTTGCTCCTGGACCATATCCAGTAAATACCATGTGTCCATACTGTCATAAAGATATAACAACTGTTGTGACCTACAAAATAGGTATATTAACATGGGTGGGATGTTTCGGGA TTTTTCTAGTTGGAGGAATATTCGGTTGCTGTCTTATACCATTCTGTTGTGATTCCTGTATAGACGCTGATCATCGTTGTCCAGTATGCAACCGTGACTTAGGTTTATACCGTCGCTGTTAGAATCGACATTAAAGCAAAATCAAGTTTATCAGTCAATTTTCATTGACACTACTTTTTTATAAAGATGATATTATCATTCATAAATTTTTATTTAATACATTATCTATGGTGTTAACGATTCAATTTTATTCCGAGGCAAATGAAGTAAAGGGCGATTGAATGTTGAATTTAATCATGGTCATTAAAATTATTTCATGAAACAAAAAACTGTGATTATTGATTTAAATGTAATAATATTTGA ]
[+] EMBL CD063099             [                                                aAGA AGGAACCCACCATATCCAAAGTCTACAGAAGTCGATGGTTTCCCGCAACCATATCCCCCTCAATATCCTGATACAGTAATTGCGGAACAGCCTTGTCCAGTAATCACCGATTCACATTTTGCTCCTGGACCAGATCCAGTAAATACCATGTGTCCATACTGTCATAAAGATATAACAACTGTTGTGACCTACAAAATAGGTATATTAACATGGGTGGGATGTTTCGGGA TTTTTCTAGTTGGAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD063026             [                                                    GAGG ACCCACCCTATCCAAAGTCTACAGAAGTCGATGGTTTCCCGCAACCATATCCCCCTCAATATCCTGATACAGTAATTGCGGAACAGCCTTGTCCAGTAATCACCGATTCACATTTTGCTCCTGGACCAGATCCAGTAAATACCATGTGTCCATACTGTCATAAAGATATAACAACTGTTGTGACCTACAAAATAGGTATATTAACATGGGTGGGATGTTTCGGGATTTTTTCTAGTTGGAGGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD075980             [                                                                                                              CCTCAATATCCTGATACAGTAATTGCGGAACAGCCTTGTCCAGTAATCACCGATTCACATTTTGCTCCTGGACCAGATCCAGTAAATACCATGTGTCCATACTGTCATAAAGATATAACAACTGTTGTGACCTACAAAATAGGTATATTAACATGGGTGGGATGTTTCGGGA TTTTTCTAGTTGGAGGAATATTCGGTTGCTGTCTTATACCATTCTGTTGTGATTCCTGTATAGACGCTGATCATCGTTGTCCAGTATGCAACCGTGACTTAGGTTTATACCGTCGCTGTTAGAATCGACATTAAAGCAAAATCAAGTTTATCAGTCAATTTTCATTGACACTACTTTTTTATAAAGATGATATTATCATTCATAAATTTTTATTTAATACATTATCTATGGTGTTAACGATTCAATTTTATTCCGAGGCAAATGAAGTAAAGGGCGATTGAATGTTGAATTTAATCATGGTCATTAAAATTATTTCATGAAACAAAAAACTGTGATTATTGATTTAAATGTAATAATATTTGAG]




>consensus_6039#0
TACCAGTTTAACCGCTTTCATTAACTGNTCCTTCAAAATGAGTGCTAGTAGAGAGGACCC
ACCATATCCAAAGTCTACAGAAGTCGATGGTTTCCCGCAACCATATCCCCCTCAATATCC
TGATACAGTAATTGCGGAACAGCCTTGTCCAGTAATCACCGATTCACATTTTGCTCCTGG
ACCAGATCCAGTAAATACCATGTGTCCATACTGTCATAAAGATATAACAACTGTTGTGAC
CTACAAAATAGGTATATTAACATGGGTGGGATGTTTCGGGATTTTTCTAGTTGGAGGAAT
ATTCGGTTGCTGTCTTATACCATTCTGTTGTGATTCCTGTATAGACGCTGATCATCGTTG
TCCAGTATGCAACCGTGACTTAGGTTTATACCGTCGCTGTTAGAATCGACATTAAAGCAA
AATCAAGTTTATCAGTCAATTTTCATTGACACTACTTTTTTATAAAGATGATATTATCAT
TCATAAATTTTTATTTAATACATTATCTATGGTGTTAACGATTCAATTTTATTCCGAGGC
AAATGAAGTAAAGGGCGATTGAATGTTGAATTTAATCATGGTCATTAAAATTATTTCATG
AAACAAAAAACTGTGATTATTGATTTAAATGTAATAATATTTGAG

clustalw multiple alignements is not computed in this case