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Schistosoma mansoni
cluster # 6080 cluster # 6080       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6080#0 length = 1212 sequences # 4  

consensusID : consensus_6080#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1212
fasta sequence
                              [GCGGATGGTAGATCCACACGTTCTAATCCTCGTCATACACGACGTAGCCTAACGATATCAGAGAGATTACGTGCAAAAGGTAGTAGTGGTATTACGTCAGCGTTGGCGGGGGTGACAACTCGTTCAAACAATAATGGTCAAAATGGTATCGATGATGTACGTGCTGCTCAAACAATGTATTTACGACGTAGGCAAGTTAGCTTTGAAGATACTTTATCTCATCTTCCAGTCAGTTTAGATACCCCTCTACCAAATGATTCAAATTGTGAATCAATTCCACCAACTTCATCAAATTCTGATACAAATACCATTGAATAAACAGATCCATCTAGTTCAACAAATACAATAACAAATACTACCTCAAGATTAGAGTCTTCACCTAATGAACAAGGTATAGATCATGTAGATAAAAATCGTCGAATTGGTGAAATAGTTTTAGGCTTAGATATTGCTCCGGGTGAAGAACCACTTCCACAAGGTTGGGAATTAGCTAGAACTGCAAGTGGTCGAAAATTTTTCATTAATCATAATGAACATACTACTACTTGGGATGATCCTAGAGTTATCCGATCAAATAATCAAATAATCAATGGTTCTTTATTAACCCATGAAGCACAACGACATGTCATGAAAGATTTAGGCCCATTACCGCCTGGTTGGGAAGAACGTGTACATAGTAATGGTCGTATTTTCTACATTAATCATAATGCTCGAACTACTCAATGGGAAGATCCTCGACTAGAACGTTTAGGCGGTCCAGCTGTTCCTTATTCAAGAAATTATAAACAGAAATATGATTATTTCCGATCAAGGTTACGAGCTCCACGTGATCCACAAGCTAAATTTGAATTACGTGTTACACGAGCTGGTATATTCGAAGATTCATTCCGTCTAATTTATGGAATAAAAAGACCAGAAGTTCTAATGCATCGATTGTGGATTGAATTTATTGGTGAAAAAGGCTTAGATTATGGTGGTGTACAGCGAGAATGGTTCTTCTTATTATCACGTGAAATGTTTAATCCTTATTATGGTCTATTCGAATATTCAGCCGCTGATAATTATACTCTACAAATTAATCCCCTTTCTGGTATGGCAAATGAAGAACATTTAAAATATTTTAAATTTATTGGACGGGTTGTTGGTATGGCTGTATATCATGGAAAATCAGTTGATGGATTTTTTATTAGACCATTTTATAAAATGATGCTT]

[+] EMBL BG932324             [GCGGATGGTAGATCCACACGTTCTAATCCTCGTCATACACGACGTAGCCTAACGATATCAGAGAGATTACGTGCAAAAGGTAGTAGTGGTATTACGTCAGCGTTGGCGGGGGTGACAACTCGTTCAAACAATAATGGTCAAAATGGTATCGATGATGTACGTGCTGCTCAAACAATGTATTTACGACGTAGGCAAGTTAGCTTTGAAGATACTTTATCTCATCTTCCAGTCAGTTTAGATACCCCTCTAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD115180             [                                                                                                                              AACAATAATGGTCAAAATGGTATCGATGATGTACGTGCTGCTCAAACAATGTATTTACGACGTAGGCAAGTTAGCTTTGAAGATACTTTATCTCATCTTCCAGTCAGTTTAGATACCCCTCTACCAAATGATTCAAATTGTGAATCAATTCCACCAACTTCATCAAATTCTGATACAAATACCATTGAATAAACAGATCCATCTAGTTCAACAAATACAATAACAAATACTACCTCAAGATTAGAGTCTTCACCTAATGAACAAGGTATAGATCATGTAGATAAAAATCGTCGAATTGGTGAAATAGTTTTAGGCTTAGATATTGCTCCGGGTGAAGAACCACTTCCACAAGGTTGGGAATTAGCTAGAACTGCAAGTGGTCGAAAATTTTTCATTAATCATAATGAACATACTACTACTTGGGATGATCCTAGAGTTATCCGATCAAATAATCAAATAATCAATGGTTCTTTATTAACCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD124993             [                                                                                                                                                                             AATGTA TTACGACGTAGGCAAGTTAGCTTTGACTATACTTTATCTCATCTTCCAGTCAGTTTAGATACCCCTCTACCAAATGATTCAGATTGTGAATCAATTCCACCAACTTCATCAAATTCTGATACAAATACCATTGAATTAACAGATCCATCTAGTTCAACAAATACAATAACAAATACTACCTCAAGATTAGAGTCTTCACCTAATGAACAAGGTATAGATCATGTAGATAAAAATCGTCGAATTGGTGAAATAGTTTTAGGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD155230             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TCCTAGAGTTATCCGATCAAATAATCAAATAATCAATGGTTCTTTATTAACCCATGAAGCACAACGACATGTCATGAAAGATTTAGGCCCATTACCGCCTGGTTGGGAAGAACGTGTACATAGTAATGGTCGTATTTTCTACATTAATCATAATGCTCGAACTACTCAATGGGAAGATCCTCGACTAGAACGTTTAGGCGGTCCAGCTGTTCCTTATTCAAGAAATTATAAACAGAAATATGATTATTTCCGATCAAGGTTACGAGCTCCACGTGATCCACAAGCTAAATTTGAATTACGTGTTACACGAGCTGGTATATTCGAAGATTCATTCCGTCTAATTTATGGAATAAAAAGACCAGAAGTTCTAATGCATCGATTGTGGATTGAATTTATTGGTGAAAAAGGCTTAGATTATGGTGGTGTACAGCGAGAATGGTTCTTCTTATTATCACGTGAAATGTTTAATCCTTATTATGGTCTATTCGAATATTCAGCCGCTGATAATTATACTCTACAAATTAATCCCCTTTCTGGTATGGCAAATGAAGAACATTTAAAATATTTTAAATTTATTGGACGGGTTGTTGGTATGGCTGTATATCATGGAAAATCAGTTGATGGATTTTTTATTAGACCATTTTATAAAATGATGCTT]


>consensus_6080#0 GCGGATGGTAGATCCACACGTTCTAATCCTCGTCATACACGACGTAGCCTAACGATATCA GAGAGATTACGTGCAAAAGGTAGTAGTGGTATTACGTCAGCGTTGGCGGGGGTGACAACT CGTTCAAACAATAATGGTCAAAATGGTATCGATGATGTACGTGCTGCTCAAACAATGTAT TTACGACGTAGGCAAGTTAGCTTTGAAGATACTTTATCTCATCTTCCAGTCAGTTTAGAT ACCCCTCTACCAAATGATTCAAATTGTGAATCAATTCCACCAACTTCATCAAATTCTGAT ACAAATACCATTGAATAAACAGATCCATCTAGTTCAACAAATACAATAACAAATACTACC TCAAGATTAGAGTCTTCACCTAATGAACAAGGTATAGATCATGTAGATAAAAATCGTCGA ATTGGTGAAATAGTTTTAGGCTTAGATATTGCTCCGGGTGAAGAACCACTTCCACAAGGT TGGGAATTAGCTAGAACTGCAAGTGGTCGAAAATTTTTCATTAATCATAATGAACATACT ACTACTTGGGATGATCCTAGAGTTATCCGATCAAATAATCAAATAATCAATGGTTCTTTA TTAACCCATGAAGCACAACGACATGTCATGAAAGATTTAGGCCCATTACCGCCTGGTTGG GAAGAACGTGTACATAGTAATGGTCGTATTTTCTACATTAATCATAATGCTCGAACTACT CAATGGGAAGATCCTCGACTAGAACGTTTAGGCGGTCCAGCTGTTCCTTATTCAAGAAAT TATAAACAGAAATATGATTATTTCCGATCAAGGTTACGAGCTCCACGTGATCCACAAGCT AAATTTGAATTACGTGTTACACGAGCTGGTATATTCGAAGATTCATTCCGTCTAATTTAT GGAATAAAAAGACCAGAAGTTCTAATGCATCGATTGTGGATTGAATTTATTGGTGAAAAA GGCTTAGATTATGGTGGTGTACAGCGAGAATGGTTCTTCTTATTATCACGTGAAATGTTT AATCCTTATTATGGTCTATTCGAATATTCAGCCGCTGATAATTATACTCTACAAATTAAT CCCCTTTCTGGTATGGCAAATGAAGAACATTTAAAATATTTTAAATTTATTGGACGGGTT GTTGGTATGGCTGTATATCATGGAAAATCAGTTGATGGATTTTTTATTAGACCATTTTAT AAAATGATGCTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)