cluster # 6124

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Schistosoma mansoni
cluster # 6124 cluster # 6124 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6124#0 length = 545 sequences # 4

consensusID : consensus_6124#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 545
fasta sequence

                              [GAACCACATAAGGGAACTAAAAGCAATCTGTTCAACTCAACATACATATAGATATTTATATTTTATATCGATGGCAAACAAACTTAAAGTGTGCGACAAGTGAGTGAGAATTTAAAAAACATAAAGCACATCCAAGGACAATAATAATAATCGTGAAAATATTAATTGTCAATGTGAAACAATGAAGATGACTAAAGAGACCCACTAGTTCTGAGAAATTTATTGATAACTATATATTGTGTATTTGTGTAGAAGGAAGAATATATAT-AAGTATCCATTTCGTTCTAAATCTTAATTTAAAAGGTAAAATAATTATGATTCTCGCACGGATGGACAGAATAGTTTTTATTATTATTATTATATGACCGGATATAATTATATAAGGAAAAGAAACAACCAAATAATGATTATAATAATTTAATTGTTTAAGGAATAATTTCTCGATTAAATGCATCGGTATACTTTGTTGATTAATTAAATAATTAATTAGTTAATTTAGAATAAAATGCACATTCACAAAACACAATATTTACATAGATTATACA]

[-] EMBL SMAA85766            [GAACCACATAAGGGAACTAAAAGCAATCTGTTCAACTCAACATACATATAGATATTTATATTTTATATCGATGGCAAACAAACTTAAAGTGTGCGACAAGTGAGTGAGAATTTAAAAAACATAAAGCACATCCAAGGACAATAATAATAATCGTGAAAATATTAATTGTCAATGTGAAACAATGAAGATGACTAAAGAGACCCACTAGTTCTGAGAAATTTATTGATAACTATATATTGTGTATTTGTGTAGAAGGAAGAATATATAT AAGTATCCATTTCGTTCTAAATCTTAATTTAAAAGGTAAAATAATTATGATTCTCGCACGGATGGACAGAATAGTTTTT                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL BF936658             [GAACCACATAAGGGAACTAAAAGCAATCTGTTCAACTCAACATACATATAGATATTTATATTTTATATCGATGGCAAACAAACTTAAAGTGTGCGACAAGTGAGTGAGAATTTAAAAAACATAAAGCACATCCAAGGACAATAATAATAATCGTGAAAATATTAATTGTCAATGTGAAACAATGAAGATGACTAAAGAGACCCACTAGTTCTGAGAAATTTATTGATAACTATATATTGTGTATTTGTGTAGAAGGAAGAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD159537             [                                                                                                                                                    tATCGTGAAAATATTAATTGTCAATGTGAAACAATGAAGATGACTAAAGAGACCCACTAGTTCTGAGAAATTTATTGATAACTATATATTGTGTATTTGTGTATAAGGAGGAATATATATCACGTATCCATTTCGTTCTAAATCTTAATTTAAAAGGTAAAATAGTTATGATTCTCGCACGGATGGACAGAATAGTTTTTATTATTATTATTATATGACCGGATATAATTATATAAGGAAAAGAAACAACCAAATAATGATTATAATAATTTAATTGTTTAAGGAATAATTTCTCGATTAAATGCATCGGTATACTTTGTTGATTAATTAAATAATTAATTAGTTAATTTAGAATAAAATGCACATTCA                             ]
[-] EMBL CD159532             [                                                                                                                                                                                       GAAGATGACTAAAGAGACCCACTAGTTCTGAGAAATTTATTGATAACTATATATTGTGTATTTGTGTAGAAGGAAGAATATATAT AAGTATCCATTTCGTTCTAAATCTTAATTTAAAAGGTAAAATAATTATGATTCTCGCACGGATGGACAGAATAGTTTTTATTATTATTATTATATGACCGGATATAATTATATAAGGAAAAGAAACAACCAAATAATGATAATAATAATTTAATTGTTTAAGGAATAATTTCTCGATTAAATGCATCGGTATACTTTGTTGATTAATTAAATAATTAATTAGTTAATTTAGAATAAAATGCACATTCACAAAACACAATATTTACATAGATTATACA]




>consensus_6124#0
GAACCACATAAGGGAACTAAAAGCAATCTGTTCAACTCAACATACATATAGATATTTATA
TTTTATATCGATGGCAAACAAACTTAAAGTGTGCGACAAGTGAGTGAGAATTTAAAAAAC
ATAAAGCACATCCAAGGACAATAATAATAATCGTGAAAATATTAATTGTCAATGTGAAAC
AATGAAGATGACTAAAGAGACCCACTAGTTCTGAGAAATTTATTGATAACTATATATTGT
GTATTTGTGTAGAAGGAAGAATATATATAAGTATCCATTTCGTTCTAAATCTTAATTTAA
AAGGTAAAATAATTATGATTCTCGCACGGATGGACAGAATAGTTTTTATTATTATTATTA
TATGACCGGATATAATTATATAAGGAAAAGAAACAACCAAATAATGATTATAATAATTTA
ATTGTTTAAGGAATAATTTCTCGATTAAATGCATCGGTATACTTTGTTGATTAATTAAAT
AATTAATTAGTTAATTTAGAATAAAATGCACATTCACAAAACACAATATTTACATAGATT
ATACA

clustalw multiple alignements is not computed in this case