Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 6132 cluster # 6132       Sequences # 4       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6132#0 length = 797 sequences # 4  
consensusID : consensus_6132#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 797
fasta sequence 
                              [TATTTCTTTATTTTCTTTGAAAATAATAGTTGGTGACAGATTAGTGGTTATATGATTGCTTTCATTATTGTAATGCATTGATGATGATGATGACGATGATGAAAGAGAAGAGGATTTTTGACAAGATATTTGTGATTGACGGAAACAATTACGTTCTGGTTGCATAATAATTATTTGTTCAGTTGAATGTTTTGAACTATTAAACTCGTCCCCAAAAGACACAACAGGTTCACCACCAGCAG-AAAAAAAGTTTCTTTCGTCCTCATAACGTTGTTGCTGTTCAACGACCTTTAAATTCAATTCATTTGTATCCAAAGGTTCTATTAATGGTGTTTTATTAGTTAACCATGGTGAACACCAAAGATAATTTTTACCATAAATTGGTTGAGTACTAGATAATTGAGGTGTTGGACAATAATCGATTGGAACATTTGAACAAAACTGTATATCATCCACAACAATATCTTCACCAGTTTCTTCATCTAATGTGACTGATGGTAATAAATCTGTCGGTTGTATTAAATGACTACGACCTGGTATCTGTAACTGACGTTTAGATGGATATGGGAATCCTCTTAAATNTGTCAAATAACCCGGGTGGT-ATCGATGAAATGGTACACCGCTAGGTGCATGTATAATTTCATATAGTACAGCTGGAGGAGGTCTATAACGAATGATTCGATCAGAATTATCATTAACATTGTCACTATTATGATTATTAATTAATTCCCTATGACGATTGTTTTGTGAATTTTCCCGTGATAAATCAACTCTACCGTTTGATGAAGAATTAGCTG]

[+] EMBL CD124268             [TATTTCTTTATTTTCTTTGAAAATAATAGTTGGTGACAGATTAGTGGTTATATGATTGCTTTCATTATTGTAATGCATTGATGATGATGATGACGATGATGAAAGAGAAGAGGATTTTTGACAAGATATTTGTGATTGACGGAAACAATTACGTTCTGGTTGCATAATAATTATTTGTTCAGTTGAATGTTTTGAACTATTAAACTCGTCCCCAAAAGACACAACAGGTTCACCACCAGCAG AAAAAAAGTTTCTTTCGTCCTCATAACGTTGTTGCTGTTCAACGACCTTTAAATTCAATTCATTTGTATCCAAAGGTTCTATTAATGGTGTTTTATTAGTTAACCATGGTGAACACCAAAGATAATTTTTACCATAAATTGGTTGAGTACTAGATAATTGAGGTGTTGGACAATAATCGATTGGAACATTTGAACAAAACTGTATATCATCCACAACAATATCTTCACCAGTTTCTTCATCTAATGTGACTGATGGTAATAAATCTGTCGGTTGTATTAAATGACTACGACCTGGTATCTGTAACTGACGTTTAGATGGATATGGGAATCCTCTTAAATNTGTCAAATAACCCGGGTGGT ATCGATGAAATGGTACACCGCT                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD169863             [                                                                                                                                                                                                                                 AGGTTCACCACCAGCAGAAAAAAAAGTTTCTTTCGTCCTCATAACGTTGTTGCTGTTCAACGACCTTTAAATTCAATTCATTTGTATCCAACGGTTCTATTAATGGTGTTCTATTAGTTAACCATGGTGAACACCAAAGATAATTTTTACCATAAATTGGTTGAGTACTAGATAATTCAGGTGTTGGACAATAATCGATTGGAACATTTGAACAAAACTGTATATCATCCACAACAATATCTTCACCAGTTTCTTCATCTAATGTGACTGATGGTAATAAATCTATCGGTTGTATTAAATGACTACGACCTTGTATTTGTAACTGACG                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD169976             [                                                                                                                                                                                                                                                                                      TGTTCAACGACCTTTAAATTCAATTCATTTGTATCCAAAGGTTCTATTAATGGTGTTTTATTAGTTACCCATGGTGAACACCAAAGATAATTTTTACCATAAATTGGTTGAGTACTAGATAATTGAGGTGTTGGACAATAATCCATTGGAACATTTGTTCAAAACTGTATATCATCCTCAACAATATCTTCACCAGTTTCTTCATCTAATGTGCCTGATGGTAATAAATCTGTCGGTTGTATTAAATGACTACGACCTGGTATCTGTAACTGACGT                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD124321             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CTTT AATTCAATTCATTTGTATCCAAAGGTTCTATTAATGGTGTTTTATTAGTTAACCATGGTGAACACCAAAGATAATTTTTACCATAAATTGGTTGAGTACTAGATAATTGAGGTGTTGGACAATAATCGATTGGAACATTTGAACAAAACTGTATATCATCCACAACAATATCTTCACCAGCTTCTTCATCTAATGTGACTGATGGTAATAAATCTGTCGGTTGTATTAAATGACTACGACCTGGTATCTGTAACTGACGTTTAGATGGATATGGGAATCCTCTTAAATTTGTCAAATAACCC GGTGGTAATCGATGAAATGGTACACCGCTAGGTGCATGTATAATTTCATATAGTACAGCTGGAGGAGGTCTATAACGAATGATTCGATCAGAATTATCATTAACATTGTCACTATTATGATTATTAATTAATTCCCTATGACGATTGTTTTGTGAATTTTCCCGTGATAAATCAACTCTACCGTTTGATGAAGAATTAGCTG]




>consensus_6132#0
TATTTCTTTATTTTCTTTGAAAATAATAGTTGGTGACAGATTAGTGGTTATATGATTGCT
TTCATTATTGTAATGCATTGATGATGATGATGACGATGATGAAAGAGAAGAGGATTTTTG
ACAAGATATTTGTGATTGACGGAAACAATTACGTTCTGGTTGCATAATAATTATTTGTTC
AGTTGAATGTTTTGAACTATTAAACTCGTCCCCAAAAGACACAACAGGTTCACCACCAGC
AGAAAAAAAGTTTCTTTCGTCCTCATAACGTTGTTGCTGTTCAACGACCTTTAAATTCAA
TTCATTTGTATCCAAAGGTTCTATTAATGGTGTTTTATTAGTTAACCATGGTGAACACCA
AAGATAATTTTTACCATAAATTGGTTGAGTACTAGATAATTGAGGTGTTGGACAATAATC
GATTGGAACATTTGAACAAAACTGTATATCATCCACAACAATATCTTCACCAGTTTCTTC
ATCTAATGTGACTGATGGTAATAAATCTGTCGGTTGTATTAAATGACTACGACCTGGTAT
CTGTAACTGACGTTTAGATGGATATGGGAATCCTCTTAAATNTGTCAAATAACCCGGGTG
GTATCGATGAAATGGTACACCGCTAGGTGCATGTATAATTTCATATAGTACAGCTGGAGG
AGGTCTATAACGAATGATTCGATCAGAATTATCATTAACATTGTCACTATTATGATTATT
AATTAATTCCCTATGACGATTGTTTTGTGAATTTTCCCGTGATAAATCAACTCTACCGTT
TGATGAAGAATTAGCTG

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)