cluster # 6134

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Schistosoma mansoni
cluster # 6134 cluster # 6134 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6134#0 length = 692 sequences # 4

consensusID : consensus_6134#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 692
fasta sequence

                              [GGGTTTTCAACCATCTACTTTTATATAGACTAAGATTTTAACCTTTTTCTCAGTATCTTCAAATTACATCAGAATGTTACTCCTAAATCCTAAACAATTCAGAATTTTATGTTTTTTGAATATCAAATTTTCGTTTTAGAATACGTTTCAACTTATCATTTGGGTTAACATTATTTTCCCTCATTTTATGTAGTTTCTAATTTAGGAACCATTACTCTCTCTCTTGATTCCTTTTTACGTGATGAAGTATTTTGCTCTTGCCAGTGATACCTCCAAGATGCTTAGGTGTCTTAAATAATACTTATAGGATTCAATAAAAATCTCAGCTCTTCCTTATATAATGTAGGCATAATTATATTTGTGTTACACTAAACTTCATTAAGTGTTTCACATGCTCTTGGGAATATCGAGTTATTTGTCAAGTACCCTGATGGGTGAAACCGAGAGCGGTCTAACCAAGAGATGCCCATTATTCTACCACTGACTTAAGTCGGTGGCTGTTTGACTGAGCCACCTTGGTAAGTTCAGACTATCTAGTTAGTGTCCGCGCAATTATCGTGATCGGTGGTTATAGATGTTGGATGGCATAACTGAGAATCAGTCGTGATAGCTCAAATGTATGGGACTGGAGACTATTTTATGCTTTTAGTACTGTGGAAATTCTCCCTATTTTCTTGAGTCGTATCCTCTCT]

[+] EMBL CD088677             [GGGTTTTCAACCATCTACTTTTATATAGACTAAGATTTTAACCTTTTTCTCAGTATCTTCAAATTACATCAGAATGTTACTCCTAAATCCTAAACAATTCAGAATTTTATGTTTTTTGAATATCAAATTTTCGTTTTAGAATACGTTTCAACTTATCATTTGGGTTAACATTATTTTCCCTCATTTTATGTAGTTTCTAATTTAGGAACCATTACTCTCTCTCTTGATTCCTTTTTACGTGATGAAGTATTTTGCTCTTGCCAGTGATACCTCCAAGATGCTTAGGTGTCTTAAATAATACTTATAGGATTCAATAAAAATCTCAGCTCTTCCTTATATAATGTAGGCATAATTATATTTGTGTTACACTAAACTTCATTAAGTGTTTCACATGCTCTTGGGAATATCGAGTTATTTGTCAAGTACCCTGATGGGTGAAACCGAGAGCGGTCTAACCAAGAGATGCCCATTATTCTACCACTGACTTAAGTCGGTGGCTGTTTGACTGAGCCACCTTGGTAAGTTCAGACTATCTAGNTAGTGTCCGCGCAATTATCGTGATCGGTGGTT                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD088702             [                                                                                                                      AATATCAAATNTTCGTTTTAGAATACGTTTCAACTTATCATNTGGGTTAACATTATTTTCCCTCATTNTATGTAGTTTCTAATTTAGGAACCATTACTCACTCTCTTGATTCCTTTTTACGTGATGAAGTATTTTGCTCTTGCCAGTGATACCTCCAAGATGCTTAGGTGTCTTAAATAATACTTATAGGATTCAATAAAAATCTCAGCTCTTCCTTATATAATGTAGGCATAATTATATTTGTGTTACACTAAACTTCATTAAGTGTTTCACATGCTCTTGGGAATATCGAGTTATTTGTCAAGTACCCTGATGGGTGAAACCGAGAGCGGTCTAACCAAGAGATGCCCATTATTCTACCACTGACTTAAGTCGGTGGCTGTTTGACTGAGCCACCTTGGTAAGTTCAGACTATCTAGTTAGTGTCCGCGCAATTATCGTGATCGGTGGTTATAGATGTTGGATGGCATAACTGAGAATCAGTCGTGATAGCTCAAATGTATGGGACTGGAGACTATTTTATGCTTTTAGTACTGTGGAAATTCTCCCTATTTTCTTGAG             ]
[+] EMBL CD085810             [                                                                                                                                                                          TTATTTTCCCTCATTTTATGTAGTTTCTAATTTAGGAACCATTACTCTCTCTCTTGATTCCTTTTTACGTGATGAAGTATTTTGCTCTTGCCAGTGATACCTCCAAGATGCTTAGGTGTCTTAAATAATACTTATAGGATTCAATAAAAATCTCAGCTCTTCCTTATATAATGTAGGCATAATTATATTTGTGTTACACTAAACTTCATTAAGTGTTTCACATGCTCTTGGGAATATCGAGTTATTTGTCAAGTACCCTGATGGGTGAAACCGAGAGCGGTCTAACCAAGAGATGCCCATTATTCTACCACTGACTTAAGTCGGTGGCTGTTTGACTGAGCCACCTTGGTAAGTTCAGACTATCTAGTTAGTGTCCGCGCAATTATCGTGATCGATGGTTATAGATGTTGGATGGCATAACTGAGAATCAGTCGTGATAGCTCAAATGTATGGGACTGGAGACTATTTTATGCTTTTAGTACTGTGGAAATTCTCCCTATTTTCTTGAGTCGTATCCTCTCT]
[-] EMBL CD158117             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GTCTAACCAAGAGACGCCCATTATTCTACCACTGACTTAAGTCGGTGGCTGTTTGACTGAGCCACCTTGGTAAGTTCAGACTATCTAGTTAGTGTCCGCGCAATTATCGTGATCGATGGTTATAGATGTTGGATGGCATAACTGAGAATCAGTCGTGATA                                                                                   ]




>consensus_6134#0
GGGTTTTCAACCATCTACTTTTATATAGACTAAGATTTTAACCTTTTTCTCAGTATCTTC
AAATTACATCAGAATGTTACTCCTAAATCCTAAACAATTCAGAATTTTATGTTTTTTGAA
TATCAAATTTTCGTTTTAGAATACGTTTCAACTTATCATTTGGGTTAACATTATTTTCCC
TCATTTTATGTAGTTTCTAATTTAGGAACCATTACTCTCTCTCTTGATTCCTTTTTACGT
GATGAAGTATTTTGCTCTTGCCAGTGATACCTCCAAGATGCTTAGGTGTCTTAAATAATA
CTTATAGGATTCAATAAAAATCTCAGCTCTTCCTTATATAATGTAGGCATAATTATATTT
GTGTTACACTAAACTTCATTAAGTGTTTCACATGCTCTTGGGAATATCGAGTTATTTGTC
AAGTACCCTGATGGGTGAAACCGAGAGCGGTCTAACCAAGAGATGCCCATTATTCTACCA
CTGACTTAAGTCGGTGGCTGTTTGACTGAGCCACCTTGGTAAGTTCAGACTATCTAGTTA
GTGTCCGCGCAATTATCGTGATCGGTGGTTATAGATGTTGGATGGCATAACTGAGAATCA
GTCGTGATAGCTCAAATGTATGGGACTGGAGACTATTTTATGCTTTTAGTACTGTGGAAA
TTCTCCCTATTTTCTTGAGTCGTATCCTCTCT

clustalw multiple alignements is not computed in this case