cluster # 6145

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Schistosoma mansoni
cluster # 6145 cluster # 6145 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6145#0 length = 442 sequences # 4

consensusID : consensus_6145#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 442
fasta sequence

                              [ATAGCGCTGGGAA-ATAGAAGCAGATATGA-AA-GGGATGAATAACAACTAGAAAAAACTGGAAGGGAATGCACAGGACAGGGTTGGATGGAGAATGCTAGTGGGCTGACTATGCTCCTTCACGAGGGGGTAACAAGCGTAAGAAAGTAATTTAACAAGGTAACTAATATAATGCTTTATAATCTGAAAATAATAAATATGAAACTCTCTTGCAATAGATTAATTGAGCGTACTATCTATATTAGATCTTCTCTATTGTACTAGTTACGCTATTTCTAAATCACTTCAATGATAATCATCACTTTTTCTCCTAATGCTTAATAATAGTACTTACAAGACATTGCTTGAATTTCTTGATAGATAAGTTGAAATCTCATAATTCACTTAAGCCAAAAATAATTTTAATGGTTGATATCATGATTCAATCGAAGCTAGAACATCATTG]

[+] EMBL CD160055             [ATAGCGCTGGGAA ATAGAAGCAGATATGA AA GGGATGAATAACAACTAGAAAAAACTGGAAGGGAATGCACAGGACAGGGTTGGATGGAGAATGCTAGTGGGCTGACTATGCTCCTTCACGAGGGGGTAACAAGCGTAAGAAAGTAATTTAACAAGGTAACTAATATAATGCTTTATAATCTGAAAATAATAAATATGAAACTCTCTTGCAATAGATTAATTGAGCGTACTATCTATATTAGATCTTCTCTATTGTACTAGTTACGCTATTTCTAAATCACTTCAATGATAATCATCACTTTTTCTCCTAATGCTTAATAATAGTACTTACAAGACATTGCTTGAATTTCTTGATAGATAAGTTGAAATCTCATAATTCACTTAAGCCAAAAATAATTTTAATGGTTGATATCATGATTCAATCGAAGCTAGAACATCATTG]
[+] EMBL CD160354             [ATAGCGCTGGGAA ATAGAAGCAGATATGA AA GGGATGAATAACAACTAGAAAAAACTGGAAGGGAATGCACAGGACAGGGTTGGATGGAGAATGCTAGTGGGCTGACTATGCTCCTTCACGAGGGGGTAACAAGCGTAAGAAAGTAATTTAACAAGGTAACTAATATAATGCTTTATAATCTGAAAATAATAAATATGAAACTCTCTTGCAATAGATTAATTGAGCGTACTATCTATATTAGATCTTCTCTATTGTACTAGTTACGCTATTTCTAAATCACTTCAATGATAATCATCACTTTTTCTCCTAATGCTTAATAATAGTACTTACAAGACATTGCTTGAATTTCTTGATAGATAAGTTGAAATCTCATAATTCACTTAAGCCAAAAATAATTTTAATGGTTGATATCATGATTCAATCGAAGCTAGACCA      ]
[+] EMBL CD160270             [ATAGCGCTGGGAA ATAGAAGCAGATATGA AA GGGATGAATAACAACTAGAAAAAACTGGAAGGGAATGCACAGGACAGGGTTGGATGGAGAATGCTAGTGGGCTGACTATGCTCCTTCACGAGGGGGTAACAAGCGTAGGAAAGTAATTTAACAAGGTAACTAATATAATGCTTTATAATCTGAAAATAATAAATATGAAACTCTCTTGCAATAGATTAATTGAGCGTACTATCTATATTAGATCTTCTCTATTGTACTAGTTACGCTATTTCTAAATCACTTCAATGATAATCATCACTTTTTCTCCTAATGCTTAATAATAGTACTTACAAGACATTGCTTGAATTTCTTGATAGATAAGTTGAAATCTCATAATTCACTTAAGCCAAAAATAATTTT                                          ]
[+] EMBL CD160083             [ATAGCGCTGGGAATATAGAAGCAGATATGACAACGGGATGAATAACAACTAGAATAAACTGGAAGGGAATGCACAGGACAGGGTTGGATGGAGAATGCTAGTGGGCTGACTATGCTCCTTCACGAGGGGGTAACAAGCGTAAGAAAGTAATTTAACAAGGTAACTAATATTATGCTTTATTATCTGAAAATAATAAATATTAAACTCTCTTGCAATAGATTAATTGAGCGTACTATCTATATTAGATCTTCTCTATTGTACTAGTTACGCTATTTCTA                                                                                                                                                                       ]




>consensus_6145#0
ATAGCGCTGGGAAATAGAAGCAGATATGAAAGGGATGAATAACAACTAGAAAAAACTGGA
AGGGAATGCACAGGACAGGGTTGGATGGAGAATGCTAGTGGGCTGACTATGCTCCTTCAC
GAGGGGGTAACAAGCGTAAGAAAGTAATTTAACAAGGTAACTAATATAATGCTTTATAAT
CTGAAAATAATAAATATGAAACTCTCTTGCAATAGATTAATTGAGCGTACTATCTATATT
AGATCTTCTCTATTGTACTAGTTACGCTATTTCTAAATCACTTCAATGATAATCATCACT
TTTTCTCCTAATGCTTAATAATAGTACTTACAAGACATTGCTTGAATTTCTTGATAGATA
AGTTGAAATCTCATAATTCACTTAAGCCAAAAATAATTTTAATGGTTGATATCATGATTC
AATCGAAGCTAGAACATCATTG

clustalw multiple alignements is not computed in this case