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Schistosoma mansoni
cluster # 6147 cluster # 6147       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6147#0 length = 458 sequences # 4  

consensusID : consensus_6147#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 458
fasta sequence
                              [GGCATTCATTTTAATGATTTCATTCCAGTGTGTTGATGTGGTAGCTTCAATTGATGCATATACATGCCAGATCCGACATCGCCTATGGCTGACTTGTGCAGTGTCAAAGGTGATCACTAAGGAGATGTTCTATTTAACCGATGGAATGTGACTGGCAGAGGAATTGATGATGTTTCGTCCTATTTGGGACCCGTCAGCTATATATACCTGTTAGATCCTGACGAAGAATAAATGAATGGTAACTGCTAGGAATTATTTATGGACTGTTATTATACATACATTCTGATTCTATAACTATTAAGTAACTAAACTGCATATATATTTACATTTCTCGTATTATAAAATTTCATTTGACATATTAATTACTATTATACGATTTACTATTTTT-AAATTACATCCAATCTATTAGTTACAGTCTCTCACACACTCACAGTCCCTTTTCGTTAGATCTCTTATAA]

[+] EMBL CD187832             [GGCATTCATTTTAATGATTTCATTCCAGTGTGTTGATGTGGTAGCTTCAATTGATGCATATACATGCCAGATCCGACATCGCCTATGGCTGACTTGTGCAGTGTCAAAGGTGATCACTAAGGAGATGTTCTATTTAACCGATGGAATGTGACTGGCAGAGGAATTGATGATGTTTCGTCCTATTTGGGACCCGTCAGCTATATATACCTGTTAGATCCTGACGAAGAATAAATGAATGGTAACTGCTAGGAATTATTTATGGACTGTTATTATACATACATTCTGATTCTATAACTATTAAGTAACTAAACTGCATATATATTTACATTTCTCGTATTATAAAATTTCATTTGACATATTAATTACTATTATACGATTTACTATTTTT AAATTACATCCAATCTATTAGTTACAGTCTCTCACACACTCACAGTCCCTTTTCGTTAGATCTCTTATAA]
[+] EMBL CD187841             [GGCATTCATTTTAATGATTTCATTCCAGTGTGTTGATGTGGTAGCTTCAATTGATGCATATACATGCCAGATCCGACATCGCCTATGGCTGACTTGTGCAGTGTCAAAGGTGATCACTAAGGAGATGTTCTATTTAACCGATGGAATGTGACTGGCAGAGGAATTGATGATGTTTCGTCCTATTTGGGACCCGTCAGCTATATATACCTGTTAGATCCTGACGAAGAATAAATGAATGGTAACTGCTAGGAATTATTTATGGACTGTTATTATACATACATTCTGATTCTATAACTATTAAGTAACTAAACTGCATATATATTTACATTTCTCGTATTATAAAATTTCATTTGACATATTAATTACTATTATACGATTTACTATTTTT AAATTACATCCAATCTATTAGTTACAGTCTCTCACACACTCACAGTCCCTTTCGGTTAGA          ]
[+] EMBL CD187842             [GGCATTCATTTTAATGATTTCATTCCAGTGTGTTGATGTGGTAGCTTCAATTGATGCATATACATGCCAGATCCGACATCGCCTATGGCTGACTTGTGCAGTGTCAAAGGTGATCACTAAGGAGATGTTCTATTTAACCGATGGAATGTGACTGGCAGAGGAATTGATGATGTTTCGTCCTATTTGGGACCCGTCAGCTATATATACCTGTTAGATCCTGACGAAGAATAAATGAATGGTAACTGCTAGGAATTATTTATGGACTGTTATTATACATACATTCTGATTCTATAACTATTAAGTAACTAAACTGCATATATATTTACATTTCTCGTATTATAAAATTTCATTTGACATATTAATTACTATTATACGATTTACTATTTTT AAATTACATCCAATCTATTAGTTACAGTCTCTCACACACTCACAGTCCCT                    ]
[+] EMBL CD187833             [GGCATTCATTTTAATGATTTCATTCCAGTGTGTTGATGTGGTAGCTTCAATTGATGCATATACATGCCAGATCCGACATCGCCTATGGCTGACTTGTGCAGTGTCAAAGGTGATCACTAAGGAGATGTTCTATTTAACCGATGGAATGTGACTGGCAGAGGAATTGATGATGTTTCGTCCTATTTGGGACCCGTCAGCTATATATACCTGTTAGATCCTGACGAAGAATAAATGAATGGTAACTGCTAGGAATTATTTATGGACTGTTATTATACATACATTCTGATTCTATAACTATTAAGTAACTAAACTGCATATATATTTACATTTCTCGTATTATAAAATTTCATTTGACATATTAATTACTATTATACGATTTACTATTTTTAAAATTACATCCAATCTA                                                     ]


>consensus_6147#0 GGCATTCATTTTAATGATTTCATTCCAGTGTGTTGATGTGGTAGCTTCAATTGATGCATA TACATGCCAGATCCGACATCGCCTATGGCTGACTTGTGCAGTGTCAAAGGTGATCACTAA GGAGATGTTCTATTTAACCGATGGAATGTGACTGGCAGAGGAATTGATGATGTTTCGTCC TATTTGGGACCCGTCAGCTATATATACCTGTTAGATCCTGACGAAGAATAAATGAATGGT AACTGCTAGGAATTATTTATGGACTGTTATTATACATACATTCTGATTCTATAACTATTA AGTAACTAAACTGCATATATATTTACATTTCTCGTATTATAAAATTTCATTTGACATATT AATTACTATTATACGATTTACTATTTTTAAATTACATCCAATCTATTAGTTACAGTCTCT CACACACTCACAGTCCCTTTTCGTTAGATCTCTTATAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)