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Schistosoma mansoni
cluster # 615 cluster # 615       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_615#0 length = 546 sequences # 2  

consensusID : consensus_615#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 546
fasta sequence
                              [AATTTACGTATACAATGAGGTGTTTTAAAATCAAATGGCTAGTTTTATATTGAATAGATTGATGCAAACAAGAATTCACTAAAAGTCGGTGGACGAGAATAAGTCTAAATTAATTAACGCGGAAAGTTAAGTTGATATACAGAATTCATTTCAAACAAGAACGTTATTTTTGAAACTGAATGTCATATTTCGGGGTTTAACATCAACAACTCCACATGCAGATTACTTTTGATTAACTAGACCGGGAAATACACTCAGATGGATCCGGATCGCCTTATACAGTCGATTTATACTATAATAATAGTGATATTCGTTCAGCCCAGTCTGTTCAACTAAAATAAAATCTTGATAATTTATG-TCGACACTATTCCTTCTGCCAGTCAACTATAATACTCCATTACTTAAAAACGATTTGCCTAAGCGGTTCTCCACAAAAGTGTATTTCGTTTTCGGTACTTACAACAACAACCAGGCGTAAGTAAAAAGAGAACCAGACTCCTTGAAGAGGCTAGTTCAACATCGTCAAAACAAAATAACAATTGGGTA]

[+] EMBL CD117009             [AATTTACGTATACAATGAGGTGTTTTAAAATCAAATGGCTAGTTTTATATTGAATAGATTGATGCAAACAAGAATTCACTAAAAGTCGGTGGACGAGAATAAGTCTAAATTAATTAACGCGGAAAGTTAAGTTGATATACAGAATTCATTTCAAACAAGAACGTTATTTTTGAAACTGAATGTCATATTTCGGGGTTTAACATCAACAACTCCACATGCAGATTACTTTTGATTAACTAGACCGGGAAATACACTCAGATGGATCCGGATCGCCTTATACAGTCGATTTATACTATAATAATAGTGATATTCGTTCAGCCCAGTCTGTTCAACTAAAATAAAATCTTGATAATTTATG TCGACACTATTCCTTCTGCCAGTCAACTATAATACTCCATTACTTAAAAACGATTTGCCTAAGCGGTTCTCCACAAAAGTGTATTTCGTTTTCGGTACTTACAACAACAACCAGGCGTAAGTAAAAAGAGAACCAGACTCCTTGAAGAGGCTAGTTCAACATCGTCAAAACAAAATAACAATTGGGTA]
[+] EMBL CD116968             [AATTTACGTATACAATGAGGTGTTTTAAAATCAAATGGCTAGTTTTATATTGAATAGATTGATGCAAACAAGAATTCACTAAAAGTCGGTGGACGAGAATAAGTCTAAATTAATTAACGCGGAAAGTTAAGTTGATATACAGAATTCATTTCAAACAAGAACGTTATTTTTGAAACTGAATGTCATATTTCGGGGTTTAACATCAACAACTCCACATGCAGATTACTTTTGATTAACTAGACCGGGAAATACACTCAGATGGATCCGGATCGCCTTATACAGTCGATTTATACTATAATAATAGTGATATTCGTTCAGCCCAGTCTGTTCAACTAAAATAAAATCTTGATAATTTATGTTCGACACTATTCCc                                                                                                                                                                              ]


>consensus_615#0 AATTTACGTATACAATGAGGTGTTTTAAAATCAAATGGCTAGTTTTATATTGAATAGATT GATGCAAACAAGAATTCACTAAAAGTCGGTGGACGAGAATAAGTCTAAATTAATTAACGC GGAAAGTTAAGTTGATATACAGAATTCATTTCAAACAAGAACGTTATTTTTGAAACTGAA TGTCATATTTCGGGGTTTAACATCAACAACTCCACATGCAGATTACTTTTGATTAACTAG ACCGGGAAATACACTCAGATGGATCCGGATCGCCTTATACAGTCGATTTATACTATAATA ATAGTGATATTCGTTCAGCCCAGTCTGTTCAACTAAAATAAAATCTTGATAATTTATGTC GACACTATTCCTTCTGCCAGTCAACTATAATACTCCATTACTTAAAAACGATTTGCCTAA GCGGTTCTCCACAAAAGTGTATTTCGTTTTCGGTACTTACAACAACAACCAGGCGTAAGT AAAAAGAGAACCAGACTCCTTGAAGAGGCTAGTTCAACATCGTCAAAACAAAATAACAAT TGGGTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)