cluster # 6160

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Schistosoma mansoni
cluster # 6160 cluster # 6160 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6160#0 length = 505 sequences # 4

consensusID : consensus_6160#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 505
fasta sequence

                              [TTAAAGTCAGAAGACGTAAACATATATGAACCTTCACAAACCCAATTAATCGATAATCATCGTTCTGAATTGCGTCTTTATCATAATTTAATGGTACAACAAGTCAAAGAGATTCAAAGTAAACTAAAAGAAGGTACGGTCCCAGATATGAATCGTATTGATGAATTAACTGGTATGCTAAATGCATCTTGCTCTACATTCTTAATAACTTTGGATGAATTAATGATTTTAAGTAATGCACAAGCACCATGGTTAAGTTCCATTGTAACAGGAACAACATTGGAGACAAGTCCTACTATATTTCGTAATACATCATGTCTTACCAATACAGATCCTTCTAATATACATTCACCAAATATGAGTAATAATCTTTGTTCTTCATTGACGAACGATTCGCTCTTTCGAAATTCACATGCACAATCATCATTAAATCGTCGTCACTTCAATGCTACACGAAAATATCAAACTTTCTTTTCTACTTTAGAATATAGTTTTGAAGAGATTA]

[+] EMBL CD127218             [TTAAAGTCAGAAGACGTAAACATATATGAACCTTCACAAACCCAATTAATCGATAATCATCGTTCTGAATTGCGTCTTTATCATAATTTAATGGTACAACAAGTCAAAGAGATTCAAAGTAAACTAAAAGAAGGTACGGTCCCAGATATGAATCGTATTGATGAATTAACTGGTATGCTAAATGCATCTTGCTCTACATTCTTAATAACTTTGGATGAATTAATGATTTTAAGTAATGCACAAGCACCATGGTTAAGTTCCATTGTAACAGGAACAACATTGGAGACAAGTCCTACTATATTTCGTAATACATCATGTCTTACCAATACAGATCCTTCTAATATACATTCACCAAATATGAGTAATAATCTTTGTTCTTCATTGACGAACGATTCGCTCTTTCGAAATTCACATGCACAATCATCATTAAATCGTCGTCACTTCAATGCTACACGAAAATATCAAACTTTCTTTTCTACTTTAGAATATAGTTTTGAAG      ]
[+] EMBL CD127706             [TTAAAGTCAGAAGACGTAAACATATATGAACCTTCACAAACCCAATTAATCGATAATCATCGTTCTGAATTGCGTCTTTATCATAATTTAATGGTACAACAAGTCAAAGAGATTCAAAGTAAACTAAAAGAAGGTACGGTCCCAGATATGAATCGTATTGATGAATTAACTGGTATGCTAAATGCATCTTGCTCTACATTCTTAATAACTTTGGATGAATTAATGATTTTAAGTAATGCACAAGCACCATGGTTAAGTTCCATTGTAACAGGAACAACATTGGAGACAAGTCCTACTATATTTCGTAATACATCATGTCTTACCAATACAGATCCTTCTAATATACATTCACCAAATATGAGTAATAATCTTTGTTCTTCATTGACGAACGATTCGCTCTTTCGAAATTCACATGCACAATCATCATTAAATCGTCGTCACTTCAATGCTACACGAAAATATCAAACTTTCTTTTCTACTTTAGAATATAGTTTTGAAG      ]
[+] EMBL CD116880             [                                           AATTAATCGATAATCATCGTTCTGAATTGCGTCTTTATCATAATTTAATGGTACAACAAGTCAAAGAGATTCAAAGTAAACTAAAAGAAGGTACGGTCCCAGATATGAATCGTATTGATGAATTAACTGGTATGCTAAATGCATCTTGCTCTACATTCTTAATAACTTTGGATGAATTAATGATTTTAAGTAATGCACAAGCACCATGGTTAAGTTCCATTGTAACAGGAACAACATTGGAGACAAGTCCTACTATATTTCGTAATACATCATGTCTTACCAATACAGATCCTTCTAATATACATTCACCAAATATGAGTAATAATCTTTGTTCTTCATTGACGAACGATTCGCTCTTTCGAAATTCACATGCACAATCATCATTAAATCGTCGTCACTTCAATGCTACACGAAAATATCAAACTTTCTTTTCTACTTTAGAATATAGTTTTGAAGAGATTA]
[+] EMBL CD116799             [                                           AATTAATCGATAATCATCGTTCTGAATTGCGTCTTTATCATAATTTAATGGTACAACAAGTCAAAGAGATTCAAAGTAAACTAAAAGAAGGTACGGTCCCAGATATGAATCGTATTGATGAATTAACTGGTATGCTAAATGCATCTTGCTCTACATTCTTAATAACTTTGGATGAATTAATGATTTTAAGTAATGCACAAGCACCATGGTTAAGTTCCATTGTAACAGGAACAACATTGGAGACAAGTCCTACTATATTTCGTAATACATCATGTCTTACCGATACAGATCCTTCTAATATACATTCACCAAATATGAGTAATAATCTTTGTTCTTCATTGACGAACGATTCGCTCTTTCGAAATTCACATGCACAATCATCATTAAATCGTCGTCACTTCAATGCTACACGAAAATATCAAACTTTCTTTTCTACTTTAGAATATAGTTTTGAAGAGATTA]




>consensus_6160#0
TTAAAGTCAGAAGACGTAAACATATATGAACCTTCACAAACCCAATTAATCGATAATCAT
CGTTCTGAATTGCGTCTTTATCATAATTTAATGGTACAACAAGTCAAAGAGATTCAAAGT
AAACTAAAAGAAGGTACGGTCCCAGATATGAATCGTATTGATGAATTAACTGGTATGCTA
AATGCATCTTGCTCTACATTCTTAATAACTTTGGATGAATTAATGATTTTAAGTAATGCA
CAAGCACCATGGTTAAGTTCCATTGTAACAGGAACAACATTGGAGACAAGTCCTACTATA
TTTCGTAATACATCATGTCTTACCAATACAGATCCTTCTAATATACATTCACCAAATATG
AGTAATAATCTTTGTTCTTCATTGACGAACGATTCGCTCTTTCGAAATTCACATGCACAA
TCATCATTAAATCGTCGTCACTTCAATGCTACACGAAAATATCAAACTTTCTTTTCTACT
TTAGAATATAGTTTTGAAGAGATTA

clustalw multiple alignements is not computed in this case