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Schistosoma mansoni
cluster # 6160 cluster # 6160       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6160#0 length = 505 sequences # 4  

consensusID : consensus_6160#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 505
fasta sequence
                              [TTAAAGTCAGAAGACGTAAACATATATGAACCTTCACAAACCCAATTAATCGATAATCATCGTTCTGAATTGCGTCTTTATCATAATTTAATGGTACAACAAGTCAAAGAGATTCAAAGTAAACTAAAAGAAGGTACGGTCCCAGATATGAATCGTATTGATGAATTAACTGGTATGCTAAATGCATCTTGCTCTACATTCTTAATAACTTTGGATGAATTAATGATTTTAAGTAATGCACAAGCACCATGGTTAAGTTCCATTGTAACAGGAACAACATTGGAGACAAGTCCTACTATATTTCGTAATACATCATGTCTTACCAATACAGATCCTTCTAATATACATTCACCAAATATGAGTAATAATCTTTGTTCTTCATTGACGAACGATTCGCTCTTTCGAAATTCACATGCACAATCATCATTAAATCGTCGTCACTTCAATGCTACACGAAAATATCAAACTTTCTTTTCTACTTTAGAATATAGTTTTGAAGAGATTA]

[+] EMBL CD127218             [TTAAAGTCAGAAGACGTAAACATATATGAACCTTCACAAACCCAATTAATCGATAATCATCGTTCTGAATTGCGTCTTTATCATAATTTAATGGTACAACAAGTCAAAGAGATTCAAAGTAAACTAAAAGAAGGTACGGTCCCAGATATGAATCGTATTGATGAATTAACTGGTATGCTAAATGCATCTTGCTCTACATTCTTAATAACTTTGGATGAATTAATGATTTTAAGTAATGCACAAGCACCATGGTTAAGTTCCATTGTAACAGGAACAACATTGGAGACAAGTCCTACTATATTTCGTAATACATCATGTCTTACCAATACAGATCCTTCTAATATACATTCACCAAATATGAGTAATAATCTTTGTTCTTCATTGACGAACGATTCGCTCTTTCGAAATTCACATGCACAATCATCATTAAATCGTCGTCACTTCAATGCTACACGAAAATATCAAACTTTCTTTTCTACTTTAGAATATAGTTTTGAAG      ]
[+] EMBL CD127706             [TTAAAGTCAGAAGACGTAAACATATATGAACCTTCACAAACCCAATTAATCGATAATCATCGTTCTGAATTGCGTCTTTATCATAATTTAATGGTACAACAAGTCAAAGAGATTCAAAGTAAACTAAAAGAAGGTACGGTCCCAGATATGAATCGTATTGATGAATTAACTGGTATGCTAAATGCATCTTGCTCTACATTCTTAATAACTTTGGATGAATTAATGATTTTAAGTAATGCACAAGCACCATGGTTAAGTTCCATTGTAACAGGAACAACATTGGAGACAAGTCCTACTATATTTCGTAATACATCATGTCTTACCAATACAGATCCTTCTAATATACATTCACCAAATATGAGTAATAATCTTTGTTCTTCATTGACGAACGATTCGCTCTTTCGAAATTCACATGCACAATCATCATTAAATCGTCGTCACTTCAATGCTACACGAAAATATCAAACTTTCTTTTCTACTTTAGAATATAGTTTTGAAG      ]
[+] EMBL CD116880             [                                           AATTAATCGATAATCATCGTTCTGAATTGCGTCTTTATCATAATTTAATGGTACAACAAGTCAAAGAGATTCAAAGTAAACTAAAAGAAGGTACGGTCCCAGATATGAATCGTATTGATGAATTAACTGGTATGCTAAATGCATCTTGCTCTACATTCTTAATAACTTTGGATGAATTAATGATTTTAAGTAATGCACAAGCACCATGGTTAAGTTCCATTGTAACAGGAACAACATTGGAGACAAGTCCTACTATATTTCGTAATACATCATGTCTTACCAATACAGATCCTTCTAATATACATTCACCAAATATGAGTAATAATCTTTGTTCTTCATTGACGAACGATTCGCTCTTTCGAAATTCACATGCACAATCATCATTAAATCGTCGTCACTTCAATGCTACACGAAAATATCAAACTTTCTTTTCTACTTTAGAATATAGTTTTGAAGAGATTA]
[+] EMBL CD116799             [                                           AATTAATCGATAATCATCGTTCTGAATTGCGTCTTTATCATAATTTAATGGTACAACAAGTCAAAGAGATTCAAAGTAAACTAAAAGAAGGTACGGTCCCAGATATGAATCGTATTGATGAATTAACTGGTATGCTAAATGCATCTTGCTCTACATTCTTAATAACTTTGGATGAATTAATGATTTTAAGTAATGCACAAGCACCATGGTTAAGTTCCATTGTAACAGGAACAACATTGGAGACAAGTCCTACTATATTTCGTAATACATCATGTCTTACCGATACAGATCCTTCTAATATACATTCACCAAATATGAGTAATAATCTTTGTTCTTCATTGACGAACGATTCGCTCTTTCGAAATTCACATGCACAATCATCATTAAATCGTCGTCACTTCAATGCTACACGAAAATATCAAACTTTCTTTTCTACTTTAGAATATAGTTTTGAAGAGATTA]


>consensus_6160#0 TTAAAGTCAGAAGACGTAAACATATATGAACCTTCACAAACCCAATTAATCGATAATCAT CGTTCTGAATTGCGTCTTTATCATAATTTAATGGTACAACAAGTCAAAGAGATTCAAAGT AAACTAAAAGAAGGTACGGTCCCAGATATGAATCGTATTGATGAATTAACTGGTATGCTA AATGCATCTTGCTCTACATTCTTAATAACTTTGGATGAATTAATGATTTTAAGTAATGCA CAAGCACCATGGTTAAGTTCCATTGTAACAGGAACAACATTGGAGACAAGTCCTACTATA TTTCGTAATACATCATGTCTTACCAATACAGATCCTTCTAATATACATTCACCAAATATG AGTAATAATCTTTGTTCTTCATTGACGAACGATTCGCTCTTTCGAAATTCACATGCACAA TCATCATTAAATCGTCGTCACTTCAATGCTACACGAAAATATCAAACTTTCTTTTCTACT TTAGAATATAGTTTTGAAGAGATTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)