cluster # 6169

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Schistosoma mansoni
cluster # 6169 cluster # 6169 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6169#0 length = 465 sequences # 4

consensusID : consensus_6169#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 465
fasta sequence

                              [AACATGGTTACTAGATAGTAAAATATCTCCACAACCTTCTGAACTGATNATAGTCACATCTGATTGTGATTCCATGTTATCGTTTTGTTGATATGGTTGACGAGTAGTACGAACTAATAAAGTTGGCTGTTGAACTGGTACGGTATGTTGAAAATGTTGAACATTTACCTGAGGTTGGGTTTGTTGTTGTTGAGCTAAAGTTGAATTATTAACAGCATTCAATATACTACCAGCACGTTGATAAGGAT---TTTGAACAGGAAATGACTGTGTGT-GCAATTGTCCATGTGTTGTTTGTTGTGGTACACTAGCTACAAGTTGACCACATGGATGTCTTTGTACAATATAAGCTGATGTTCCACCTTGTACTGACG-ACTGTGGTTGGTGTGATGCAATTGTA-NCTGTGGTAGTTAAATAATGTTGCATA-C-TTGTAAATCGCTGAAGTTGACAGGGTGTAGGTTGAAGTGA]

[-] EMBL CD139373             [AACATGGTTACTAGATAGTAAAATATCTCCACAACCTTCTGAACTGATNATAGTCACATCTGATTGTGATTCCATGTTATCGTTTTGTTGATATGGTTGACGAGTAGTACGAACTAATAAAGTTGGCTGTTGAACTGGTACGGTATGTTGAAAATGTTGAACATTTACCTGAGGTTGGGTTTGTTGTTGTTGAGCTAAAGTTGAATTATTAACAGCATTCAATATACTACCAGCACGTTGATAAGGAT   TTTGAACAGGAAATGACTGTGTGT GCAATTGTCCATGTGTTGTTTGTTGTGGTACACTAGCTACAAGTTGACCACATGGATGTCTTTGTACAATATAAGCTG                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD161177             [                                                                           GTTATCGTTTTGTTGATATGGTTGACGAGTAGTACGAACTAATAAAGTTGGCTGTTGAACTGGTACGGTATGTTGAAAATGTTGAACATTTACCTGAGGTTGGGTTTGTTGTTGTTGAGCTAAAGTTGAATTATTAACAGCATTCAATATACTACCAGCACGTTGATAAGGATTACTTTGAACAGGAAATGACTGTGTGT GCAATTGTCCATGTGTTGTTTGTTGTGGTACACTANCTACAAGTTGACCACATGGATGTCTTTGTACAATATAAGCTGATGTTCCACCTTGTACTGACG ACTGTGGTTGGTGTGATGCAATTGTA NCTGTGGTAGTTAAATAATGTTGCATA C TTGTAAATCGCTGAAGTTGACAGGGTGTAGGTTG      ]
[+] EMBL CD150101             [                                                                                      GTTGATATGGTTGACGAGTAGTACGAACTAATAAAGTTGGCTGTTGAACTGGTACGGTATGTTGAAAATGTTGAACATTTACCTGAGGTTGGGTTTGTTGTTGTTGAGCTAAAGTTGAATTATTAACAGCATTCAATATACTACCAGCACGTTGATAAGGAT   TTTGAACAGGAGATGACTGTGTGT GCAATTGTCCATGTGTTGTTTGTTGTGGTACACTAGCTA                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD063732             [                                                                                                       GTAGTACGAACTAATAAAGTTGGCTGTTGAACTGGTACGGTATGTTGAAAATGTTGAACATTTACCTGAGGTTGGGTTTGTTGTTGTTGAGCTAAAGTTGAATTATTAACAGCATTCAATATACTACCAGCACGTTGATAAGGAT   TTTGAACAGGAAATGACTGTGTGTAGCAATTGTCCATGTATTGTTTGTTGTGGTACACTAGCTACAAGTTGACCACATGGATGTCTTTGTACAATATAAGCTGATGTTCCACCTTGTACTGACGCACTGTGGTTGGTGTGATGCAATTGTAGTCTGTGGTAGATAAATAATGTAGCATAGCATTGTAGATCGCTGAAGTTGAGAGGGTGTAAGTTGAAGTGA]




>consensus_6169#0
AACATGGTTACTAGATAGTAAAATATCTCCACAACCTTCTGAACTGATNATAGTCACATC
TGATTGTGATTCCATGTTATCGTTTTGTTGATATGGTTGACGAGTAGTACGAACTAATAA
AGTTGGCTGTTGAACTGGTACGGTATGTTGAAAATGTTGAACATTTACCTGAGGTTGGGT
TTGTTGTTGTTGAGCTAAAGTTGAATTATTAACAGCATTCAATATACTACCAGCACGTTG
ATAAGGATTTTGAACAGGAAATGACTGTGTGTGCAATTGTCCATGTGTTGTTTGTTGTGG
TACACTAGCTACAAGTTGACCACATGGATGTCTTTGTACAATATAAGCTGATGTTCCACC
TTGTACTGACGACTGTGGTTGGTGTGATGCAATTGTANCTGTGGTAGTTAAATAATGTTG
CATACTTGTAAATCGCTGAAGTTGACAGGGTGTAGGTTGAAGTGA

clustalw multiple alignements is not computed in this case