cluster # 6171

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Schistosoma mansoni
cluster # 6171 cluster # 6171 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6171#0 length = 701 sequences # 4

consensusID : consensus_6171#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 701
fasta sequence

                              [AATACAACATTAACTACATGTATTGATGATTGTCATTTAGTGTTTGGTTAAAAAAACAAATCAC-TTCACACTTTATGATTATGATGATGATAAGGTTAAATGTATTTCATTACTTTGTATTCATTATTGTAAAGCAATATGTATTAGTCAAATGTCAAATGATAACAAAGGAACAATTAAATTTCATTGGAATATTACATCATAAACTTAAAGATGATCATGATGATTCAAAAGGTTTTGAACAATCTTCATTGAAACATAAAGAACATCTTAAACGGGATAACACATTACAACAATATGTGGAACGTTATGTGAAACAGTGCGATCCAAGTATTACTTTAACAAAACAATATTTGAATAATACACCTAGTGCGAATATTTCTGACAATAGAGATAATAAAAGTATATTCAAAGTATGGTCCGCCAAATATGATCATTATAATTGCA--TTGTTCATAATTGTTCATCCTATAAACAGTTAATGGCATATAATACTAGAAATATTGCTTGTTCAATTGGTAATTGTAAAAGGCAAACTAATTCAAGCAATATTATACTATGTTACTATTCATCATTAGCAAATGCGGACAATCGACCAGATGAAGTCTATGAAAATGAATCAAATAAAAATTCTTATACTGTGACAACTGAAGTTCCTCCAGAGACTACTTCTTATGTGCTCGAACATGGACGATGTGAATGT]

[+] EMBL CD133030             [AATACAACATTAACTACATGTATTGATGATTGTCATTTAGTGTTTGGTTAAAAAAACAAATCAC TTCACACTTTATGATTATGATGATGATAAGGTTAAATGTATTTCATTACTTTGTATTCATTATTGTAAAGCAATATGTATTAGTCAAATGTCAAATGATAACAAAGGAACAATTAAATTTCATTGGAATATTACATCATAAACTTAAAGATGATCATGATGATTCAAAAGGTTTTGAACAATCTTCATTGAAACATAAAGAACATCTTAAACGGGATAACACATTACAACAATATGTGGAACGTTATGTGAAACAGTGCGATCCAAGTATTACTTTAACAAAACAATATTTGAATAATACACCTAGTGCGAATATTTCTGACAATAGAGATAATAAAAGTATATTCAAAGTATGGTCCGCCAAATATGATCATTATAATTGCA  TTGTTCATAATTGTTCATCCTATAAACAGTTAATGGCATATAATACTAGAAATATTGCTTGTTCAATTGGTAATTGTAAAAGGCAAACTAATTC AGCAATATTATACTATGTTACTATTCATCATTAGCAAATGC                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD133414             [                                     TAGTG TTGGTTAAAAAAAC AATCACTTTCACACTNTATGATTATGATGATGATAAGGTTAAATGTATTTCATTACTTTGTATTCATTATTGTAAAGCAATATGTATTAGTCAAATGTCAAATGATAACAAAGGAACAATTAAATTTCATTGGAATATTACATCATAAACTTAAAGATGATCATGATGATTCAAAAGGTTTTGAACAATCTTCATTGAAACATAAAGAACATCTTAAACGGGATAACACATTACAACAATATGTGGAACGTTATGTGAAACAGTGCGATCCAAGTATTACTTTAACAAAACAATATTTGAATAATACACCTAGTGCGAATATTTCTGACAATAGAGATAATAAAAGTATATTCAAAGTATGGTCCGCCAAATATGATCATTATAATTGCA  TTGTTCATAATTGTTCATCCTATAAACAGTTAATGGCATATAATACTAGAAATATTGCTTGTTCAATTGGTAATTGTAAAAGGCAAACTAATTCAAGCAATATTATACTATGTTACTATTCATCATTAGCAAATGCG                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD139763             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TATGATCA TATAA TGCANNTTGTTCATAATTGTTCATCCTATAAACAGTTAATGGCATATAATACTAGAAATATTGCTTGTTCAATTGGTAATTGTAAAAGGCAAACTAATTCAAGCAATATTATACTATGTTACTATTCATCATTAGCAAATGCGGACAATCGACCAGATGAAGTCTATGAAAATGAATCAAATAAAAATTCTTATACTGTGACAACTGAAGTTCCTCCAGAGACTACTTCTTATGTGCTCGAACATGGACGATGTGAATGT]
[-] EMBL CD139722             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TCATCCTATAAACAGTTAATGGCATATAATACTAGAAATATTGC TGTTCAATTGGTAA TGTAAAAGGCAAACTAATTCAAGCAATATTATACTATGTTACTATTCATCATTAGCAAATGCGGACAATCGACCAGATGAAGTCTATGAAAATGAATCAAATAAAAATTTTTATACTGTGACAACTGAAGTTCCTCCAGAAACTACTTCTTATGTGCTCGAACATGGACGATGTGAATGT]




>consensus_6171#0
AATACAACATTAACTACATGTATTGATGATTGTCATTTAGTGTTTGGTTAAAAAAACAAA
TCACTTCACACTTTATGATTATGATGATGATAAGGTTAAATGTATTTCATTACTTTGTAT
TCATTATTGTAAAGCAATATGTATTAGTCAAATGTCAAATGATAACAAAGGAACAATTAA
ATTTCATTGGAATATTACATCATAAACTTAAAGATGATCATGATGATTCAAAAGGTTTTG
AACAATCTTCATTGAAACATAAAGAACATCTTAAACGGGATAACACATTACAACAATATG
TGGAACGTTATGTGAAACAGTGCGATCCAAGTATTACTTTAACAAAACAATATTTGAATA
ATACACCTAGTGCGAATATTTCTGACAATAGAGATAATAAAAGTATATTCAAAGTATGGT
CCGCCAAATATGATCATTATAATTGCATTGTTCATAATTGTTCATCCTATAAACAGTTAA
TGGCATATAATACTAGAAATATTGCTTGTTCAATTGGTAATTGTAAAAGGCAAACTAATT
CAAGCAATATTATACTATGTTACTATTCATCATTAGCAAATGCGGACAATCGACCAGATG
AAGTCTATGAAAATGAATCAAATAAAAATTCTTATACTGTGACAACTGAAGTTCCTCCAG
AGACTACTTCTTATGTGCTCGAACATGGACGATGTGAATGT

clustalw multiple alignements is not computed in this case