cluster # 6190

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 6190 cluster # 6190 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6190#0 length = 584 sequences # 4

consensusID : consensus_6190#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 584
fasta sequence

                              [CATCTGGTGGAAGACCAGAATCAAACATTGTCTCCATAATAATCTTTTTACCTTCTTCTATAGTTATATTTTCTAATGGTTTAATAATTATTGGTGGTTTTGCTTTTGTTGGCATTTTAACTGTTGTTGCTTTAACTTGATCATCATATATATGGGTAGGTTGTAATCGTTGTAAATTAATACATTGTTCTGTTCTTACACGAATTTCATCGGATAATTGAGTTAAATTATTAATAGATGATTGAAATTCATTTACAATAGGTTGTATAAATTGTTTTGCTTCCATAGGACGTGGATATTGAATAGATAATTGTTCCAAGATTGGTATATGTGTATCAGCTAATACACGTCCTCGATTAATTTGTTCTGAAATATCAAAACGTATCTCTTCAATTTGATAACGATTCTCTGAAGTAATCTCTGGTAATTGATTTTTAACACGATTTAAATTAAATGTTATTTGTGATAAAGCTTTCTGTGCTGTATCTACGGCATTTAACAAACGTAAAGTTAAATTAATTTCTGTACGACATCGTACAGTTTCTTCTGTAAATGTTGTTAAACGTATCTCAAGTTGTTCATGA]

[+] EMBL CD140874             [CATCTGGTGGAAGACCAGAATCAAACATTGTCTCCATAATAATCTTTTTACCTTCTTCTATAGTTATATTTTCTAATGGTTTAATAATTATTGGTGGTTTTGCTTTTGTTGGCATTTTAACTGTTGTTGCTTTAACTTGATCATCATATATATGGGTAGGTTGTAATCGTTGTAAATTAATACATTGTTCTGTTCTTACACGAATTTCATCGGATAATTGAGTTAAATTATTAATAGATGATTGAAATTCATTTACAATAGGTTGTATAAATTGTTTTGCTTCCATAGGACGTGGATATTGAATAGATAATTGTTCCAAGATTGGTATATGTGTATCAGCTAATACACGTCCTCGATTAATTTGTTCTGAAATATCAAAACGTATCTCTTCAATTTGATAACGATTCTCTGA                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD197404             [                                                                                                                                                         GGGTAGGTTGTAATCGTTGTAAATTAATACATTGTTCTGTTCTTACACGAATTTCATCGGATAATTGAGTTAAATTATTAATAGATGATTGAAATTCATTTACAATAGGTTGTATAAATTGTTTTGCTTCCATAGGACGTGGATATTGAATAGATAATTGTTCCAAGATTGGTATATGTGTATCAGCTAATACACGTCCTCGATTAATTTGTTCTGAAATATCAAAACGTATCTCTTCAATTTGATAACGATTCTCTGAAGTAATCTCTGGTAATTGATTTTTAACACGATTTAAATTAAATGTTATTAGTGATAAAGCTTTCTGTGCTGTATCTACGGCATTTAACAAACGTAAAGTTAAATTAATTTCTGTACGACATCGTACAGTTTCTTCTGTAAATGTTGTTAAACGTATCTCAAGTTGTTCATGA]
[+] EMBL CD197402             [                                                                                                                                                         GGGTAGGTTGTAATCGTTGTAAATTAATACATTGTTCTGTTCTTACACGAATTTCATCGGATAATTGAGTTAAATTATTAATAGATGATTGAAATTCATTTACAATAGGTTGTATAAATTGTTTTGCTTCCATAGGACGTGGATATTGAATAGATAATTGTTCCAAGATTGGTATATGTGTATCAGCTAATACACGTCCTCGATTAATTTGTTCTGAAATATCAAAACGTATCTCTTCAATTTGATAACGATTCTCTGAAGTAATCTCTGGTAATTGATTTTTAACACGATTTAAATTAAATGTTATTTGTGATAAAGCTTTCTGTGCTGTATCTACGGCATTTAACAAACGTAAAGTTAAATTAATTTCTGTACGACATCGTACAG                                            ]
[+] EMBL CD197322             [                                                                                                                                                         tGGTAGGTTGTAATCGTTGTAAATTAATACATTGTTCTGTTCTTACACGAATTTCATCGGATAATTGAGTTAAATTATTAATAGATGATTGAAATTCATTTACAATAGGTTGTATAAATTGTTTTGCTTCCGTAGGACGTGGATATTGAATAGATAATTGTTCCAAGATTGGTATATGTGTATCAGCTAATACACGTCCTCGATTAATTTGTTCTGAAATATCAAAACGTATCTCTTCAATTTGATAACGATTCTCTGAAGTAATCTCTGGTAATTGATTTTTAACACGATTTAAATTAAATGTTATTTGTGATCAAGCTTTCTGTGCTGTATCTACGGCATTTAACAAACGTAAAGTTCAATTAATTTCTGTA                                                         ]




>consensus_6190#0
CATCTGGTGGAAGACCAGAATCAAACATTGTCTCCATAATAATCTTTTTACCTTCTTCTA
TAGTTATATTTTCTAATGGTTTAATAATTATTGGTGGTTTTGCTTTTGTTGGCATTTTAA
CTGTTGTTGCTTTAACTTGATCATCATATATATGGGTAGGTTGTAATCGTTGTAAATTAA
TACATTGTTCTGTTCTTACACGAATTTCATCGGATAATTGAGTTAAATTATTAATAGATG
ATTGAAATTCATTTACAATAGGTTGTATAAATTGTTTTGCTTCCATAGGACGTGGATATT
GAATAGATAATTGTTCCAAGATTGGTATATGTGTATCAGCTAATACACGTCCTCGATTAA
TTTGTTCTGAAATATCAAAACGTATCTCTTCAATTTGATAACGATTCTCTGAAGTAATCT
CTGGTAATTGATTTTTAACACGATTTAAATTAAATGTTATTTGTGATAAAGCTTTCTGTG
CTGTATCTACGGCATTTAACAAACGTAAAGTTAAATTAATTTCTGTACGACATCGTACAG
TTTCTTCTGTAAATGTTGTTAAACGTATCTCAAGTTGTTCATGA

clustalw multiple alignements is not computed in this case