cluster # 6197

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Schistosoma mansoni
cluster # 6197 cluster # 6197 Sequences # 4 consensus # 2

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consensus_6197#0 length = 1058 sequences # 2

consensus_6197#1 length = 692 sequences # 2

consensusID : consensus_6197#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1058
fasta sequence

                              [AATTATAATTTAATTTAAATTACTTAATTATACACAAATTATTGATTTTAATAAAATATTATATTCATCAATTATTCAACAAAAAATCAATGATGCAGTAAAGTATGTAATAATTTAATTGATTATTATTATCATTTGTTATTAATTGATTGATTATTGATTTATTGATTAATGAATGATATTGTGTTTTTTTAATTGATTGATTATTCAAAATATTGGATACTATTTATTAACTTAATTGCTTACGTCTGTTACCCCTCGTGGAGGAGCATAGGCTGCAAACACTAGTATTCTCCATTTAACCCTATCCTGAGCAATCCTTTTCAGTTCTTTCCAGGTAAGATTCATCCTTTTCGTATCTGCTTTAATCTCCCGGCGTAATGTGTTCTTTGGCATTCCTCTTTTCCTCTTCCCTTCCGGATTCCAAGTTAGGGATTGCCTCGTGATGCAGTTTGGTGATTTCCTTAATATATGTCTTATCCACTTCCAACGTCTTTTCTTAATTTCTTCTTCAACTGGAAGCTGGTTTGTCCTCTCTCATAAAACGCTGTTGCTGATGGTATCAGGCCAGTGAATATTGAGTAATTTGCTTAGACAGCTGTTTAAAAATAATTGTATCTTCTTGACAATGGATGTAGTAGTTCTTCACGTTTCAGCTCCGTATAGTAGGACTGCCTTGACGTTCGTATTGAAGATTCTCACTTTGAAATTAGTTGACAGTTGTTTTGAGTTCCATATGTTCTTCAATTGTTGGATACTATTTAGTAATTAATTAATCGATGATATTATAGTTCATATAGTTCAGTAGTAAAGATTCAAACAATGAGGTTGTAGTGAGTTAGGATCTTACTTCATTTAAATCATATGAATGATTGTTGTCAAAATATACATCCTGTCTATCCTCGCATGCAATTAAGGACTTAAACCACGTTTATGAATAAGGCAGTTAAAATAAGTCAAATACGAGATAAGATTTTGAATACATATATTTTGTACATTCATTGATCTGGAGAGGAAATCAGAGGGATGAAGCGAATAGAAGAGAGAGAAGCAATAAC]

[+] EMBL CD073520             [AATTATAATTTAATTTAAATTACTTAATTATACACAAATTATTGATTTTAATAAAATATTATATTCATCAATTATTCAACAAAAAATCAATGATGCAGTAAAGTATGTAATAATTTAATTGATTATTATTATCATTTGTTATTAATTGATTGATTATTGATTTATTGATTAATGAATGATATTGTGTTTTTTTAATTGATTGATTATTCAAAATATTGGATACTATTTATTAACTTAATTGCTTACGTCTGTTACCCCTCGTGGAGGAGCATAGGCTGCAAACACTAGTATTCTCCATTTAACCCTATCCTGAGCAATCCTTTTCAGTTCTTTCCAGGTAAGATTCATCCTTTTCGTATCTGCTTTAATCTCCCGGCGTAATGTGTTCTTTGGCATTCCTCTTTTCCTCTTCCCTTCCGGATTCCAAGTTAGGGATTGCCTCGTGATGCAGTTTGGTGATTTCCTTAATATATGTCTTATCCACTTCCAACGTCTTTTCTTAATTTCTTCTTCAACTGGAAGCTGGTTTGTCCTCTCTCATAAAACGCTGTTGCTGATGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD079065             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CAACGTCTTTTCTTAATTTCTTCTTCAGCTGGAAGCTGGTTTGTCCTCTCTCATAAAACGCTGTTGCTGATGGTATCAGGCCAGTGAATATTGAGTAATTTGCTTAGACAGCTGTTTAAAAATAATTGTATCTTCTTGACAATGGATGTAGTAGTTCTTCACGTTTCAGCTCCGTATAGTAGGACTGCCTTGACGTTCGTATTGAAGATTCTCACTTTGAAATTAGTTGACAGTTGTTTTGAGTTCCATATGTTCTTCAATTGTTGGATACTATTTAGTAATTAATTAATCGATGATATTATAGTTCATATAGTTCAGTAGTAAAGATTCAAACAATGAGGTTGTAGTGAGTTAGGATCTTACTTCATTTAAATCATATGAATGATTGTTGTCAAAATATACATCCTGTCTATCCTCGCATGCAATTAAGGACTTAAACCACGTTTATGAATAAGGCAGTTAAAATAAGTCAAATACGAGATAAGATTTTGAATACATATATTTTGTACATTCATTGATCTGGAGAGGAAATCAGAGGGATGAAGCGAATAGAAGAGAGAGAAGCAATAAC]




>consensus_6197#0
AATTATAATTTAATTTAAATTACTTAATTATACACAAATTATTGATTTTAATAAAATATT
ATATTCATCAATTATTCAACAAAAAATCAATGATGCAGTAAAGTATGTAATAATTTAATT
GATTATTATTATCATTTGTTATTAATTGATTGATTATTGATTTATTGATTAATGAATGAT
ATTGTGTTTTTTTAATTGATTGATTATTCAAAATATTGGATACTATTTATTAACTTAATT
GCTTACGTCTGTTACCCCTCGTGGAGGAGCATAGGCTGCAAACACTAGTATTCTCCATTT
AACCCTATCCTGAGCAATCCTTTTCAGTTCTTTCCAGGTAAGATTCATCCTTTTCGTATC
TGCTTTAATCTCCCGGCGTAATGTGTTCTTTGGCATTCCTCTTTTCCTCTTCCCTTCCGG
ATTCCAAGTTAGGGATTGCCTCGTGATGCAGTTTGGTGATTTCCTTAATATATGTCTTAT
CCACTTCCAACGTCTTTTCTTAATTTCTTCTTCAACTGGAAGCTGGTTTGTCCTCTCTCA
TAAAACGCTGTTGCTGATGGTATCAGGCCAGTGAATATTGAGTAATTTGCTTAGACAGCT
GTTTAAAAATAATTGTATCTTCTTGACAATGGATGTAGTAGTTCTTCACGTTTCAGCTCC
GTATAGTAGGACTGCCTTGACGTTCGTATTGAAGATTCTCACTTTGAAATTAGTTGACAG
TTGTTTTGAGTTCCATATGTTCTTCAATTGTTGGATACTATTTAGTAATTAATTAATCGA
TGATATTATAGTTCATATAGTTCAGTAGTAAAGATTCAAACAATGAGGTTGTAGTGAGTT
AGGATCTTACTTCATTTAAATCATATGAATGATTGTTGTCAAAATATACATCCTGTCTAT
CCTCGCATGCAATTAAGGACTTAAACCACGTTTATGAATAAGGCAGTTAAAATAAGTCAA
ATACGAGATAAGATTTTGAATACATATATTTTGTACATTCATTGATCTGGAGAGGAAATC
AGAGGGATGAAGCGAATAGAAGAGAGAGAAGCAATAAC

consensusID : consensus_6197#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 692
fasta sequence

                              [GGGCCCGCATCAGTTGGTGCATTAGATAATCAATATTTACCTAATGATAATACATTAGATCATATAGATTATACATTATCATCAACTATACCCCGTTCA-TTGATTATTAA-TGGTGAACAACCACCACCTAGTTACAATTCATCATCTTAACAAAAATACAACTAAGATATTGATTTCTATCTAAAATTAGCATTTCTAGCTTATTATCCCCCCCTCTTTTATAATGACTATTTAAAAAAATTTTTTTAGAAAATCATCCCTAACAATTTCTTGCCCCCCCTCGTAATGGGACCAAAAATGGATTCCATCTTATCATTTTCTTCTTCTTGATCAACTTAGTAACTGTTTACAATATTGAAACATAATTGAAGGAACAAAAAGAGAATATTATTTTAAAGAATGTAAATATAAATGAAAGCAATAAATCATCTAATCACTAACAAGTTATGTAATCACCATGGTTAGCGTTTATTTTGGCCAGTTGATTTTCTACGGGATGGGGTCGCTAACCCCATACCCAACCCTCCTCCTTTACCCGGGCTTGGGACCGGCAGTAGCCCTCGTAGGAGCTACAGGCGGAGTTATGTAATCACCATGGTAATGTTCAAATATTCTTCATTATTTCCTTAGGTAAGATTAGTTATTTGATATTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTAAAGTTCCTTCATATGATAT]

[+] EMBL CD079712             [GGGCCCGCATCAGTTGGTGCATTAGATAATCAATATTTACCTAATGATAATACATTAGATCATATAGATTATACATTATCATCAACTATACCCCGTTCA TTGATTATTAA TGGTGAACAACCACCACCTAGTTACAATTCATCATCTTAACAAAAATACAACTAAGATATTGATTTCTATCTAAAATTAGCATTTCTAGCTTATTATCCCCCCCTCTTTTATAATGACTATTTAAAAAAATTTTTTTAGAAAATCATCCCTAACAATTTCTTGCCCCCCCTCGTAATGGGACCAAAAATGGATTCCATCTTATCATTTTCTTCTTCTTGATCAACTTAGTAACTGTTTACAATATTGAAACATAATTGAAGGAACAAAAAGAGAATATTATTTTAAAGAATGTAAATATAAATGAAAGCAATAAATCATCTAATCACTAACAAGTTATGTAATCACCATGGTTAGCGTTTATTTTGGCCAGTTGATTTTCTACGGGATGGGGTCGCTAACCCCATACCCAACCCTCCTCCTTTACCCGGGCTTGGGACCGGCAGTAGCCCTCGTAGGAGCTACAGGCGGAGTTATGTAATCACCATGGTAATGTTCAAATATTCTTCATTATTTCCTTAGGTAAGATTAGTTATTTGATATTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTAAAGTTCCTTCATATGATAT]
[+] EMBL CD079722             [                                                                                                TCACTTGATCANTAACTGGTGAACAACCACCACCTAGTTACAATTCATCATCTTAACAAAAATACAACTAAGATATTGATTTCTATCTAAAATTAGCATTTCTAGCTTATTATCCCCCCCTCTTTTATAATGACTATTTAAAAAAATTTTTTTAGAAAATCATCCCTAACAATTTCTTGCCCCCCCTCGTAATGGGACCAAAAATGGATTCCATCTTATCATTTTCTTCTTCTTGATCAACTTAGTAACTGTTTACAATATTGAAACATAATTGAAGGAACAAAAAGAGAATATTATTTTAAAGAATGTAAATATAAATGAAAGCAATAAATCATCTAATCACTAACAAGTTATGTAATCACCATGGCTAGCGTTTATTTTGGCCAGTTGATTTTCTACGGGATGGGGTCGCTAACCCCATACCCAACCCTCCTCCTTTACCCGGGCTTGGGACCGGCAGTAGCCCTCGTAGGAGCTACAGGCGGAGTTATGTta                                                                                                       ]




>consensus_6197#1
GGGCCCGCATCAGTTGGTGCATTAGATAATCAATATTTACCTAATGATAATACATTAGAT
CATATAGATTATACATTATCATCAACTATACCCCGTTCATTGATTATTAATGGTGAACAA
CCACCACCTAGTTACAATTCATCATCTTAACAAAAATACAACTAAGATATTGATTTCTAT
CTAAAATTAGCATTTCTAGCTTATTATCCCCCCCTCTTTTATAATGACTATTTAAAAAAA
TTTTTTTAGAAAATCATCCCTAACAATTTCTTGCCCCCCCTCGTAATGGGACCAAAAATG
GATTCCATCTTATCATTTTCTTCTTCTTGATCAACTTAGTAACTGTTTACAATATTGAAA
CATAATTGAAGGAACAAAAAGAGAATATTATTTTAAAGAATGTAAATATAAATGAAAGCA
ATAAATCATCTAATCACTAACAAGTTATGTAATCACCATGGTTAGCGTTTATTTTGGCCA
GTTGATTTTCTACGGGATGGGGTCGCTAACCCCATACCCAACCCTCCTCCTTTACCCGGG
CTTGGGACCGGCAGTAGCCCTCGTAGGAGCTACAGGCGGAGTTATGTAATCACCATGGTA
ATGTTCAAATATTCTTCATTATTTCCTTAGGTAAGATTAGTTATTTGATATTTTGTTGTT
GTTGTTGTTGTTAAAGTTCCTTCATATGATAT

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_6197#0      AATTATAATTTAATTTAAATTACTTAATTATACACAAATTATTGATTTTAATAAAATATT 60
consensus_6197#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6197#0      ATATTCATCAATTATTCAACAAAAAATCAATGATGCAGTAAAGTATGTAATAATTTAATT 120
consensus_6197#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6197#0      GATTATTATTATCATTTGTTATTAATTGATTGATTATTGATTTATTGATTAATGAATGAT 180
consensus_6197#1      ------------GGGCCCGCATCAGTTGGTGCATTAGATAATCAATATTTACCTAATGAT 48
                                          ** * *** *  ****   * * * *  ***   ******

consensus_6197#0      ATTGTGTTTTTTTAATTGATTGATTATTCAAAATATTGGATACTATTTATTAACTTAATT 240
consensus_6197#1      AATACATTA------------GATCATATAGATTAT---ACATTATC-ATCAACTATACC 92
                      * *   **             *** **  * * ***   * * ***  ** ****  *  

consensus_6197#0      GCTTACGTCTGTTACCCCTCGTGGAGGAGCATAGGCTGCAAACACTAGTATTCTCCATTT 300
consensus_6197#1      CCGTTCATTGATTATTAATGGTGAACAACCACCACCTAGTTACA-----ATTCATCATCT 147
                       * * * *   ***    * *** *  * **    **    ***     ****  *** *

consensus_6197#0      AACCCTATCCTGAGCAATCCTTTTCAGTTCTTTCCAGGTAAGATTCATCCTTTTCGTATC 360
consensus_6197#1      TAACAAAAATACAACTAAGATATTGATTTCTATC----TAAAATTAGCATTTCTAGCTTA 203
                       * *  *     * * *   * ** * **** **    *** ***     ** * *  * 

consensus_6197#0      TGCTTTAATCTCCCGGCGTAATGTGTTCTTTGGCATTCCTCTTTTCCTCTTCCCTTCCGG 420
consensus_6197#1      TTATCCCCCCCTCTTTTATAATG-ACTATTTAAAAAAATTTTTTTAGAAAATCATCCCTA 262
                      *  *     *  *     *****   * ***   *    * ****       * * **  

consensus_6197#0      ATTCCAAGTTAGGGATTGCCTCGTGATGCAGTTTGGTGATTTCCTTAATATATGTCTTAT 480
consensus_6197#1      A--CAATTTCTTGCCCCCCCTCGTAATG-GGACCAAAAATGGATTCCATCTTATCATTTT 319
                      *  * *  *   *     ****** ***  *       **    *  ** *     ** *

consensus_6197#0      CCACTTCCAACGTCTTTTCTTAATTTCTTCTTCAACTGGAAGCTGGTTTGTCCTCTCTCA 540
consensus_6197#1      CTTCTTCTTGATCAACTTAGTAACTGTTTACAATATTGAAACATAATTGAAG-----GAA 374
                      *  ****         **  *** *  **     * ** **  *  **           *

consensus_6197#0      TAAAACGCTGTTGCTGATGGTATCAGGCCAGTGAATATTGAGTAATTTGCTTAGACAGCT 600
consensus_6197#1      CAAAAAGAGAATATTATTT---TAAAGAATGTAAATATAAATGAAAGCAATAAATCATCT 431
                       **** *    *  *  *    * * *   ** *****  *  **     * *  ** **

consensus_6197#0      GTTTAAAAATAATTGTATCTTCTTGACAATGGATGTAGTAGTTCTTCACGTTTCAGCTCC 660
consensus_6197#1      AATCACTAACAAGT-TATGTAATC-ACCATGGTTAGCGTTTATTTTGGCCAGTTGATTTT 489
                        * *  ** ** * *** *  *  ** **** *   **   * **  *   *    *  

consensus_6197#0      GTATAGTAGGACTGCCTTGACGTTCGTATTGAAGATTCTCACTTTGAAATTAGTTGACAG 720
consensus_6197#1      CTACGGGATGGGGTCGCTAAC-CCCATACCCAACCCTCCTCCTTTACCCGGGCTTGGGAC 548
                       **  * * *    *  * **   * **   **   **   ****        ***  * 

consensus_6197#0      TTGTTTTGAGTTCCATATGTTCTTCAATTGTTGGATACTATTTAGTAATTAATTAATCGA 780
consensus_6197#1      CGGCAGTAGCCCTCGTAGGAGCTACA---GGCGGA-GTTATGTAATCACCATGGTAATGT 604
                        *   *      * ** *  ** **   *  ***   *** ** * *  *    *  * 

consensus_6197#0      TGATATTATAGTTCATATAGTTCAGTAGTAAAGATTCAAACAATGAGGTTGTAGTGAGTT 840
consensus_6197#1      TCA-AATATTCTTCAT-TATTTCCTTAGGTAAGATT-AGTTATTTGATATTTTGTTGTTG 661
                      * * * ***  ***** ** ***  ***  ****** *   * *     * * **   * 

consensus_6197#0      AGGATCTTACTTCATTTAAATCATATGA-ATGATTGTTGTCAAAATATACATCCTGTCTA 899
consensus_6197#1      TTGTTGTTGTTAAAGTTCCTTCATATGATAT----------------------------- 692
                        * * **  *  * **   ******** **                             

consensus_6197#0      TCCTCGCATGCAATTAAGGACTTAAACCACGTTTATGAATAAGGCAGTTAAAATAAGTCA 959
consensus_6197#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6197#0      AATACGAGATAAGATTTTGAATACATATATTTTGTACATTCATTGATCTGGAGAGGAAAT 1019
consensus_6197#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6197#0      CAGAGGGATGAAGCGAATAGAAGAGAGAGAAGCAATAAC 1058
consensus_6197#1      ---------------------------------------