cluster # 6198

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Schistosoma mansoni
cluster # 6198 cluster # 6198 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6198#0 length = 526 sequences # 4

consensusID : consensus_6198#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 526
fasta sequence

                              [GAAAAGTGAAATGTGTAAAATTGTAAAACATCAATTGGCATTAAAATATTTTGAAGCTGCAATAAATACATCATATACAGGGTATAAATCTTATGTATGGAGACAAATTCATAATGATGAACTATATGGAGTAATGCTTATTTTAGATCCTAAACAAGGTAATGAACGAGATGAAATGCATCAGATTCTTAGAGCATCCACTTATCAAAGAGATATTTGTGCTAGTCTCTTATTGGAATCAGGAAATAATGAACGTTTACGATATATTCGATTACATAATGGTCCAGATAAATCACTTTCTGAATTAATTAAAAATTTAATGATGAGACAATTTGTAGAAGAGAGTACTCAACTTTATTTATGTACTGAATATAAAGCAGCTGGTGTACACAATGTTGCAATATTTGCTAACCAGCTATCTCTGAAACATTTCGTCAATACAGGATTCGAGATGGTTGAATGTGGTTCAAAGTTGTATGAAGTATGTGGGAATAGTTGGTTCAAGAACCGGTGCCTAATGGTCAGG]

[+] EMBL CD133157             [GAAAAGTGAAATGTGTAAAATTGTAAAACATCAATTGGCATTAAAATATTTTGAAGCTGCAATAAATACATCATATACAGGGTATAAATCTTATGTATGGAGACAAATTCATAATGATGAACTATATGGAGTAATGCTTATTTTAGATCCTAAACAAGGTAATGAACGAGATGAAATGCATCAGATTCTTAGAGCATCCACTTATCAAAGAGATATTTGTGCTAGTCTCTTATTGGAATCAGGAAATAATGAACGTTTACGATATATTCGATTACATAATGGTCCAGATAAATCACTTTCTGAATTAATTAAAAATTTAATGATGAGACAATTTGTAGAAGAGAGTACTCAACTTTATTTATGTACTGAATATAAAGCAGCTGGTGTACGCAATGTTGCAATATTTGCTAACCAGCTATCTCTGAAACATTTCGTCAATACAGGATTCGAGATGGTTGAATGTGGTTCAAAGTTGTATGAAGTATGTGGGAATAGTTGGTTCAAGAACCGGTGCCTAATGGTCAGG]
[+] EMBL CD188810             [GAAAAGTGAAATGTGTAAAATTGTAAAACATCAATTGGCATTAAAATATTTTGAAGCTGCAATAAATACATCATATACAGGGTATAAATCTTATGTATGGAGACAAATTCATAATGATGAACTATATGGAGTAATGCTTATTTTAGATCCTAAACAAGGTAATGAACGAGATGAAATGCATCAGATTCTTAGAGCATCCACTTATCAAAGAGATATTTGTGCTAGTCTCTTATTGGAATCAGGAAATAATGAACGTTTACGATATATTCGATTACATAATGGTCCAGATAAATCACTTTCTGAATTAATTAAAAATTTAATGATGAGACAATTTGTAGAAGAGAGTACTCAACTTTATTTATGTACTGAATATAAAGCAGCTGGTGTACACATTGTTGCAATATTTGCTAACCAGCTATCTCTGAAACATTTCGTCAATACAGGATTCGAGATGGTTGAATGCGGTTCAAAGTTTGATGAAGTATG GGGAATAATTGGTTCAAG ACCGGTc             ]
[-] EMBL CD190249             [                            CATCAATTGGCACTAAAATATTTTGAAGCTGCAATAAATACATCATATACAGGGTATAAATCTTATGTATGGAGACAAATTCATAATGATGAACTATATGGAGTAATGCTTATTTTAGATCCTAAACAAGGTAATGAACGAGATGAAATGCATCAGATTCTTAGAGCATCCACTTATCAAAGAGATATTTGTGCTAGTCTCTTATTGGAATCAGGAAATAATGAACGTTTACGATATATTCGATTACATAATGGTCCAGATAAATCACTTTCTGAATTAATTAAAAATTTAATGATGAGACAATTTGTAGAAGAGAGTACTCAACTTTATTTATGTACTGAATATAAAGCAGCTGGTGTACACAATGTTGCAATATTTGCTAACCAGCTATCTCTGAAACATTTCGTCAATACAGGATTCGAGATGGTTGAATGTGGTTCAAAGTTGTATGAAGTATGTGGGAATAGTTGGTTCAAGAACCGGT              ]
[+] EMBL CD133308             [                                                                                                                                                                             AAATGCATCAGATTCTTAGAGCATCCACTTATCAAAGAGATATTTGTGCTAGTCTCTTATTGGAATCAGGAAATAATGAACGTTTACGATATATTCGATTACATAATGGTCCAGATAAATCACTTTCTGAATTAATTAAAAATTTAATGATGAGACAATTTGTAGAAGAGAGTACTCAACTTTATTTATGTACTGAATATAAAGCAGCTGGTGTACACAATGTTGCAATATTTGCTAACCAGCTATCTCTGAAACATTTCGTCAATACAGGATTCGAGATGGTTGAATGTGGTTCAAAGTTGTATGAAGTATGTGGGAATAGTTGGTTCAAGAACCGG               ]




>consensus_6198#0
GAAAAGTGAAATGTGTAAAATTGTAAAACATCAATTGGCATTAAAATATTTTGAAGCTGC
AATAAATACATCATATACAGGGTATAAATCTTATGTATGGAGACAAATTCATAATGATGA
ACTATATGGAGTAATGCTTATTTTAGATCCTAAACAAGGTAATGAACGAGATGAAATGCA
TCAGATTCTTAGAGCATCCACTTATCAAAGAGATATTTGTGCTAGTCTCTTATTGGAATC
AGGAAATAATGAACGTTTACGATATATTCGATTACATAATGGTCCAGATAAATCACTTTC
TGAATTAATTAAAAATTTAATGATGAGACAATTTGTAGAAGAGAGTACTCAACTTTATTT
ATGTACTGAATATAAAGCAGCTGGTGTACACAATGTTGCAATATTTGCTAACCAGCTATC
TCTGAAACATTTCGTCAATACAGGATTCGAGATGGTTGAATGTGGTTCAAAGTTGTATGA
AGTATGTGGGAATAGTTGGTTCAAGAACCGGTGCCTAATGGTCAGG

clustalw multiple alignements is not computed in this case