Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 6201 cluster # 6201       Sequences # 4       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6201#0 length = 1056 sequences # 4  
consensusID : consensus_6201#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1056
fasta sequence 
                              [CTGTATTTCTTCATGTGTGGCTGATTTCATGGGTTCCGTTATCGTAGTAGTTAGCGCACTTGTGTTATTGTTAGTCCCTGGTGAGGTTTCCAAAGGCGAAGCATTATGGAAGTTGTACATTGATCCATCTATGAGCATGCTCATGGTTACTATAATCTTGATTACTGCTATACCCCTCATGTACAAAGCTACATTAATTTTATTACAATCTGTTCCTAGTGAGATTTGTTTAACAAATCTGAAAACTCGTATGGAAAATATTGATGGAATTCATAAAATTCATGATCTGCATGTATGGCGTTTACAAAGCAATTGTATTATTGGAACTGTTCACATTCGTTGTGTTAGCCTACCGGACTATTTAAGTATTGCTCGTGAAGTGAAACAACTATTCCACGAATTCAATATACATTGTACAACAATACAACCGGAATTCGAAGAGAACATTGAAGGATCAACGGCAAATACAGATTATCGCACATGCGTATTGGATTGTGGTCCAAATAAGAACTGTCAATCAGATACTTGTTGTCCAGCATCTAATGTCACAGAAGTACAATTTGTCCCTTCAAATTTACATTCTGCATCACAGAATTCTTTCAATTTGCTACAAAACAACACTTCTAACACATCTAAAAATGAACAGGATAATTTACCCAACAATGACGTACACATTAATCTTTCAAAAATTTCTGGTAGTTGATTTAATTAACATTTTTTTTTACATACCAATAAATATGTAAATGTATGAGATATTTTGCGTTGATGTTTTATTATGTCACTTTGATCTCAGTAAAACAAAACCCAGATATGAAGAATTTCCCCTGTGTATTCTAATTTTTTTGATCAGTCTGCTCAAAATTCTTTCAACTGCAGCCAATTATTACATCTGTATACATCCGCATATATTCATAATAATCTACAAATATGTAGTTGTGTATAAAGAGTAAATTATTCTCATTAATTATTAATCAAGTCTAGTTTAGGCAACGCTTGGACGATGAATACATTTGTTATTTGTTTATTTTTTAGTGTATTATATAAAATTTTTGTATA]

[+] EMBL CD063859             [CTGTATTTCTTCATGTGTGGCTGATTTCATGGGTTCCGTTATCGTAGTAGTTAGCGCACTTGTGTTATTGTTAGTCCCTGGTGAGGTTTCCAAAGGCGAAGCATTATGGAAGTTGTACATTGATCCATCTATGAGCATGCTCATGGTTACTATAATCTTGATTACTGCTATACCCCTCATGTACAAAGCTACATTAATTTTATTACAATCTGTTCCTAGTGAGATTTGTTTAACAAATCTGAAAACTCGTATGGAAAATATTGATGGAATTCATAAAATTCATGATCTGCATGTATGGCGTTTACAAAGCAATTGTATTATTGGAACTGTTCACATTCGTTGTGTTAGCCTACCGGACTATTTAAGTATTGCTCGTGAAGTGAAACAACTATTCCACGAATTCAATATACATTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD161433             [                                                                                                                                                                                             TACATTAATTTTATTACAATCTGTTCCTAGTGAGATTTGTTTAACAAATCTGAAAACTCGTATGGAAAATATTGATGGAATTCATAAAATTCATGATCTGCATGTATGGCGTTTACAAAGCAATTGTATTATTGGAACTGTTCACATTCGTTGTGTTAGCCTACCGGACTATTTAAGTATTGCTCGTGAAGTGAAACAACTATTCCACGAATTCAATATACATTGTACAACAATACAACCGGAATTCGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD136858             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CTATTCCACGAATTCAATATACATTGTACAACAATACAACCGGAATTCGAAGAGAACATTGAAGGATCAACGGCAAATACAGATTATCGCACATGCGTATTGGATTGTGGTCCAAATAAGAACTGTCAATCAGATACTTGTTGTCCAGCATCTAATGTCACAGAAGTACAATTTGTCCCTTCAAATTTACATTCTGCATCACAGAATTCTTTCAATTTGCTACAAAACAACACTTCTAACACATCTAAAAATGAACAGGATAATTTACCCAACAATGACGTACACATTAATCTTTCAAAAATTTCTGGTAGTTGATTTAATTAACATTTTTTTTTACATACCAATAAATATGTAAATGTATGAGATATTTTGCGTTGATGTTTTATTATGTCACTTTGATCTCAGTAAAAC                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD082401             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AGGATCAACGTCAATTACAGATTATAAACCATGCGTATTGGATTGTGGTCCAAATAAGAACTGTCAATCAGATACTTGTTGTCCAGCATCTAATGTCACAGAAGTACAATTTGTCCCTTCAAATTTACATTCTGCATCACAGAATTCTTTCAATTTGCTACAAAACATCTCTTCTAACACATCTAAAAATGAACAGGATAATTTACCCAACAATGACGTACACATTAATCTTTCAAAAATTTCTGGTAGTTGATTTAATTAACATTTTTTTTTACATACCAATAAATATGTAAATGTATGAGATATTTTGCGTTGATGTTTTATTATGTCACTTTGATCTCAGTAAAACAAAACCCAGATATGAAGAATTTCCCCTGTGTATTCTAATTTTTTTGATCAGTCTGCTCAAAATTCTTTCAACTGCAGCCAATTATTACATCTGTATACATCCGCATATATTCATAATAATCTACAAATATGTAGTTGTGTATAAAGAGTAAATTATTCTCATTAATTATTAATCAAGTCTAGTTTAGGCAACGCTTGGACGATGAATACATTTGTTATTTGTTTATTTTTTAGTGTATTATATAAAATTTTTGTATA]




>consensus_6201#0
CTGTATTTCTTCATGTGTGGCTGATTTCATGGGTTCCGTTATCGTAGTAGTTAGCGCACT
TGTGTTATTGTTAGTCCCTGGTGAGGTTTCCAAAGGCGAAGCATTATGGAAGTTGTACAT
TGATCCATCTATGAGCATGCTCATGGTTACTATAATCTTGATTACTGCTATACCCCTCAT
GTACAAAGCTACATTAATTTTATTACAATCTGTTCCTAGTGAGATTTGTTTAACAAATCT
GAAAACTCGTATGGAAAATATTGATGGAATTCATAAAATTCATGATCTGCATGTATGGCG
TTTACAAAGCAATTGTATTATTGGAACTGTTCACATTCGTTGTGTTAGCCTACCGGACTA
TTTAAGTATTGCTCGTGAAGTGAAACAACTATTCCACGAATTCAATATACATTGTACAAC
AATACAACCGGAATTCGAAGAGAACATTGAAGGATCAACGGCAAATACAGATTATCGCAC
ATGCGTATTGGATTGTGGTCCAAATAAGAACTGTCAATCAGATACTTGTTGTCCAGCATC
TAATGTCACAGAAGTACAATTTGTCCCTTCAAATTTACATTCTGCATCACAGAATTCTTT
CAATTTGCTACAAAACAACACTTCTAACACATCTAAAAATGAACAGGATAATTTACCCAA
CAATGACGTACACATTAATCTTTCAAAAATTTCTGGTAGTTGATTTAATTAACATTTTTT
TTTACATACCAATAAATATGTAAATGTATGAGATATTTTGCGTTGATGTTTTATTATGTC
ACTTTGATCTCAGTAAAACAAAACCCAGATATGAAGAATTTCCCCTGTGTATTCTAATTT
TTTTGATCAGTCTGCTCAAAATTCTTTCAACTGCAGCCAATTATTACATCTGTATACATC
CGCATATATTCATAATAATCTACAAATATGTAGTTGTGTATAAAGAGTAAATTATTCTCA
TTAATTATTAATCAAGTCTAGTTTAGGCAACGCTTGGACGATGAATACATTTGTTATTTG
TTTATTTTTTAGTGTATTATATAAAATTTTTGTATA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)