Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 6217 cluster # 6217       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6217#0 length = 462 sequences # 4  

consensusID : consensus_6217#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 462
fasta sequence
                              [GAAGAATCTCCAACTCCAACACCATGTGTGTAAATTGGTTCTGGTTCAAGTTGACGCCTTAAAGCATCAAGATGTGCATGACGTTCATTTAAGCTTTTTGATGTAAAATGATCTTTACACTGTGTGCCTAAACTTAATCGTAAAAATTGTGTTTCTTCTGGTGACATATAGTCTACTTGTTTAACTGTTACTTTAAAAGTAGGTGTTGTTCCAGATGATACGTTAACTTTTAGCGATGGATGCTGTCGATCAACATCAACAAATAAAGATGGATCCTCTCTGGAATACCACATAGGCAACGGTCGACACATATT-AACTCCTAATGGCTTATATCCTTCTTGCAGTCCACAATAAGTAAAGAATTTCGGTGATTGAACATCATTTCCATAATTGATCTTGACTTGCTGTCCAGACCCAAGAGAAAATGCTGGCACATAAACTTCATCCACTTTTATATGTTTA]

[+] EMBL CD091109             [GAAGAATCTCCAACTCCAACACCATGTGTGTAAATTGGTTCTGGTTCAAGTTGACGCCTTAAAGCATCAAGATGTGCATGACGTTCATTTAAGCTTTTTGATGTAAAATGATCTTTACACTGTGTGCCTAAACTTAATCGTAAAAATTGTGTTTCTTCTGGTGACATATAGTCTACTTGTTTAACTGTTACTTTAAAAGTAGGTGTTGTTCCAGATGATACGTTAACTTTTAGCGATGGATGCTGTCGATCAACATCAACAAATAAAGATGGATCCTCTCTGGAATACCACATAGGCAACGGTCGACACATATT AACTCCTAATGGCTTATATCCTTCTTGCAGTCCACAATAAGTAAAGAATTTCGGTGATTGAACATCATTTCCATAATTGATCTTGACTTGCTGTCCAGACCCAAGAGAAAATGCTGGCACATAAACTTCATCCACTTTTATATGTTTA]
[+] EMBL CD091075             [GAAGAATCTCCAACTCCAACACCATGTGTGTAAATTGGTTCTGGTTCAAGTTGACGCCTTAAAGCATCAAGATGTGCATGACGTTCATTTAAGCTTTTTGATGTAAAATGATCTTTACACTGTGTGCCTAAACTTAATCGTAAAAATTGTGTTTCTTCTGGTGACATATAGTCTACTTGTTTAACTGTTACTTTAAAAGTAGGTGTTGTTCCAGATGATACGTTAACTTTTAGCGATGGATGCTGTCGATCAACATCAACAAATAAAGATGGATCCTCTCTGGAATACCACATAGGCAACGGTCGACACATATT AACTCCTAATGGCTTATATCCTTCTTGCAGTCCACAATAAGTAAAGAATTTCGGTGATTGAACATCATTTCCATAATTGATCTTGACTTGCTGTCCAGACCCAAGAGAAAATGCTGGCACATAACCTTC                   ]
[+] EMBL CD091120             [GAAGAATCTCCAACTCCAACACCATGTGTGTAAATTGGTTCTGGTTCAAGTTGACGCCTTAAAGCATCAAGATGTGCATGACGTTCATTTAAGCTTTTTGATGTAAAATGATCTTTACACTGTGTGCCTAAACTTAATCGTAAAAATTGTGTTTCTTCTGGTGACATATAGTCTACTTGTTTAACTGTTACTTTAAAAGTAGGTGTTGTTCCAGATGATACGTTAACTTTTAGCGATGGATGCTGTCGATCAACATCAACAAATAAAGATGGATCCTCTCTGGAATACCACATAGGCAACGGTCGACACATATT AACTCCTAATGGCTTATATCCTTCTTGCAGTCCACAATAAGTAAAGAATTTCGGTGATTGAACATCATTTCCATAATTGATCTTGACTTGCTGTCCAGAACCAAGGGAAAATGCTGGCACATA                         ]
[+] EMBL CD091098             [GAAGAATCTCCAACTCCAACACCATGTGTGTAAATTGGTTCTGGTTCAAGTTGACGCCTTAAAGCATCAAGATGTGCATGACGTTCATTTAAGCTTTTTGATGTAAAATGATCTTTACACTGTGTGCCTAAACTTAATCGTAAAAATTGTGTTTCTTCTGGTGACATATAGTCTACTTGTTTAACTGTTACTTTAAAAGTAGGTGTTGTTCCAGATGATACGTTAACTTTTAGCGATGGATGCTGTCGATCAACATCAACAAATAAAGATGGATCCTCTCTGGAATACCACATAGGCAACGGTCGACACATATTAAACTCCTAATGGCTTATATCCTTCTTGCAGTCCACAATAAGTAAAGAATTTCGGTGATTGAACATCATTTCCATAATTGATCTTGACTTGCTGTCCAGACCCAAGAGAAAATGCTGGC                              ]


>consensus_6217#0 GAAGAATCTCCAACTCCAACACCATGTGTGTAAATTGGTTCTGGTTCAAGTTGACGCCTT AAAGCATCAAGATGTGCATGACGTTCATTTAAGCTTTTTGATGTAAAATGATCTTTACAC TGTGTGCCTAAACTTAATCGTAAAAATTGTGTTTCTTCTGGTGACATATAGTCTACTTGT TTAACTGTTACTTTAAAAGTAGGTGTTGTTCCAGATGATACGTTAACTTTTAGCGATGGA TGCTGTCGATCAACATCAACAAATAAAGATGGATCCTCTCTGGAATACCACATAGGCAAC GGTCGACACATATTAACTCCTAATGGCTTATATCCTTCTTGCAGTCCACAATAAGTAAAG AATTTCGGTGATTGAACATCATTTCCATAATTGATCTTGACTTGCTGTCCAGACCCAAGA GAAAATGCTGGCACATAAACTTCATCCACTTTTATATGTTTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)