These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6217#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 462 fasta sequence [GAAGAATCTCCAACTCCAACACCATGTGTGTAAATTGGTTCTGGTTCAAGTTGACGCCTTAAAGCATCAAGATGTGCATGACGTTCATTTAAGCTTTTTGATGTAAAATGATCTTTACACTGTGTGCCTAAACTTAATCGTAAAAATTGTGTTTCTTCTGGTGACATATAGTCTACTTGTTTAACTGTTACTTTAAAAGTAGGTGTTGTTCCAGATGATACGTTAACTTTTAGCGATGGATGCTGTCGATCAACATCAACAAATAAAGATGGATCCTCTCTGGAATACCACATAGGCAACGGTCGACACATATT-AACTCCTAATGGCTTATATCCTTCTTGCAGTCCACAATAAGTAAAGAATTTCGGTGATTGAACATCATTTCCATAATTGATCTTGACTTGCTGTCCAGACCCAAGAGAAAATGCTGGCACATAAACTTCATCCACTTTTATATGTTTA] [+] EMBL CD091109 [GAAGAATCTCCAACTCCAACACCATGTGTGTAAATTGGTTCTGGTTCAAGTTGACGCCTTAAAGCATCAAGATGTGCATGACGTTCATTTAAGCTTTTTGATGTAAAATGATCTTTACACTGTGTGCCTAAACTTAATCGTAAAAATTGTGTTTCTTCTGGTGACATATAGTCTACTTGTTTAACTGTTACTTTAAAAGTAGGTGTTGTTCCAGATGATACGTTAACTTTTAGCGATGGATGCTGTCGATCAACATCAACAAATAAAGATGGATCCTCTCTGGAATACCACATAGGCAACGGTCGACACATATT AACTCCTAATGGCTTATATCCTTCTTGCAGTCCACAATAAGTAAAGAATTTCGGTGATTGAACATCATTTCCATAATTGATCTTGACTTGCTGTCCAGACCCAAGAGAAAATGCTGGCACATAAACTTCATCCACTTTTATATGTTTA] [+] EMBL CD091075 [GAAGAATCTCCAACTCCAACACCATGTGTGTAAATTGGTTCTGGTTCAAGTTGACGCCTTAAAGCATCAAGATGTGCATGACGTTCATTTAAGCTTTTTGATGTAAAATGATCTTTACACTGTGTGCCTAAACTTAATCGTAAAAATTGTGTTTCTTCTGGTGACATATAGTCTACTTGTTTAACTGTTACTTTAAAAGTAGGTGTTGTTCCAGATGATACGTTAACTTTTAGCGATGGATGCTGTCGATCAACATCAACAAATAAAGATGGATCCTCTCTGGAATACCACATAGGCAACGGTCGACACATATT AACTCCTAATGGCTTATATCCTTCTTGCAGTCCACAATAAGTAAAGAATTTCGGTGATTGAACATCATTTCCATAATTGATCTTGACTTGCTGTCCAGACCCAAGAGAAAATGCTGGCACATAACCTTC ] [+] EMBL CD091120 [GAAGAATCTCCAACTCCAACACCATGTGTGTAAATTGGTTCTGGTTCAAGTTGACGCCTTAAAGCATCAAGATGTGCATGACGTTCATTTAAGCTTTTTGATGTAAAATGATCTTTACACTGTGTGCCTAAACTTAATCGTAAAAATTGTGTTTCTTCTGGTGACATATAGTCTACTTGTTTAACTGTTACTTTAAAAGTAGGTGTTGTTCCAGATGATACGTTAACTTTTAGCGATGGATGCTGTCGATCAACATCAACAAATAAAGATGGATCCTCTCTGGAATACCACATAGGCAACGGTCGACACATATT AACTCCTAATGGCTTATATCCTTCTTGCAGTCCACAATAAGTAAAGAATTTCGGTGATTGAACATCATTTCCATAATTGATCTTGACTTGCTGTCCAGAACCAAGGGAAAATGCTGGCACATA ] [+] EMBL CD091098 [GAAGAATCTCCAACTCCAACACCATGTGTGTAAATTGGTTCTGGTTCAAGTTGACGCCTTAAAGCATCAAGATGTGCATGACGTTCATTTAAGCTTTTTGATGTAAAATGATCTTTACACTGTGTGCCTAAACTTAATCGTAAAAATTGTGTTTCTTCTGGTGACATATAGTCTACTTGTTTAACTGTTACTTTAAAAGTAGGTGTTGTTCCAGATGATACGTTAACTTTTAGCGATGGATGCTGTCGATCAACATCAACAAATAAAGATGGATCCTCTCTGGAATACCACATAGGCAACGGTCGACACATATTAAACTCCTAATGGCTTATATCCTTCTTGCAGTCCACAATAAGTAAAGAATTTCGGTGATTGAACATCATTTCCATAATTGATCTTGACTTGCTGTCCAGACCCAAGAGAAAATGCTGGC ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||