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Schistosoma mansoni
cluster # 6223 cluster # 6223       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6223#0 length = 940 sequences # 4  

consensusID : consensus_6223#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 940
fasta sequence
                              [TAAGAAAGTTTGATGCAATAAGCAAAACGTACCTGAAAATAAAAAGAATTTAAAAAACAAGTAATTATTTACACAGTCGAGCTGGAAGACATTATTGAATGAAGTGGAGAGGACATAGAAGACAGAAAATAGTATGCAATCAATTAATCTGCTTATTTCTTGACAAAAATAAATAAGAATATGATTATCACAATGCAGTACAGTCGATTTATTATTATTGATGTGGTGATGATGGTGAAAATCCAATAGGAGACATTGATGAAGAACTAGATGGTGAAAGTGTGCCGAATCCACGCCATTTCCATGAAGAAAGTGGATGATTTTTAATTTGTTCTTTACGC---TGTTGTTGTTGTTGTTCTGCTTTAATACNAGCTTTTTCCAATTTAGCTAATTTTTTCTGTTGGGCAAGTTCAGCTTTTTTAGCTTTAAAATTAGAAAACGATTTGAATATAGAAGGAATTTTGTTAGACGTATTTGATATTTCAGAGGTTTTATTTGACGGTACACGAGGTAACGTAGATACAGCATTAGAAAGTTGACTGTGTTTAATTGTATTACGATTGAGTGTTGCCTCTGAAGATGAACAAGAATCTGGTGAGTTTGAAACTCCTGGCAAAGTCGACTTTTCATCGTTTAAATTTATTTGTTCGTTTGTTTTACGAAATAATGTTGGCGAAACCGGTGCAGACAATGAATCCATACAAGAATAGGTATTATATTCCGAGTTTTCATAGCATGATTGTTTAGTTACTGTTTCATTTTCATATCGTTCAGCAATTTCAGTGGTTACATTAGAAGTAATAGAATTAAATTGACCATTGAATGACTTGTCTAAAGATTTAAATTTATTATTATGTAATTCCATTAAACGTTTTATTTCTTTTCTGCGTATTTCATATTTCATTTCAATACGTCTACGATAATCACTTTCTTCACGATT]

[+] EMBL CD183130             [TAAGAAAGTTTGATGCAATAAGCAAAACGTACCTGAAAATAAAAAGAATTTAAAAAACAAGTAATTATTTACACAGTCGAGCTGGAAGACATTATTGAATGAAGTGGAGAGGACATAGAAGACAGAAAATAGTATGCAATCAATTAATCTGCTTATTTCTTGACAAAAATAAATAAGAATATGATTATCACAATGCAGTACAGTCGATTTATTATTATTGATGTGGTGATGATGGT AAAATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD154771             [                                                                                                     AAGTGGGGAGGACATAGAAGACAGAAAATAGTATGCAATCAATTAATCTGCTTATTTCTTGACAAAAATAAATAAGAATATGATTATCACAATGCAGTACAGTCGATTTATTATTATTGATGTGGTGATGATGGTGAAAATCCAATAGGAGACATTGATGAAGAACTAGATGGTGAAAGTGTGCCGAATCCACGCCATTTCCATGAAGAAAGTGGATGATTTTTAATTTGTTCTTTACGCTGTTGTTGTTGTTGTTGTTCTGCTTTAATACNANCTCCNTCCTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD141346             [                                                                                                                          CAGAAAATAGTATGC ATCAATTAATCTGCTTA TTCTTGACAAAAATAAATAAGAATATGATTATCACAATGCAGTACAGTCGATTTATTATTATTGATGTGGTGATGATGGTGAAAATCCAATAGGAGACATTGATGAAGAACTAGATGGTGAAAGTGTGCCGAATCCACGCCATTTCCATGAAGAAAGTGGATGATTTTTAATTTGTTCTTTACGC   TGTTGTTGTTGTTGTTCTGCTTTAATACGAGCTTTTTCCAATTTAGCTAATTTTTTCTGTTGGGCAAGTTCAGCTTTTTTAGCTTTAAAATTAGAAAACGATTTGAATATAGAAGGAATTTTGTTAGACGTATTTGATATTTCAGAGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BF936548             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGTTGTTGTTCTGCTTTAATACCAGCTTTTTCCAATTTAGCTAATTTTTTCTGTTGGGCAAGTTCAGCTTTTTTAGCTTTAAAATTAGAAAACGATTTGAATATAGAAGGAATTTTGTTAGACGTATTTGATATTTCAGAGGTTTTATTTGACGGTACACGAGGTAACGTAGATACAGCATTAGAAAGTTGACTGTGTTTAATTGTATTACGATTGAGTGTTGCCTCTGAAGATGAACAAGAATCTGGTGAGTTTGAAACTCCTGGCAAAGTCGACTTTTCATCGTTTAAATTTATTTGTTCGTTTGTTTTACGAAATAATGTTGGCGAAACCGGTGCAGACAATGAATCCATACAAGAATAGGTATTATATTCCGAGTTTTCATAGCATGATTGTTTAGTTACTGTTTCATTTTCATATCGTTCAGCAATTTCAGTGGTTACATTAGAAGTAATAGAATTAAATTGACCATTGAATGACTTGTCTAAAGATTTAAATTTATTATTATGTAATTCCATTAAACGTTTTATTTCTTTTCTGCGTATTTCATATTTCATTTCAATACGTCTACGATAATCACTTTCTTCACGATT]


>consensus_6223#0 TAAGAAAGTTTGATGCAATAAGCAAAACGTACCTGAAAATAAAAAGAATTTAAAAAACAA GTAATTATTTACACAGTCGAGCTGGAAGACATTATTGAATGAAGTGGAGAGGACATAGAA GACAGAAAATAGTATGCAATCAATTAATCTGCTTATTTCTTGACAAAAATAAATAAGAAT ATGATTATCACAATGCAGTACAGTCGATTTATTATTATTGATGTGGTGATGATGGTGAAA ATCCAATAGGAGACATTGATGAAGAACTAGATGGTGAAAGTGTGCCGAATCCACGCCATT TCCATGAAGAAAGTGGATGATTTTTAATTTGTTCTTTACGCTGTTGTTGTTGTTGTTCTG CTTTAATACNAGCTTTTTCCAATTTAGCTAATTTTTTCTGTTGGGCAAGTTCAGCTTTTT TAGCTTTAAAATTAGAAAACGATTTGAATATAGAAGGAATTTTGTTAGACGTATTTGATA TTTCAGAGGTTTTATTTGACGGTACACGAGGTAACGTAGATACAGCATTAGAAAGTTGAC TGTGTTTAATTGTATTACGATTGAGTGTTGCCTCTGAAGATGAACAAGAATCTGGTGAGT TTGAAACTCCTGGCAAAGTCGACTTTTCATCGTTTAAATTTATTTGTTCGTTTGTTTTAC GAAATAATGTTGGCGAAACCGGTGCAGACAATGAATCCATACAAGAATAGGTATTATATT CCGAGTTTTCATAGCATGATTGTTTAGTTACTGTTTCATTTTCATATCGTTCAGCAATTT CAGTGGTTACATTAGAAGTAATAGAATTAAATTGACCATTGAATGACTTGTCTAAAGATT TAAATTTATTATTATGTAATTCCATTAAACGTTTTATTTCTTTTCTGCGTATTTCATATT TCATTTCAATACGTCTACGATAATCACTTTCTTCACGATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)