These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6223#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 940 fasta sequence [TAAGAAAGTTTGATGCAATAAGCAAAACGTACCTGAAAATAAAAAGAATTTAAAAAACAAGTAATTATTTACACAGTCGAGCTGGAAGACATTATTGAATGAAGTGGAGAGGACATAGAAGACAGAAAATAGTATGCAATCAATTAATCTGCTTATTTCTTGACAAAAATAAATAAGAATATGATTATCACAATGCAGTACAGTCGATTTATTATTATTGATGTGGTGATGATGGTGAAAATCCAATAGGAGACATTGATGAAGAACTAGATGGTGAAAGTGTGCCGAATCCACGCCATTTCCATGAAGAAAGTGGATGATTTTTAATTTGTTCTTTACGC---TGTTGTTGTTGTTGTTCTGCTTTAATACNAGCTTTTTCCAATTTAGCTAATTTTTTCTGTTGGGCAAGTTCAGCTTTTTTAGCTTTAAAATTAGAAAACGATTTGAATATAGAAGGAATTTTGTTAGACGTATTTGATATTTCAGAGGTTTTATTTGACGGTACACGAGGTAACGTAGATACAGCATTAGAAAGTTGACTGTGTTTAATTGTATTACGATTGAGTGTTGCCTCTGAAGATGAACAAGAATCTGGTGAGTTTGAAACTCCTGGCAAAGTCGACTTTTCATCGTTTAAATTTATTTGTTCGTTTGTTTTACGAAATAATGTTGGCGAAACCGGTGCAGACAATGAATCCATACAAGAATAGGTATTATATTCCGAGTTTTCATAGCATGATTGTTTAGTTACTGTTTCATTTTCATATCGTTCAGCAATTTCAGTGGTTACATTAGAAGTAATAGAATTAAATTGACCATTGAATGACTTGTCTAAAGATTTAAATTTATTATTATGTAATTCCATTAAACGTTTTATTTCTTTTCTGCGTATTTCATATTTCATTTCAATACGTCTACGATAATCACTTTCTTCACGATT] [+] EMBL CD183130 [TAAGAAAGTTTGATGCAATAAGCAAAACGTACCTGAAAATAAAAAGAATTTAAAAAACAAGTAATTATTTACACAGTCGAGCTGGAAGACATTATTGAATGAAGTGGAGAGGACATAGAAGACAGAAAATAGTATGCAATCAATTAATCTGCTTATTTCTTGACAAAAATAAATAAGAATATGATTATCACAATGCAGTACAGTCGATTTATTATTATTGATGTGGTGATGATGGT AAAATC ] [+] EMBL CD154771 [ AAGTGGGGAGGACATAGAAGACAGAAAATAGTATGCAATCAATTAATCTGCTTATTTCTTGACAAAAATAAATAAGAATATGATTATCACAATGCAGTACAGTCGATTTATTATTATTGATGTGGTGATGATGGTGAAAATCCAATAGGAGACATTGATGAAGAACTAGATGGTGAAAGTGTGCCGAATCCACGCCATTTCCATGAAGAAAGTGGATGATTTTTAATTTGTTCTTTACGCTGTTGTTGTTGTTGTTGTTCTGCTTTAATACNANCTCCNTCCTAT ] [-] EMBL CD141346 [ CAGAAAATAGTATGC ATCAATTAATCTGCTTA TTCTTGACAAAAATAAATAAGAATATGATTATCACAATGCAGTACAGTCGATTTATTATTATTGATGTGGTGATGATGGTGAAAATCCAATAGGAGACATTGATGAAGAACTAGATGGTGAAAGTGTGCCGAATCCACGCCATTTCCATGAAGAAAGTGGATGATTTTTAATTTGTTCTTTACGC TGTTGTTGTTGTTGTTCTGCTTTAATACGAGCTTTTTCCAATTTAGCTAATTTTTTCTGTTGGGCAAGTTCAGCTTTTTTAGCTTTAAAATTAGAAAACGATTTGAATATAGAAGGAATTTTGTTAGACGTATTTGATATTTCAGAGG ] [+] EMBL BF936548 [ TGTTGTTGTTCTGCTTTAATACCAGCTTTTTCCAATTTAGCTAATTTTTTCTGTTGGGCAAGTTCAGCTTTTTTAGCTTTAAAATTAGAAAACGATTTGAATATAGAAGGAATTTTGTTAGACGTATTTGATATTTCAGAGGTTTTATTTGACGGTACACGAGGTAACGTAGATACAGCATTAGAAAGTTGACTGTGTTTAATTGTATTACGATTGAGTGTTGCCTCTGAAGATGAACAAGAATCTGGTGAGTTTGAAACTCCTGGCAAAGTCGACTTTTCATCGTTTAAATTTATTTGTTCGTTTGTTTTACGAAATAATGTTGGCGAAACCGGTGCAGACAATGAATCCATACAAGAATAGGTATTATATTCCGAGTTTTCATAGCATGATTGTTTAGTTACTGTTTCATTTTCATATCGTTCAGCAATTTCAGTGGTTACATTAGAAGTAATAGAATTAAATTGACCATTGAATGACTTGTCTAAAGATTTAAATTTATTATTATGTAATTCCATTAAACGTTTTATTTCTTTTCTGCGTATTTCATATTTCATTTCAATACGTCTACGATAATCACTTTCTTCACGATT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||