These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6227#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 1361 fasta sequence [AAGAGCTGAAATTTTGGCAGCTCGTGCATGTAAACAGCCTCAAGAATCTGTCTTCGATAACAGTGAACCTGTTGGTGCTAATTATAAACGACCAGATGTTCAGTCGGAAATTCGTTCTATTAAAGCCGCGAATAATTCAAATACTTTATCATCAACAAATGAAAAGTCTGATATTAATAATAATTTAAATAGTCAAGACCAGTTATCATATCAAAATGGTTATCATCATCATCAGTGCTCTTTACAACAATCCCAACAACAAACCACATCACCTCCTTTTTCTTTATCGCCAATAGCAGATATTTCAAATAATCAAAGAAACTCTAACATTGAGCAACAGTTAAACAATGGTAACAATAATATTTATCATCAAAACTCAGTTTCACCACAGAATTCAATGTATAAACTAGCTTCATCATGTATTGATTCATCGCCTAACACGGAAGTGCACAATAAAAGAAATTCAAATCTTAAAGCTGTTTGTCTATATGATTATAACGCTAATGAAGATGATGAATTATCATTTCGTGCCAAAGA-ACATATATTTGACATTGAACAAATTGATGAAGGTTGGTGGCTTGGTCGAAATGCTGATGGACAAGTTGGATTGTTTCCAGCTAATTATGTTAAATTAATGATGTAAAAAGCTGATGAAAAGCAAAAAATATAAATGTAGTTCTTTGATAATTTAGTTTATAAAAACAAACAAACACAT-ACTATATANTGGTTGCANGTTNTGGTGTTCGTTTCTAATTTATTCATACAAGGCAAAATGGATACAGTTGTATTCTCCTCATATCAATTCAGAGTATAAAACATGTTNTTCTTTTATTTTATGGAGTTATCATTTATATTACCATCAATGATGNTACTTTGACTGTTATTATGTAACTGATTTGTTGTTGCTTCCCAGTTCTCTTAATACACATCAATGAAGAATTGTTACAACGAATACTAAAATGAAACACATCATAGACATACATTTTTAACTTCCTTATTGAATTTATTTCATTACTAACTTTCATATGATTTTTCATTGTTTATTCTTATCTTCTATGAGTTATTTAACTTTGTGATCACCATATAGTTTGATGCACAACTTAATTTCTAGGTATATATTTCACTTGTGTAGATTTTTTTTTATTTATATCCACATATATGGCCATACTTATGTTGACGGTTTTTTTCTTTTTTCATACTTCAATAATTTATACTCACTAAATGAAACATAAACGGATCATAAACAAAACCATTAGTGTTTCTATTAAGAAACATTGATAGTTTGGTAGTTTCATTTTTCGCATTGTTTTTCAGCTTGTATTTAATTTTTGTTCCAAATTCACTTGTGTATACGACNTATA] [+] EMBL AA756899 [AAGAGCTGAAATTTTGGCAGCTCGTGCATGTAAACAGCCTCAAGAATCTGTCTTCGATAACAGTGAACCTGTTGGTGCTAATTATAAACGACCAGATGTTCAGTCGGAAATTCGTTCTATTAAAGCCGCGAATAATTCAAATACTTTATCATCAACAAATGAAAAGTCTGATATTAATAATAATTTAAATAGTCAAGACCAGTTATCATATCAAAATGGTTATCATCATCATCAGTGCTCTTT ] [+] EMBL CD079397 [ gaggTTTAAATAGTCAAGACCAGTTATCATATCAAAATGGTTATCATCATCATCAGTCGTCTTTACAACAATCCCAACAACAAACCACATCACCTCCTTTTTCTTTATCGCCAATAGCAGATATTTCAAATAATCAAAGAAACTCTAACATTGAGCAACAGTTAAACAATGGTAACAATAATATTTATCATCAAAACTCAGTTTCACCACAGAATTCAATGTATAAACTAGCTTCATCATGTATTGATTCATCGCCTAACACGGAAGTGCACAATAAAAGAAATTCAAATCTTAAAGCTGTTTGTCTATATGATTATAACGCTAATGAAGATGATGAATTATCATTTCGTGCCAAAGA ACATATATTTGACATTGAACAAATTGATGAAGGTTGGTGGCTTGGTCGAAATGCTGATGGACAAGTTGGATTGTTTCCAGCTAATTATGTTAAATTAATGATGTAAAAAGCTGATGAAAAGCAAAAAATATAAATGTAGTTCTTTGATAATTTAGTTTATAAAAACAAACAAACACAT ACTATATANTGGTTGCANGTTNTGGTGTTCGTTTCTAATTTATTCATACAAGGCAAAATGGATACAGTTGTATTCTCCTCATATCAATTCAGAGTATAAAACATGTTNTTCTTTTATTTTATGGAGTTATCATTTATATTACCATCAATGATGNTACTTTGACTG ] [-] EMBL CD063959 [ AATAAAAGAAATTCAAATCTTAAAGCTGTTTGTCTATATGATTATAACGCTAATGAAGATGATGAA TATCATTTCGTGCCAAAGANACATATA ] [-] EMBL CD073672 [ TAAAAACAAACAAACACATNNCTATATA TGGTTGCA GTT TTGTGTTCGTTTCTAATTTATTCATACAAGGCAAAATGGATACAGTTGTATTCTCCTCATATCAATTCAGAGTATAAAACATGTTTTTCTTTTATTTTATGGAGTTATCATTTATATTACCATCAATGATGTTACTTTGACTGTTATTATGTAACTGATTTGTTGTTGCTTCCCAGTTCTCTTAATACACATCAATGAAGAATTGTTACAACGAATACTAAAATGAAACACATCATAGACATACATTTTTAACTTCCTTATTGAATTTATTTCATTACTAACTTTCATATGATTTTTCATTGTTTATTCTTATCTTCTATGAGTTATTTAACTTTGTGATCACCATATAGTTTGATGCACAACTTAATTTCTAGGTATATATTTCACTTGTGTAGATTTTTTTTTATTTATATCCACATATATGGCCATACTTATGTTGACGGTTTTTTTCTTTTTTCATACTTCAATAATTTATACTCACTAAATGAAACATAAACGGATCATAAACAAAACCATTAGTGTTTCTATTAAGAAACATTGATAGTTTGGTAGTTTCATTTTTCGCATTGTTTTTCAGCTTGTATTTAATTTTTGTTCCAAATTCACTTGTGTATACGACNTATA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||