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Schistosoma mansoni
cluster # 6248 cluster # 6248       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6248#0 length = 1018 sequences # 4  

consensusID : consensus_6248#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1018
fasta sequence
                              [CAACGTGTTTAATGATTTACACAAAATGCAAATGTTGCTAAAAATGCTCGATTAGAAAGTTGATAATCTGTTATAACTTGGAAGGATATACATGAAAACGAAGTAATATCTTGTTCAAGTCCATCACTCATATCTGTTTTTGTAAGGTTAATGTGTCTACAATACATTATGAAATGACCTTTCATCTAGTTATCGAGAAGAATAGATTATGCACTTTAGGAGGAATCTCAGTGAATAAACTTTTCACACAATTAACTTCATCAACGTATTAAGATTGCAAACTAATATCACCACTAAGTTGATGTCATAGCAACTTTATTAGAGAAGCATATTACCGCTTTAAGGTGGTGGTTGGAGGTGGTCAACAGGAAACCCTGCTACTTGGCACTCGTCAGCAAAGTGCACCTGTAATCTTGAGGGAACTGTTGCTCCCTGATGGATTTGATCCCGTGTCACTCAGCTTCACAGTCAGAGACGTTACCACTGAGCTACTCGGGCTGCCACCGACCTCCTGTAGGACTGAGATGTAATCACAATTGATTGATCACTGGGTGGTGATCAATGTCATGTGTATCAAGTCCTTCTTAGTGCTGATCGAATGCTATTGATCAAGTTGCAATGTGATCACTAGTCTAGGTGGTTCGAAACTGTGTGCAACTTATCTCTACTACAATCAAAGTCAAGAATTGGAACCAACAATACTTATGATCACAAAAACTGTCAAATTATTCATACATCCTTAGTCAAATAATTTAGATATATATAAAACTTTTAATGCTATGAATTCAATCAATATGTTTAACATATGATCTAAATTGTGTCTTTTTTTATACTGTAAGTTCTCAAATTATCGATTGAAATAACTTGATTGGAGTTGAATTGTTACGAAACAATTAACATGATCTTTGATGTTTATCGATCTGAGAAAGCTTCAGTTATGCTGTACTTACTTACTTATGCCTGTTTCTCCCAATGGAGCATAGGCAGACGACCAACATTCTCCACACACTCTGTGCTG]

[-] EMBL CD188025             [CAACGTGTTTAATGATTTACACAAAATGCAAATGTTGCTAAAAATGCTCGATTAGAAAGTTGATAATCTGTTATAACTTGGAAGGATATACATGAAAACGAAGTAATATCTTGTTCAAGTCCATCACTCATATCTGTTTTTGTAAGGTTAATGTGTCTACAATACATTATGAAATGACCTTTTATCTAGTTATCGAGAAGAATAGATTATGCACTTTAGGAGGAATCTCAGTGAATAAACTTTTCACACAGTTAACTTCATCAACGTATTAAGATTGCAAACTAATATCACCACTAAGTTGATGTCATAGCAACTTTATTAGAGAAGCATATTACCGCTTTAAGGTGGTGGTTGGAGGTGGTCAACAGGAAACCCTGCTACTTGGCACTCGTCAGCAAAGTGCACCTGTAATCTTGAGGGAACTGTTGCTCCCTGATGGATTTGATCCCGTGTCACTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD090134             [                                                                                                       TAATATCTTGTTCAAGTCCATCACTCATATCTGTTTTTGTAAGGTTAATGTGTCTACAATACATTATGAAATGACCTTTCATCTAGTTATCGAGAAGAATAGATTATGCACTTTGGGAGGAATCTCAGTGAATAAACTTTTCACACAATTAACTTCATCAACGTATTAAGATTGCAAACTAATATCACCACTAAGTTGATGTCATAGCAACTTTATTAGAGAAGCATATTACCGCTTTAAGGTGGTGGTTGGAGGTGGTCAACAGGAAACCCTGCTACTTGGCACTCGTCAGCAAAGTGCACCTGTAATCTTGAGGGAACTGTTGCTCCCTGATGGATTTGATCCCGTGTCACTCAGCTTCACAGTCAGAGACGTTACCACTGAGCTACTTGGGCTGCCACCGACCTCCTGTAGGACTGAGATGTAATCACAATTGATTGATCACTGGGTGGTGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD089976             [                                                                                                       TAATATCTTGTTCAAGTCCATCACTCATATCTGTTTTTGTAAGGTTAATGTGTCTACAATACATTATGAAATGACCTTTCATCTAGTTATCGAGAAGAATAGATTATGCACTTTAGGAGGAATCTCAGTGAATAAACTTTTCACACAATTAACCTCATCAACGTATTAAGATTGCAAACTAATATCACCACTAAGTTGATGTCATAGCAACTTTATTAGAGAAGCATATTACCGCTTTAAGGTGGTGGTTGGAGGTGGTCAACAGGAAACCCTGCTACTTGGCACTCGTCAGCAAAGTGCACCTGTAATCTTGAGGGAACTGTTGCTCCCTGATGGATTTGATCCCGTGTCACTCAGCTTCACAGTCAGAGACGTTACCACTGAGCTACTCGGGCTGCCACCGACCTCCTGTAGGACTGAGATGTAATCACAATTGATTGATCACTGGGTGGTGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD085021             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CTCGTCAGCAAGGTGTACCTGTAATCTTGAGGGGACTGATGCTCCCTGACGGATTTGATCCCGTGTCACTCAGCTTCACAGTAAGAGACGTTACCACTGAGCTATTCGGGCCGCCACCGATCTCCTGTAGGACTGAGATGTAATCACAATTGACTGATCACTGGATGGTGATCAATGTCATGTGTATCAAGTCCTTCTTAGTGCTGATCGAATGCTATTGATCAAGTTGCAATGTGATCACTAGTCTAGGTGGTTCGAAACTGTGTGCAACTTATCTCTACTACAATCAAAGTCAAGAATTGGAACCAACAATACTTATGATCACAAAAACTGTCAAATTATTCATACATCCTTAGTCAAATAATTTAGATATATATAAAACTTTTAATGCTATGAATTCAATCAATATGTTTAACATATGATCTAAATTGTGTCTTTTTTTATACTGTAAGTTCTCAAATTATCGATTGAAATAACTTGATTGGAGTTGAATTGTTACGAAACAATTAACATGATCTTTGATGTTTATCGATCTGAGAAAGCTTCAGTTATGCTGTACTTACTTACTTATGCCTGTTTCTCCCAATGGAGCATAGGCAGACGACCAACATTCTCCACACACTCTGTGCTG]


>consensus_6248#0 CAACGTGTTTAATGATTTACACAAAATGCAAATGTTGCTAAAAATGCTCGATTAGAAAGT TGATAATCTGTTATAACTTGGAAGGATATACATGAAAACGAAGTAATATCTTGTTCAAGT CCATCACTCATATCTGTTTTTGTAAGGTTAATGTGTCTACAATACATTATGAAATGACCT TTCATCTAGTTATCGAGAAGAATAGATTATGCACTTTAGGAGGAATCTCAGTGAATAAAC TTTTCACACAATTAACTTCATCAACGTATTAAGATTGCAAACTAATATCACCACTAAGTT GATGTCATAGCAACTTTATTAGAGAAGCATATTACCGCTTTAAGGTGGTGGTTGGAGGTG GTCAACAGGAAACCCTGCTACTTGGCACTCGTCAGCAAAGTGCACCTGTAATCTTGAGGG AACTGTTGCTCCCTGATGGATTTGATCCCGTGTCACTCAGCTTCACAGTCAGAGACGTTA CCACTGAGCTACTCGGGCTGCCACCGACCTCCTGTAGGACTGAGATGTAATCACAATTGA TTGATCACTGGGTGGTGATCAATGTCATGTGTATCAAGTCCTTCTTAGTGCTGATCGAAT GCTATTGATCAAGTTGCAATGTGATCACTAGTCTAGGTGGTTCGAAACTGTGTGCAACTT ATCTCTACTACAATCAAAGTCAAGAATTGGAACCAACAATACTTATGATCACAAAAACTG TCAAATTATTCATACATCCTTAGTCAAATAATTTAGATATATATAAAACTTTTAATGCTA TGAATTCAATCAATATGTTTAACATATGATCTAAATTGTGTCTTTTTTTATACTGTAAGT TCTCAAATTATCGATTGAAATAACTTGATTGGAGTTGAATTGTTACGAAACAATTAACAT GATCTTTGATGTTTATCGATCTGAGAAAGCTTCAGTTATGCTGTACTTACTTACTTATGC CTGTTTCTCCCAATGGAGCATAGGCAGACGACCAACATTCTCCACACACTCTGTGCTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)