cluster # 6249

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Schistosoma mansoni
cluster # 6249 cluster # 6249 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6249#0 length = 793 sequences # 4

consensusID : consensus_6249#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 793
fasta sequence

                              [CCCGGTACCCTGGCTTTCCACATCATCTCGGGAACGATTGGTTGAGCGTGTCGGTGAGATGGAGGCGGAATATGGTGAAGTTGGTGAAGGCGTATTTGAAGGTGAGACGGAAGCCGAGTCGGCAGTCGAAGTGTTCGGTGAGACATTGGGGCAAGTTGAAGCGGACGCAGAAAGTGAAGTGGTAGAACAGGTTGAATCGGAACGTGTGTCTGTGTTCGCTCCAGTCGAATTGGAGTCTACCTTCCTTCGTCAACTGTGTCTCCTTCATCACTGGATTTAGGATCGTTTCCTTTTCCTAATCCTACTCAATGGACCATTGAAGAAGTTTACAACTACATTACGGCTCGTGATGCTACTCTCCTTGAAGCAGCGGAAAAATTCAAACATCATGTATGTTTTTTTGTCATCGCTAATGCTGTCCGTTTTCTCCTACTTATTTCCATAGCTCAAACTAAAGAAATAGATGGCCAAGCACTTCTTCTTCTTAGCATGGAATCACTGCGTAATTATATGAAGATTAAATTGGGTCCTGCTTTGAAAATGGTTCATCTTATCAGTCGTCTAAAACGTGGGTTGTTGTAACTTCGCTATTCTTCGTGGTTTGACTTCTCTATTGGTCTTTATTTCATTTATAAAATCCGGACAACAAGGATATGTAGATGGTTAATGTTCCCAAATTTTCTTTAAAATATATGTGTATCTCTGTCAGTTTTCAATCTATTTTCTTAGTAACCAAATTGACACATCTTTTTGAGTTCAATGTAGTTGAAT-TTATTTGGTCAATATAACTTTT]

[+] EMBL CD067745             [CCCGGTACCCTGGCTTTCCACATCATCTCGGGAACGATTGGTTGAGCGTGTCGGTGAGATGGAGGCGGAATATGGTGAAGTTGGTGAAGGCGTATTTGAAGGTGAGACGGAAGCCGAGTCGGCAGTCGAAGTGTTCGGTGAGACATTGGGGCAAGTTGAAGCGGACGCAGAAAGTGAAGTGGTAGAACAGGTTGAATCGGAACGTGTGTCTGTGTTCGCTCCAGTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD080643             [                                                                                                                                                     GGCAAGTTGAAGCGGACGCAGAAAGTGAAGTGGTAGAACAGGTTGAATCGGAACGTGTGTCTGTGTTCGCTCCAGTCGAATTGGAGTCTACCTTCCTTCGTCAACTGTGTCTCCTTCATCACTGGATTTAGGATCGTTTCCTTTTCCTAATCCTACTCAATGGACCATTGAAGAAGTTTACAACTACATTACGGCTCGTGATGCTACTCTCCTTGAAGCAGCGGAAAAATTCAAACATCATGTATGTTTTTTTGTCATCGCTAATGCTGTCCGTTTTCTCCTACTTATTTCCATAGCTCAAACTAAAGAAATAGATGGCCAAGCACTTCTTCTTCTTAGCATGGAATCACTGCGTAATTATATGAAGATTAAATTGGGTCCTGCTTTGAAAATGGTTCATCTTATCAGTCGTCTAAAACGTGGGTTGTTGTAACTTCGCTATTCTTCGTGGTTTGACTTCTCTATTGGTCTTTATTTCATTTATAAAATCCGGACAACAAGGATATGTAGATGGTTAATGTTCCCAAATTTTCTTTAAAATATATGTGTATCTCTGTCAGTTTTCAATCTATTTTCTTAGTAACCAAATTGACACATCTTTTTGAGTTCAATGTAGTTGAAT TTATTTGGTCAATATAACT   ]
[+] EMBL CD080644             [                                                                                                                                                          GTTGAAACGGACGCAAAAAGTGAAGTGGTAGAACAGGTTGAATCGGAACGTGTGTCTGTGTTCGCTCCAGTCGAATTGGAGTCTACCTTCCTTCGTCAACTGTGTCTCCTTCATCACTGGATTTAGGATCGTTTCCTTTTCCTAATCCTACTCAATGGACCATTGAAGAAGTTTACAACTACATTACGGCTCGTGATGCTACTCTGCTTGAAGCAGCGGAAAAATTCAAACATCATGTATGTTTCTTTGTCATCGTTAATGCTGTCCGTTTTCTCCTACTTATTTCCATAGCTCAAACTAAAGAAATAGATGGCCAAGCACTACTTCTTCTTAGCATGGAATCACTGCGTAATTATATGAAGATTAAATTGGGTCCTGCTTTGAAAATGGTTCATCTTATCATTCGTCTAAAACGTGGGTTGTTGTAACTTCGCTATTCTTCGCGGTTTGACTTCTCTATTGGTCTTTATTTCATTCATAAAATCCCGACCACAAGGATATGTACATGGTTAATGCTCCCAAATTTTCTTTCAAACATATGCGTATCTCTGTCAGATTTCAATCTATTTCCTTAGGAACCAAATTGACACATCCTCCCGAGTACAATGTAGTTTAATCTTATTCGGTCCACATAACTTTT]
[-] EMBL CD074556             [                                                                                                                                                                                           CAGGTTGAATCGGAACGTGTGTCTGTGTTCGCTCCAGTCGAATTGGAGTCTACCTTCCTTCGTCAACTGTGTCTCCTTCATCACTGGATTTAGGATCGTTTCCTTTTCCTAATCCTACTCAATGGACCATTGAAGAAGTTTACAACTACATTACGGCTCGTGATGCTACTCTCCTTGAAGCAGCGGAAAAATTCAAACATCATGTATGTTTTTTTGTCATCGCTAATGCTGTCCGTTTTCTCCTACTTATTTCCATAGCTCAAACTAAAGAAATAGATGGCCAAGCACTTCTTCTTCTTAGCATGGAATCACTGCGTAATTATATGAAGATTAAATTGGGTCCTGCTTTGAAAATGGTTCATCTTATCAGTCGTCTAAAACGTGGGTTGTTGTAACTTCGCTATTCTTCGTGGTTTGACTTCTCTATTGGTCTTTATTTCATTTATAAAATCCGGACAACAAGGATATGTAGATGGTTAATGTTCCCAAATTTTCTTTAAAATATATGTGTATCTCTGTCAGTTTTCAATCTATTTTCTTAGTAACCAAATTGACACATCTTTTTGAGTTCAATGTAGTTGAAT TTAAATGGTCAATATAACTT  ]




>consensus_6249#0
CCCGGTACCCTGGCTTTCCACATCATCTCGGGAACGATTGGTTGAGCGTGTCGGTGAGAT
GGAGGCGGAATATGGTGAAGTTGGTGAAGGCGTATTTGAAGGTGAGACGGAAGCCGAGTC
GGCAGTCGAAGTGTTCGGTGAGACATTGGGGCAAGTTGAAGCGGACGCAGAAAGTGAAGT
GGTAGAACAGGTTGAATCGGAACGTGTGTCTGTGTTCGCTCCAGTCGAATTGGAGTCTAC
CTTCCTTCGTCAACTGTGTCTCCTTCATCACTGGATTTAGGATCGTTTCCTTTTCCTAAT
CCTACTCAATGGACCATTGAAGAAGTTTACAACTACATTACGGCTCGTGATGCTACTCTC
CTTGAAGCAGCGGAAAAATTCAAACATCATGTATGTTTTTTTGTCATCGCTAATGCTGTC
CGTTTTCTCCTACTTATTTCCATAGCTCAAACTAAAGAAATAGATGGCCAAGCACTTCTT
CTTCTTAGCATGGAATCACTGCGTAATTATATGAAGATTAAATTGGGTCCTGCTTTGAAA
ATGGTTCATCTTATCAGTCGTCTAAAACGTGGGTTGTTGTAACTTCGCTATTCTTCGTGG
TTTGACTTCTCTATTGGTCTTTATTTCATTTATAAAATCCGGACAACAAGGATATGTAGA
TGGTTAATGTTCCCAAATTTTCTTTAAAATATATGTGTATCTCTGTCAGTTTTCAATCTA
TTTTCTTAGTAACCAAATTGACACATCTTTTTGAGTTCAATGTAGTTGAATTTATTTGGT
CAATATAACTTTT

clustalw multiple alignements is not computed in this case