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Schistosoma mansoni
cluster # 626 cluster # 626       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_626#0 length = 1038 sequences # 2  

consensusID : consensus_626#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1038
fasta sequence
                              [TCGGCACGCAGGGACACGACCAGTTCCTGTATGTGCAGTTGACATAATGTTTCTGTCCCTGAAATTTCAATCCCGATCGATCGTCCTAATGAAGAAAATGAAATAGCACATCCTCAACCTGAAAACAGGGTTTCTGGATCTCAGGATCTTCGTAATGATTCTAACGGTATTTCACCACCATCTTACGATGATTTGGTACAATCTAAATAAGTAGAGCTATTTGTTTCATTAATTTGTTCAATTGCGATCGACAATGAAAACTTCTTTTAATCGATCGTAAGATGGAAGCGACAACGACGAAAAGTAAACTAGATCTTATAATTCCATATTTTTCTTTATTAAGACAATGACTGCATTTTACCAGACATTGCCTACTATTTTAATTATTTATTTAATTACTGTGTCTTCCATCCATCATTGTTCTTCTTTCGAAATTCATTCATCATATGTTTTCCGTTGTCACCATATTAAAAAATTCTTTT-AAAATTTTTTCTTTTCTCTTTTTAACTGATTCTTTCAGTGTATAAAATTCACACTAACACTACAACACTCACTATAATTATACAAATATTTCATGAGATTGAATAAAATCATTTAAGAATTATTTAAGACCAAGCTTCTTTGTTTTGTTTCAATGTTTTATCAACTGAACTATCATTTCATCTATTCATATAATATATCTAACTTTTTCCAATCTTTGTCACTTACTTCCCTCTTTCTTTGTTAAGTTGTTGAATGGATTGTTTTTTATTTTCTCAAATTGTTTTGTTGTTTAGTCTAGTTT-AAAATGCTGAATGACGAANAAGATTTCATTTGGTTNTTCCTCTGTTNTGCTTCTCGTTTTGTATATTTATACTNTNTGNTNTAAGNTGGTTGGTTGGTTTCNTTTAGTTATATACACTGTGCACTAATGATGTANTGTAGATCTTTTTCTTTATCTTGATTAATCATTGNAAAAT-ATAATCATTTGTGATTCTTATAACGTANNTGT-AT-AGT-ATGAACT-ATGTTCGATCC-CA-TTATGTTTTATACGTTGTTGAG]

[+] EMBL CD081205             [TCGGCACGCAGGGACACGACCAGTTCCTGTATGTGCAGTTGACATAATGTTTCTGTCCCTGAAATTTCAATCCCGATCGATCGTCCTAATGAAGAAAATGAAATAGCACATCCTCAACCTGAAAACAGGGTTTCTGGATCTCAGGATCTTCGTAATGATTCTAACGGTATTTCACCACCATCTTACGATGATTTGGTACAATCTAAATAAGTAGAGCTATTTGTTTCATTAATTTGTTCAATTGCGATCGACAATGAAAACTTCTTTTAATCGATCGTAAGATGGAAGCGACAACGACGAAAAGTAAACTAGATCTTATAATTCCATATTTTTCTTTATTAAGACAATGACTGCATTTTACCAGACATTGCCTACTATTTTAATTATTTATTTAATTACTGTGTCTTCCATCCATCATTGTTCTTCTTTCGAAATTCATTCATCATATGTTTTCCGTTGTCACCATATTAAAAAATTCTTTT AAAATTTTTTCTTTTCTCTTTTTAACTGATTCTTTCAGTGTATAAAATTCACACTAACACTACAACACTCACTATAATTATACAAATATTTCATGAGATTGAATAAAATCATTTAAGAATTATTTAAGACCAAGCTTCTTTGTTTTGTTTCAATGTTTTATCAACTGAACTATCATTTCATCTATTCATATAATATATCTAACTTTTTCCAATCTTTGTCACTTACTTCCCTCTTTCTTTGTTAAGTTGTTGAATGGATTGTTTTTTATTTTCTCAAATTGTTTTGTTGTTTAGTCTAGTTT AAAATGCTGAATGACGAANAAGATTTCATTTGGTTNTTCCTCTGTTNTGCTTCTCGTTTTGTATATTTATACTNTNTGNTNTAAGNTGGTTGGTTGGTTTCNTTTAGTTATATACACTGTGCACTAATGATGTANTGTAGATCTTTTTCTTTATCTTGATTAATCATTGNAAAAT ATAATCATTTGTGATTCTTATAACGTANNTGT AT AGT ATGAACT ATGTTCGATCC CA TTATGTTTTATACGTTG     ]
[-] EMBL CD075035             [                                                                                                                                                                                                                                                                        TTTTAATCGATCGTAAGATGGAAGCGACAACGACGAAAAGTAAACTAGATCTTATAATTCCATATTTTTCTTTATTAAGACAATGACTGCATTTTACCAGACATTGCCTACTATTTTAATTATTTATTTAATTACTGTGTCTTCCATCCATCATTGTTCTTCTTTCGAAATTCATTCATCATATGTTTTCCGTTGTCACCATATTAAAAAATTCTTTTCAAAATTTTTTCTTTTCTCTTTTTAACTGATTCTTTCAGTGTATAAAATTCACACTAACACTACAACACTCACTATAATTATACAAATATTTCATGAGATTGAATAAAATCATTTAAGAATTATTTAAGACCAAGCTTCTTTGTTTTGTTTCAATGTTTTATCAACTGAACTATCATTTCATCTATTCATATAATATATCTAACTTTTTCCAATCTTTGTCACTTACTTCCCTCTTTCTTTGTTAAGTTGTTGAATGGATTGTTTTTTATTTTCTCAAATTGTTTTGTTGTTTAGTCTAGTTTCAAAATGCTGAATGACGAAAAAGATTTCATTTGGTTTTTCCTCTGTTTTGCTTCTCGTTTTGTATATTTATACTTTTTGTTTTAAGTTGGTTGGTTGGTTTCTTTTAGTTATATACACTGTGCACTAATGATGTAATGTAGATCTTTTTCTTTATCTTGATTAATCATTGTAAAATAATAATCATTTGTGATTCTTATCATGTA AGGTAATAAGTAATGAACTAATGTTCGATCCTCATTTATGTTTTAagaacagttgag]


>consensus_626#0 TCGGCACGCAGGGACACGACCAGTTCCTGTATGTGCAGTTGACATAATGTTTCTGTCCCT GAAATTTCAATCCCGATCGATCGTCCTAATGAAGAAAATGAAATAGCACATCCTCAACCT GAAAACAGGGTTTCTGGATCTCAGGATCTTCGTAATGATTCTAACGGTATTTCACCACCA TCTTACGATGATTTGGTACAATCTAAATAAGTAGAGCTATTTGTTTCATTAATTTGTTCA ATTGCGATCGACAATGAAAACTTCTTTTAATCGATCGTAAGATGGAAGCGACAACGACGA AAAGTAAACTAGATCTTATAATTCCATATTTTTCTTTATTAAGACAATGACTGCATTTTA CCAGACATTGCCTACTATTTTAATTATTTATTTAATTACTGTGTCTTCCATCCATCATTG TTCTTCTTTCGAAATTCATTCATCATATGTTTTCCGTTGTCACCATATTAAAAAATTCTT TTAAAATTTTTTCTTTTCTCTTTTTAACTGATTCTTTCAGTGTATAAAATTCACACTAAC ACTACAACACTCACTATAATTATACAAATATTTCATGAGATTGAATAAAATCATTTAAGA ATTATTTAAGACCAAGCTTCTTTGTTTTGTTTCAATGTTTTATCAACTGAACTATCATTT CATCTATTCATATAATATATCTAACTTTTTCCAATCTTTGTCACTTACTTCCCTCTTTCT TTGTTAAGTTGTTGAATGGATTGTTTTTTATTTTCTCAAATTGTTTTGTTGTTTAGTCTA GTTTAAAATGCTGAATGACGAANAAGATTTCATTTGGTTNTTCCTCTGTTNTGCTTCTCG TTTTGTATATTTATACTNTNTGNTNTAAGNTGGTTGGTTGGTTTCNTTTAGTTATATACA CTGTGCACTAATGATGTANTGTAGATCTTTTTCTTTATCTTGATTAATCATTGNAAAATA TAATCATTTGTGATTCTTATAACGTANNTGTATAGTATGAACTATGTTCGATCCCATTAT GTTTTATACGTTGTTGAG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)