cluster # 6270

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Schistosoma mansoni
cluster # 6270 cluster # 6270 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6270#0 length = 683 sequences # 4

consensusID : consensus_6270#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 683
fasta sequence

                              [AAATGAAGATAATAAAGGATTGGTACTTGTGTACGTAAAAAACAAGTCCATAAGGATTAGACAGTAGCAACAATAAGAACAACAGTTTGATAATTAACGATATGGTTTAACATGTTGCCATGATATAAGATACATCCTGAAAAACTCACAAACAGGTTTGTAATAACAAATAAGAAGTGGAAACAAGTTACGTATTAACAAAAGCCAGTAACCAAACATAATATTTATCACAATTATATGTAACATAGAGCTGAGATTCTATCTGTTTTCTTTTTTCTGTTTTGCAAATTGAGGCACTATGTAAACACATATACCGACCATTTGTGAAAAAGATAAATCCAACCAATTCGATAAGATAATAATCCTTGAATTTTCCCTGAACAATAACATTTTATCAACCTTAAAAATTATTCAAATCAAAATGATCTTAGCAGAATTAAACGATATGCCGCACAATCATTTCACACAACCCAATAATGAATAAAAAATATTGACAAAATAATTATATACTATTAGCCAGACAATTAAGTAGTTTATGTTATAAAGCAACANAATCATTAAAAATGGGTGATAAGGTGGATTCTATGACCAATTCAATAATTNTCAACANNAAAGTTAGCACGTAATAAAGTACAAATGGAGTAGATACACTTTACCCAATAAAGATGAACAAAATCTAACAA]

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[+] EMBL CD148785             [AAATGAAGATAATAAAGGATTGGTACTTGGGTACGTAAAAAACAAGTCCATAAGGATTAGACAGTAGCAACAATAAGAACAACAGTTTGATAATTAACGATATGGTTTAACATGTTGCCATGATATAAGATACATCCTGAAAAACTCACAAACAGGTTTGTAATAACAAATAAGAAGTGGATACAAGTTACGTATTAACAAAAGCCAGAAACCAAACATAATATTTATCACAATTATATGTAACATAGAGCTGAGATTCTATCTGTTTTCTTTTTTCTGTTATGCAAATTGAGGCACTATGTACACACATATACCGACCATTTGTGAAAAAGATAAATCCAACCAATTCGATAATATAATAATCCTTGAATTTTCCCTGAACAATAg                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]




>consensus_6270#0
AAATGAAGATAATAAAGGATTGGTACTTGTGTACGTAAAAAACAAGTCCATAAGGATTAG
ACAGTAGCAACAATAAGAACAACAGTTTGATAATTAACGATATGGTTTAACATGTTGCCA
TGATATAAGATACATCCTGAAAAACTCACAAACAGGTTTGTAATAACAAATAAGAAGTGG
AAACAAGTTACGTATTAACAAAAGCCAGTAACCAAACATAATATTTATCACAATTATATG
TAACATAGAGCTGAGATTCTATCTGTTTTCTTTTTTCTGTTTTGCAAATTGAGGCACTAT
GTAAACACATATACCGACCATTTGTGAAAAAGATAAATCCAACCAATTCGATAAGATAAT
AATCCTTGAATTTTCCCTGAACAATAACATTTTATCAACCTTAAAAATTATTCAAATCAA
AATGATCTTAGCAGAATTAAACGATATGCCGCACAATCATTTCACACAACCCAATAATGA
ATAAAAAATATTGACAAAATAATTATATACTATTAGCCAGACAATTAAGTAGTTTATGTT
ATAAAGCAACANAATCATTAAAAATGGGTGATAAGGTGGATTCTATGACCAATTCAATAA
TTNTCAACANNAAAGTTAGCACGTAATAAAGTACAAATGGAGTAGATACACTTTACCCAA
TAAAGATGAACAAAATCTAACAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case