cluster # 6287

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 6287 cluster # 6287 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6287#0 length = 730 sequences # 4

consensusID : consensus_6287#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 730
fasta sequence

                              [AATTTCAATTCTCTCGTTGAATTATTAAAAGTAATTTTGCATCTACGTGATTGTCTAGTCGATGGGCCTAAAAGTTTAATCAACCTTATCCATGTTGATCCGGAGAATTTTTCTCTAATTGGATTAAATGATTTGGGTGAGAAAATTATAGATGGATTGGATAGTGTTTGTTTATTGGCTGTTGAATATATCGGTCCAGAATTAATTCTACCCGGAAATATATTTTCTTTGGAAATAATTGTTGAAGAGTTAGAGACTGGTAAAATTGATCTGCAGAGGTCTTGGTTTTTGCCGTTATTATCACGTGCAGTACCACAGAGATCAATTTCATTATCAATCTTTCATAGGCATATTCTTCCGTTAGCTGACAGAGCCCTTGCTGTAGCCAGTTTACATTCTTCAACGACTGTTTTATCTGATAAAACAAAGCCTCCAAATAATGCTTTGATGACTTCATCAATTAAGGTAGCTTGTCAACTTTGGTCCTCACTAAATATGTTTGTGCATCACAGTCCTATAGATTGGTCAGAATTATCAACTGGTGGGTTAGGAAGTCGACTAGTTAAAGAATTGAGTGCAGCTCCCGCATTAAGACCAATTATTCTGCATACATTTCGCCGATTAGCTAAACTAGCTGTTGGTAATGATCCCGCCATTACAGTTATGCGTGGCGGTGCTAAAACAGCTATACCAAATATGCTATCTTTGTATGAAACACTGGACACGGTTA]

[-] EMBL CD160263             [AATTTCAATTCTCTCGTTGAATTATTAAAAGTAATTTTGCATCTACGTGATTGTCTAGTCGATGGGCCTAAAGGTTTAATCAACCTTATCCATGTTGATCCGGAGAATTTTTCTCTAATTGGATTAAGTGATTTGGGTGAGAAAATTATAGATGGATTGGATAGTGTTTGTTTATTGGCTGTTGAATATATCGGTCCAGAATTAATTCTACCCGGAAATATATTTTCTTTGGAAATAATTGTTGAAGAGTTAGAGACTGGTAAAATTGATCTGCAGAGGTCTTGGTTTTTGCCGTTATTATCACGTGCAGTACCACAGAGATCAATTTCATTATCAATCTTTCATAGGCATATTCTTCCGTTAGCTGACAGAGCCCTTGCTGTAGCCAGTTTACATTCTTCAACGACTGTTTTATCTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD162286             [                                                               GGGCCTAAAAGTTTAATCAACCTTATCCATGTTGATCCGGAGAATTTTTCTCTAATTGGATTAAATGATTTGGGTGAGAAAATTATAGATGGATTGGATAGTGTTTGTTTATTGGCTGTTGAATATATCGGTCCAGAATTAATTCTACCCGGAAATATATTTTCTTTGGAAATAATTGTTGAAGAGTTAGAGACTGGTAAAATTGATCTGCAGAGGTCTTGGTTTTTGCCGTTATTATCACGTGCAGTACCACAGAGATCAATTTCATTATCAATCTTTCATAGGCATATTCTTCCGTTAGCTGACAGAGCCCTTGCCGTAGCCAGTTTACATTCTTCAACGACTGTTTTATCTGATAAAACAAAGCCTCCAAATAATGCTTTGATGACTTCATCAATTAAGGTAGCTTGTCAACTTTGGTCCTCACTAAATATGTTTGTGCATCACAGTCCTATAGATTGGTCAGA                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD162137             [                                                               GGGCCTAAAAGTTTAATCAACCTTATCCATGTTGATCCGGAGAATTTTTCTCTAATTGGATTAAATGATTTGGGTGAGAAAATTATAGATGGATTGGATAGTGTTTGTTTATTGGCTGTTGAATATATCGGTCCAGAATTAATTCTACCCGGAAATATATTTTCTTTGGAAATAATTGTTGAAGAGTTAGAGACTGGTAAAATTGATCTGCAGAGGTCTTGGTTTTTGCCGTTATTATCACGTGCAGTACCACAGAGATCAATTTCATTATCAATCTTTCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD119699             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cgctTCAATT CTTTAGCTTGTCAACTTTGGTCCTCACTAAATACGTTTGTGCATCACAGTCCTATAGATTGGTCAGAATTATCAACTGGTGGGTTAGGAAGTCGACTAGTTAAAGAATTGAGTGCAGCTCCCGCATTAAGACCAATTATTCTGCATACATTTCGCCGATTAGCTAAACTAGCTGTTGGTAATGATCCCGCCATTACAGTTATGCGTGGCGGTGCTAAAACAGCTATACCAAATATGCTATCTTTGTATGAAACACTGGACACGGTTA]




>consensus_6287#0
AATTTCAATTCTCTCGTTGAATTATTAAAAGTAATTTTGCATCTACGTGATTGTCTAGTC
GATGGGCCTAAAAGTTTAATCAACCTTATCCATGTTGATCCGGAGAATTTTTCTCTAATT
GGATTAAATGATTTGGGTGAGAAAATTATAGATGGATTGGATAGTGTTTGTTTATTGGCT
GTTGAATATATCGGTCCAGAATTAATTCTACCCGGAAATATATTTTCTTTGGAAATAATT
GTTGAAGAGTTAGAGACTGGTAAAATTGATCTGCAGAGGTCTTGGTTTTTGCCGTTATTA
TCACGTGCAGTACCACAGAGATCAATTTCATTATCAATCTTTCATAGGCATATTCTTCCG
TTAGCTGACAGAGCCCTTGCTGTAGCCAGTTTACATTCTTCAACGACTGTTTTATCTGAT
AAAACAAAGCCTCCAAATAATGCTTTGATGACTTCATCAATTAAGGTAGCTTGTCAACTT
TGGTCCTCACTAAATATGTTTGTGCATCACAGTCCTATAGATTGGTCAGAATTATCAACT
GGTGGGTTAGGAAGTCGACTAGTTAAAGAATTGAGTGCAGCTCCCGCATTAAGACCAATT
ATTCTGCATACATTTCGCCGATTAGCTAAACTAGCTGTTGGTAATGATCCCGCCATTACA
GTTATGCGTGGCGGTGCTAAAACAGCTATACCAAATATGCTATCTTTGTATGAAACACTG
GACACGGTTA

clustalw multiple alignements is not computed in this case