These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6287#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 730 fasta sequence [AATTTCAATTCTCTCGTTGAATTATTAAAAGTAATTTTGCATCTACGTGATTGTCTAGTCGATGGGCCTAAAAGTTTAATCAACCTTATCCATGTTGATCCGGAGAATTTTTCTCTAATTGGATTAAATGATTTGGGTGAGAAAATTATAGATGGATTGGATAGTGTTTGTTTATTGGCTGTTGAATATATCGGTCCAGAATTAATTCTACCCGGAAATATATTTTCTTTGGAAATAATTGTTGAAGAGTTAGAGACTGGTAAAATTGATCTGCAGAGGTCTTGGTTTTTGCCGTTATTATCACGTGCAGTACCACAGAGATCAATTTCATTATCAATCTTTCATAGGCATATTCTTCCGTTAGCTGACAGAGCCCTTGCTGTAGCCAGTTTACATTCTTCAACGACTGTTTTATCTGATAAAACAAAGCCTCCAAATAATGCTTTGATGACTTCATCAATTAAGGTAGCTTGTCAACTTTGGTCCTCACTAAATATGTTTGTGCATCACAGTCCTATAGATTGGTCAGAATTATCAACTGGTGGGTTAGGAAGTCGACTAGTTAAAGAATTGAGTGCAGCTCCCGCATTAAGACCAATTATTCTGCATACATTTCGCCGATTAGCTAAACTAGCTGTTGGTAATGATCCCGCCATTACAGTTATGCGTGGCGGTGCTAAAACAGCTATACCAAATATGCTATCTTTGTATGAAACACTGGACACGGTTA] [-] EMBL CD160263 [AATTTCAATTCTCTCGTTGAATTATTAAAAGTAATTTTGCATCTACGTGATTGTCTAGTCGATGGGCCTAAAGGTTTAATCAACCTTATCCATGTTGATCCGGAGAATTTTTCTCTAATTGGATTAAGTGATTTGGGTGAGAAAATTATAGATGGATTGGATAGTGTTTGTTTATTGGCTGTTGAATATATCGGTCCAGAATTAATTCTACCCGGAAATATATTTTCTTTGGAAATAATTGTTGAAGAGTTAGAGACTGGTAAAATTGATCTGCAGAGGTCTTGGTTTTTGCCGTTATTATCACGTGCAGTACCACAGAGATCAATTTCATTATCAATCTTTCATAGGCATATTCTTCCGTTAGCTGACAGAGCCCTTGCTGTAGCCAGTTTACATTCTTCAACGACTGTTTTATCTG ] [+] EMBL CD162286 [ GGGCCTAAAAGTTTAATCAACCTTATCCATGTTGATCCGGAGAATTTTTCTCTAATTGGATTAAATGATTTGGGTGAGAAAATTATAGATGGATTGGATAGTGTTTGTTTATTGGCTGTTGAATATATCGGTCCAGAATTAATTCTACCCGGAAATATATTTTCTTTGGAAATAATTGTTGAAGAGTTAGAGACTGGTAAAATTGATCTGCAGAGGTCTTGGTTTTTGCCGTTATTATCACGTGCAGTACCACAGAGATCAATTTCATTATCAATCTTTCATAGGCATATTCTTCCGTTAGCTGACAGAGCCCTTGCCGTAGCCAGTTTACATTCTTCAACGACTGTTTTATCTGATAAAACAAAGCCTCCAAATAATGCTTTGATGACTTCATCAATTAAGGTAGCTTGTCAACTTTGGTCCTCACTAAATATGTTTGTGCATCACAGTCCTATAGATTGGTCAGA ] [+] EMBL CD162137 [ GGGCCTAAAAGTTTAATCAACCTTATCCATGTTGATCCGGAGAATTTTTCTCTAATTGGATTAAATGATTTGGGTGAGAAAATTATAGATGGATTGGATAGTGTTTGTTTATTGGCTGTTGAATATATCGGTCCAGAATTAATTCTACCCGGAAATATATTTTCTTTGGAAATAATTGTTGAAGAGTTAGAGACTGGTAAAATTGATCTGCAGAGGTCTTGGTTTTTGCCGTTATTATCACGTGCAGTACCACAGAGATCAATTTCATTATCAATCTTTCAT ] [+] EMBL CD119699 [ cgctTCAATT CTTTAGCTTGTCAACTTTGGTCCTCACTAAATACGTTTGTGCATCACAGTCCTATAGATTGGTCAGAATTATCAACTGGTGGGTTAGGAAGTCGACTAGTTAAAGAATTGAGTGCAGCTCCCGCATTAAGACCAATTATTCTGCATACATTTCGCCGATTAGCTAAACTAGCTGTTGGTAATGATCCCGCCATTACAGTTATGCGTGGCGGTGCTAAAACAGCTATACCAAATATGCTATCTTTGTATGAAACACTGGACACGGTTA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||