cluster # 6294

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Schistosoma mansoni
cluster # 6294 cluster # 6294 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6294#0 length = 299 sequences # 4

consensusID : consensus_6294#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 299
fasta sequence

                              [GGCTCACGGAACTTTGTGTCGTTATCGGCGCGTTCTAGTTTTCGAGTTTGTTTTTCACTATTATTAGGTATGATCTCAGCCCTTAAA-TATATAACCATCTATGTCCACTTCTGCTTGTGGTCAAAAG-TGCTTCAAAACTTGCTTGT-TAGGATAAGTAACATTATTGCAATTTCTTAAT-GTAGTCCAGCGCTAA-AACTATCTG-CTGGGTTAACATTCCGGGTTACT-TTCATA-TCGCTATACTAAAACTAAAATCTAGCTATTATTTGAGTGTCTTCTAAAGATAAAACTAAAAGTTCGTT]

[+] EMBL CD167484             [GGCTCACGGAACTTTGTGTCGTTATCGGCGCG TCTAGTTTTCGAGTTTGTTTTTCACTATTATTAGGTATGATCTCAGCCCTTAAA TATAT ACCATCTATGTCCACTTCTGCTTGTGGTCAAAAG TGCTTCAAAACTTGCTTGT TAGGATAAGTAACATTATTGCAATTTCTTAAT GTAGTCCAGCGCTAA AACTATCTG CTGGGTTAACATTCCGGGTTACT TTCATA TCGCTATACTGAAACTAAAATCTAGCTATTATTTGAGTGTCTTCTAA                     ]
[-] EMBL CD167360             [                         CGGCGCGTTCTAGTTTTCGAGTTTGTTTTTCACTATTATTAGGTATGATCTCAGCCCTTAAA TATATAACCATCTATGTCCACTTCTGCTTGTGGTCAAAAG TGCTTCAAAACTTGCTTGT TAGGATAAGTAACATTATTGCAATTTCTTAAT GTAGTCCAGCGCTAA AACTATCTG CTGGGTTAACATTCCGGGTTACT TTCATA TCGCTATACTAAAACTAAAATCTAGCTATTATTTGAGTGTCTTCTATAGATAAAACTAAAAGTTCGTT]
[-] EMBL CD167407             [                         CGGCGCGTTCTAGTTTTCGAGTTTGTTTTTCACTATTATTAGGTATGATCTCAGCCCTTAAA TATATAACCATCTATGTCCACTTCTGCTTGTGGTCAAAAG TGCTTCAAAACTTGCTTGT TAGGATAAGTAACATTATTGCAATTTCTTAATCGTAGTCCAGCGCTAACAACTATCTGCCTGGGTTAACATTCCGGGTTACTGTTCATAGTCGCTATACTAAAACTAAAATCTAGCTATTATGTGAGTGTCTT TAAg                    ]
[+] EMBL CD167382             [                                           GAGTTTGTTTTACACTATTATTAGGTATGATCTCAGCCCTTAAAGTATATAACCATCTATGTCCACTTCTGCTTGTGGTCAAAAGATGCTTCAAAACTTGCTTGTGTAGGATAAGTAACATTATTGCAATTTCTTAAT GTAGTCCAGCGCTAA AACTATCTG CTGGGTTAACATTCCGGGTTACT TTCATA TCGCTATACTAAAACTAAAATCTAGCTATTATTTGAGTGTCTTCTAA                     ]




>consensus_6294#0
GGCTCACGGAACTTTGTGTCGTTATCGGCGCGTTCTAGTTTTCGAGTTTGTTTTTCACTA
TTATTAGGTATGATCTCAGCCCTTAAATATATAACCATCTATGTCCACTTCTGCTTGTGG
TCAAAAGTGCTTCAAAACTTGCTTGTTAGGATAAGTAACATTATTGCAATTTCTTAATGT
AGTCCAGCGCTAAAACTATCTGCTGGGTTAACATTCCGGGTTACTTTCATATCGCTATAC
TAAAACTAAAATCTAGCTATTATTTGAGTGTCTTCTAAAGATAAAACTAAAAGTTCGTT

clustalw multiple alignements is not computed in this case