Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 6299 cluster # 6299       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6299#0 length = 592 sequences # 4  

consensusID : consensus_6299#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 592
fasta sequence
                              [GAATGGACAGTATATTATTTTCTACGAAATTGCTAATTTTCCGTATTTTTTAATTTCATAATAAACCTTAATTGATCGTCTTTAAATCCATATTTTAAACCCAAATTGATTTTGATAATCGAAATGTTAT-TCGAATTCATCTATAACT-TCTCTTCGTACATGTTCCCATCCATAATTTTTCAACTTTCATTTGTAACTTCCTTCCAGTTAAGAGAAGTAGAAAATTTCAAAGTCTTGATACTCTCAGGCCCTTAAGAAAACTAAGTGATAATTAATATAGTGATCTGACGCCCTCCTGTAACTGAATTATCTTTATGATGCTCAAGTCTATCTTAGATCATTTTGTCCTAAATTAGCGATATCCGAAAGTCTGTATTTTACCAGATCTCTACGGTAAAATCGAACGTCGGTAATGTAGTACGTAGCTATTAGATAGCTATCTATGATTTTTCAACTGTAAAAGACTATATCGATAGCGGAGTATGTTAAATTTTTATGTAAATTTAATTGCAAAGCACAATGCGTGATTCAATGGTTTCGAACGGTTAACACTTAGTTTGCATATCTCGTAGTGAATTTGAATAATCGAAAC]

[+] EMBL CD091995             [GAATGGACAGTATATTATTTTCTACGAAATTGCTAATTTTCCGTATTTTTTAATTTCATAATAAACCTTAATTGATCGTCTTTAAATCCATATTTTAAACCCAAATTGATTTTGATAATCGAAATGTTAT TCGAATTCATCTATAACT TCTCTTCGTACATGTTCCCATCCATAATTTTTCAACTTTCATTTGTAACTTCCTTCCAGTTAAGAGCAGTAGAAAATTTCAAAGTCTTGATACTCTCAGGCCCTTAAGAAAACTAAGTGATAATTAATATAGTGATCTGACGCCCTCCTGTAACTGAATTATCTTTATGATGCTCAAGTCTATCTTAGATCATTTTGTCCTAAATTAGCGATATCCGAAAGTCTGTATTTTACCAGATCTCTACGGTAAAATCGAACGTCGGTAATGTAGTACGTAGCTATTAGATAGCTATCTATGATTTTTCAACTGTAAAAGACTATATCGATAGCGGAGTATGTTAAATTTTTATGTAAATTTAATTGCAAAGCACAATGCGTGATTCAATGGTTTCGAACGGTTAACACTTAGTTTGCATATCTCGTAGTGAATTTGAATAATCGAAA ]
[+] EMBL CD091929             [GAATGGACAGTATATTATTTTCTACGAAATTGCTAATTTTCCGTATTTTTTAATTTCATAATAAACCTTAATTGATCGTCTTTAAATCCATATTTTAAGCCCAAATTGATTTTGATAATCGAAATGTTAT TCGAATTCATCTATAACT TCTCTTCGTACATGTCCCCATCCATAATTTTTCAACTTTCATTTGTAACTTCCTTCCAGTTAAGAGAAGTAGAAAATTTCAAAGTCTTGATACTCTCAGGCCCTTAAGAAAACTAAGTGATAATTAATATAGTGATCTGACGCCCTCCTGTAACTGAATTATCTTTATGATGCTCAAGTCTATCTTAGATCATTTTGTCCTAAATTAGCGATATCCGAAAGTCTGTATTTTACCAGATCTCTACGGTAAAATCGAACGTCGGTAATGTAGTACGTAGCTATTAGATAGCTATCTATGATTTTTCAACTGTAAAAGACTATATCGATAGCGGAGTATGTTAAATTTTTATGTAAATTTAATTGCAAAGCACAATGCGTGATTCAATGGTTTCGAACGGTTAACACTTAGTTT                                 ]
[+] EMBL CD091990             [GAATGGACAGTATATTATTTTCTACGAAATTGCTAATTCTCCGTATTTTTTAATTTCATAATAAACCTTAATTGATCGTCTTTAAATCCATATTTTAAACCCAAATTGATTGTGATAATCGAAATGTTATATCGAATTCATCTATAACTACCTCTTCGGACATGTTCCCATCCATAATTTTTCAACTTTCATTTGCAACTTCCTTGCAGTTAAAAGAAGTAAAAAATTTCAGAGTCTTGATACTCTCAGGCCCTTAACAAAACTAAGTGATAATTAATATAGTGATCTGACGCCCTCCTGTAACTGAATTATCTTTATGATGCTCAGGTCTATCTTAGATCATTTTGTCCTAAATTACCGATATCCGAAAGTCTGTATTTTACCAGATCTCTACGGTAAAAT                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD091977             [                                                                          ATCGTCTTTAAATCCATATTTTAAACCCAAATTGATTTTGATAATCGAAATGTTAT TCGAATTCATCTATAACT TCTCTTCGTACATGTTCCCATCCATAATTTTTCAACTTTCATTTGTAACTTCCTTCCAGTTAAGAGAAGTAGAAAATTTCAAAGTCTTGATACTCTCAGGCCCTTAAGAAAACTAAGTGATAATTAATATAGTGATCTGACGCCCTCCTGTAACTGAATTATCTTTATGATGCTCAAGTCTATCTTAGATCATTTTGTCCTAAATTAGCGATATCCGAAAGTCTGTATTTTACCAGATCTCTACGGTAAAATCGAACGTCGGTAATGTAGTACGTAGCTATTAGATAGCTATCTATGATTTTTCAACTGTAAAAGACTATATCGATAGCGGAGTATGTTAAATTTTTATGTAAATTTAATTGCAAAGCACAATGCGTGATTCAATGGTTTCGAACGGTTAACACTTAGTTTGCATATCTCGTAGTGAATTTGAATAATCGAAAC]


>consensus_6299#0 GAATGGACAGTATATTATTTTCTACGAAATTGCTAATTTTCCGTATTTTTTAATTTCATA ATAAACCTTAATTGATCGTCTTTAAATCCATATTTTAAACCCAAATTGATTTTGATAATC GAAATGTTATTCGAATTCATCTATAACTTCTCTTCGTACATGTTCCCATCCATAATTTTT CAACTTTCATTTGTAACTTCCTTCCAGTTAAGAGAAGTAGAAAATTTCAAAGTCTTGATA CTCTCAGGCCCTTAAGAAAACTAAGTGATAATTAATATAGTGATCTGACGCCCTCCTGTA ACTGAATTATCTTTATGATGCTCAAGTCTATCTTAGATCATTTTGTCCTAAATTAGCGAT ATCCGAAAGTCTGTATTTTACCAGATCTCTACGGTAAAATCGAACGTCGGTAATGTAGTA CGTAGCTATTAGATAGCTATCTATGATTTTTCAACTGTAAAAGACTATATCGATAGCGGA GTATGTTAAATTTTTATGTAAATTTAATTGCAAAGCACAATGCGTGATTCAATGGTTTCG AACGGTTAACACTTAGTTTGCATATCTCGTAGTGAATTTGAATAATCGAAAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)