cluster # 6319

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 6319 cluster # 6319 Sequences # 4 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6319#0 length = 1405 sequences # 4
consensusID : consensus_6319#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1405
fasta sequence
                              [CAGGTATCCAGAGGTGGATCCCCATTCGGGATTTTTGNTGATGTGGATATGCGCAGCTTAGCTAATCAGTCTCCATCGACATCATTTCCTCATATGTCTATTCCACAGTCCCATGTAACTGGTGGACATGGACCTTTTGTTAATCAACCACTTCAAACTCTTTCCAGAGAAAACCCACTTGTATGCGATCTTCAAGTAATACGTCATCTTTTAATAACAAGAAATCCAACCGATATAAATATGTCAGTCGACTATCTATTAAGGTCAGGTATGACACCAACTGGAATCTTAGAATTAAATGGTTCATGGCTCCCATCTTTACATTATTTAGCTTCACTGGAAATAGTCGGACCACATCCTACCAATGAGAACAGTTCAACCAATTCAATCGATTTATTGTTATCATCATCCGGAAATATTATGTGGGGGATTACAGTATTAATACAATTGGCTAAAGGTTCATCCATAATTCGTCATGAAATATCACCATTTACAGGAGCTAGGGCTTTTTTACTTGCTGCTTTAAACAATCTGGCGTCAGTTAATTCTATCATACCACCTCCATCGTCATCATCTGTTAATCATGTTACAACAACATCCGGTCATGTAGTTGGAAAGCAATCTCGTCTTTGTGATGCTTTTCAATGGATTCGTGCTGGTATCAGACATGAATTACTATTGGCCGACTTACTGGAATTCTTGAATCCATCTTCATTTAATAATTTCGGTGGAAATAGTAATCAGTCACATTCAGGTACAAAATCAACTCTTCATCCTGGACAAGTATCATTAAATGATTTAATTAGACGAGTTAAAATTTGTCTTTGTTATGCTGCTGGTTTATCATCAAATGCGAATTCTTTAGAAACAACCATGGAATCCATGAATTTGATTGCTTTGTCTAAGGAGTTAATTACTGCAGCCACTTGTTTCTTGNTAATGGTCANAGAATGTGATTTCTTGTATCCCATGTCAATTTCATCAAAATCTATTTCACTACCTTCCGGAAGTATTTCATTTCGTGTCGCATGTGCTGGTTCCTTAGATTTAATTCGTATTCTTTTACATTTTCATGAAGTATTACATCCATCATCATCGTCTCATGAAAGTTCCAATTCAACAACCACATCATCATCAACAACAAACGCTCATGTAAATTCGGAAAAACAAAATTCTAACCATCCAATCAAAAACATTTTAAGCGCTACCGTTAAATTTGGTAATGCAGATAGATTAAAAACTGTTATAAATGAATTTTATGGATTAATTATTCATGGATGCCTTGTCTCTGCAAATAATTCCATAGATACAATAAATAATTTAGCATTATCTGGATCGGAACAATCAGTGCTACAACAACAACACCAACGTAGTTCTCGAAATTATCACTCAGATTCATTATCTA]

[-] EMBL CD093429             [CAGGTATCCAGAGGTGGATCCCCATTCGGGATTTTTGNTGATGTGGATATGCGCAGCTTAGCTAATCAGTCTCCATCGACATCATTTCCTCATATGTCTATTCCACAGTCCCATGTAACTGGTGGACATGGACCTTTTGTTAATCAACCACTTCAAACTCTTTCCAGAGAAAACCCACTTGTATGCGATCTTCAAGTAATACGTCATCTTTTAATAACAAGAAATCCAACCGATATAAATATGTCAGTCGACTATCTATTAAGGTCAGGTATGACACCAACTGGAATCTTAGAATTAAATGGTTCATGGCTCCCATCTTTACATTATTTAGCTTCACTGGAAATAGTCGGACCACATCCTACCAATGAGAACAGTTCAACCAATTCAATCGATTTATTGTTATCATCATCCGGAAATATTATGTGGGGGATTACAGTATTAATACAATTGGCTAAAGGTTCATCCATAATTCGTCATGAAATATCAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD093417             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AATTCAATCGAATTATTGTTATCATCATCCGGAAATATTATGTGGGGGATTACAGTATTAATACAATTGGCTAAAGGTTCATCCATAATTCGTCATGAAATATCAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD153007             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATGTGGGGGATTACAGTATTAATACAATTGGCTAAAGGTTCATCCATAATTCGTCATGAAATATCACCATTTACAGGAGCTAGGGCTTTTTTACTTGCTGCTTTAAACAATCTGGCGTCAGTTAATTCTATCATACCACCTCCATCGTCATCATCTGTTAATCATGTTACAACAACATCCGGTCATGTAGTTGGAAAGCAATCTCGTCTTTGTGATGCTTTTCAATGGATTCGTGCTGGTATCAGACATGAATTACTATTGGCCGACTTACTGGAATTCTTGAATCCATCTTCATTTAATAATTTCGGTGGAAATAGTAATCAGTCACATTCAGGTACAAAATCAACTCTTCATCCTGGACAAGTATCATTAAATGATTTAATTAGACGAGTTAAAATTTGTCTTTGTTATGCTGCTGGTTTATCATCAAATGCGAATTCTTTAGAAACAACCATGGAATCCATGAATTTGATTGCTTTGTCTAAGGAGTTAATTACTGCAGCCACTTGTTTCTTGNTAATGGTCANAGAATGTGATTTCTTGTATCCCATGTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD092066             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AATTCTTTAGAAACAAAAATGGAATCCATGAATTTGATTGCTNTGTCAAAGGAGTTAATTACTGCAGCCACTTGTTTCTTGTTAATGGTCAAAGTATGTGATTTCTTGTATCCCATGTCAATTTCATCAAAATCTATTTCACTACCTTCCGGAAGTATTTCATTTCGTGTCGCATGTGCTGGTTCCTTAGATTTAATTCGTATTCTTTTACATTTTCATGAAGTATTACATCCATCATCATCGTCTCATGAAAGTTCCAATTCAACAACCACATCATCATCAACAACAAACGCTCATGTAAATTCGGAAAAACAAAATTCTAACCATCCAATCAAAAACATTTTAAGCGCTACCGTTAAATTTGGTAATGCAGATAGATTAAAAACTGTTATAAATGAATTTTATGGATTAATTATTCATGGATGCCTTGTCTCTGCAAATAATTCCATAGATACAATAAATAATTTAGCATTATCTGGATCGGAACAATCAGTGCTACAACAACAACACCAACGTAGTTCTCGAAATTATCACTCAGATTCATTATCTA]




>consensus_6319#0
CAGGTATCCAGAGGTGGATCCCCATTCGGGATTTTTGNTGATGTGGATATGCGCAGCTTA
GCTAATCAGTCTCCATCGACATCATTTCCTCATATGTCTATTCCACAGTCCCATGTAACT
GGTGGACATGGACCTTTTGTTAATCAACCACTTCAAACTCTTTCCAGAGAAAACCCACTT
GTATGCGATCTTCAAGTAATACGTCATCTTTTAATAACAAGAAATCCAACCGATATAAAT
ATGTCAGTCGACTATCTATTAAGGTCAGGTATGACACCAACTGGAATCTTAGAATTAAAT
GGTTCATGGCTCCCATCTTTACATTATTTAGCTTCACTGGAAATAGTCGGACCACATCCT
ACCAATGAGAACAGTTCAACCAATTCAATCGATTTATTGTTATCATCATCCGGAAATATT
ATGTGGGGGATTACAGTATTAATACAATTGGCTAAAGGTTCATCCATAATTCGTCATGAA
ATATCACCATTTACAGGAGCTAGGGCTTTTTTACTTGCTGCTTTAAACAATCTGGCGTCA
GTTAATTCTATCATACCACCTCCATCGTCATCATCTGTTAATCATGTTACAACAACATCC
GGTCATGTAGTTGGAAAGCAATCTCGTCTTTGTGATGCTTTTCAATGGATTCGTGCTGGT
ATCAGACATGAATTACTATTGGCCGACTTACTGGAATTCTTGAATCCATCTTCATTTAAT
AATTTCGGTGGAAATAGTAATCAGTCACATTCAGGTACAAAATCAACTCTTCATCCTGGA
CAAGTATCATTAAATGATTTAATTAGACGAGTTAAAATTTGTCTTTGTTATGCTGCTGGT
TTATCATCAAATGCGAATTCTTTAGAAACAACCATGGAATCCATGAATTTGATTGCTTTG
TCTAAGGAGTTAATTACTGCAGCCACTTGTTTCTTGNTAATGGTCANAGAATGTGATTTC
TTGTATCCCATGTCAATTTCATCAAAATCTATTTCACTACCTTCCGGAAGTATTTCATTT
CGTGTCGCATGTGCTGGTTCCTTAGATTTAATTCGTATTCTTTTACATTTTCATGAAGTA
TTACATCCATCATCATCGTCTCATGAAAGTTCCAATTCAACAACCACATCATCATCAACA
ACAAACGCTCATGTAAATTCGGAAAAACAAAATTCTAACCATCCAATCAAAAACATTTTA
AGCGCTACCGTTAAATTTGGTAATGCAGATAGATTAAAAACTGTTATAAATGAATTTTAT
GGATTAATTATTCATGGATGCCTTGTCTCTGCAAATAATTCCATAGATACAATAAATAAT
TTAGCATTATCTGGATCGGAACAATCAGTGCTACAACAACAACACCAACGTAGTTCTCGA
AATTATCACTCAGATTCATTATCTA
clustalw multiple alignements is not computed in this case