These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6324#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 800 fasta sequence [TCGACGACATTCAACTACCATTTTTTATGCCATTTTTCTTGTCAGTGAATCAATATGAGGAAAATGAAGAAGAAAAACTTGTTAATAAAATAAAAACACACATACAAATGGACTATTTATTTATTTGGCTGATTGATTTTCATCAGTTCTATTATCTGTTTTTTGATTTCCTACTAACACATCCACAAATTAATGATTTTCCTTTATTCTTTGATTTATTACTGTTTGCTTTCGGTTGAACGATCAAAATCTGTTTTGGTTGATCTTTCTTCTTTTTACTTAATATTGACGTTATTGTTCTAGATTTTGGTTGATTTTCTGGAGTAGGAGCACATTCATTAGTATCAGCGATATGATTAGCTTCTAATCTAATGAATCTGTCAGGATTCCATGACCAGTAATCTTCTTCCAGACTCAGACTACTACCTTCATCTGATCCATTATCTTCACCTTTATTTTCACGTAATCTTCGTGGCAAGAAAGCGTCATCATCAATATATGGTACATCATAAGCACCTTCTGGGATACCCTCCTCTAAACTTCGTACGCTAATACTTTTGTCTACCTTAGATGGTGTTACAGAATCTGGATACAAATAATCGTCATTAACAGTTGGTTTTGGTTGCAGGCGTCGTTTACGTCTAAATTCATTGCGTTCTAGGGTTACTGCTCTTTTTTTAACATCACTTGTATCTATATATGAGTATCTATTCTCATTAAATTTGGATTTACTAAATCTGTCTAGTGTTTTAGTTCGTCTTGATCTATCATTCTTTTTTGATTGCCTCCTAGCCGGGGGA] [+] EMBL CD064337 [TCGACGACATTCAACTACCATTTTTTATGCCATTTTTCTTGTCAGTGAATCAATATGAGGAAAATGAAGAAGAAAAACTTGTTAATAAAATAAAAACACACATACAAATGGACTATTTATTTATTTGGCTGATTGATTTTCATCAGTTCTATTATCTGTTTTTTGATTTCCTACTAACACATCCACAAATTAATGATTTTCCTTTATTCTTT ] [+] EMBL CD074598 [ ACTATTTATTTATTTGGCTGATTGATTCTCATCAGTTCTATTATCTGTTTTTTGATTTCCTACTAACACATCCACAAATTAATGATTTTCCTTTATTCTTTGATTTATTACTGTTTGCTTTCGGTTGAACGATCAAAATCTGTTTTGGTTGATCTTTCTTCTTTTTACTTAATATTGACGTTATTGTTCTAGATTTTGGTTGATTTTCTGGAGTAGGAGCACATTCATTAGTATCAGCGATATGATTAGCTTCTAATCTAATGAATCTGTCAGGATTCCATGACCAGTAATCTTCTTCCAGACTCAGACTACTACCTTCATCTGATCCATTATCTTCACCTTTATTTTCACGTAATCTTCGTGGCAAGAAAGCGTCATCATCAATATATGGTACATCATAAGCACCTTCTGGGATACCCTCCTCTAAACTTCGTACGCTAATACTTTTGTCTACCTTAGATGGTGTTACAGAATCTGGATACAAATAATCGTCATTAACAGTTGGTTTTGGTTGCAGGCGTCGTTTACGTCTAAATTCATTGCGTTCTAGGGTTACTGCTCTTTTTTTAACATCACTTGTATCTATATATGAGTATCTATTCTCATTAAATTTGGATTTACTAAATCTGTCTAGTGTTTTAGTTCGTCTTGATCTATCATTCTTTTTTGAT ] [+] EMBL CD168131 [ CAGTAATCTTCTTCCAGACTCAGACTACTACCTTCATCTGATCCATTATCTTCACCTTTATTTTCACGTAATCTTCGTGGCAAGAAAGCGTCATCATCAATATATGGTACATCATAAGCACCTTCTGGGATACCCTCCTCTAAACTTCGTACGCTAATACTTTTGTCTACCTTAGATGGTGTTACAGAATCTGGATACAAATAATCGTCATTAACAGTTGGTTTTGGTTGCAGGCGTCGTTTACGTCTAAATTCATTGCGTTCTAGGGTTACTGCTCTTTTTTTAACATCACTTGTATCTATATATGAGTATCTATTCTCATTAAATTTGGATTTACTAAATCTGTCTAGTGTTTTAGTTCGTCTTGATCAATAATTTTTTTCTGATTGCCTCCTAGCCGGGGGA] [-] EMBL CD192071 [ GGTACATCATAAGCACCTTCTGGGATACCCTCCTCTAAACTTCGTACGCTAATACTTTTGTCTACCTTAGATGGTGTTACAGAATCTGGATACAAATAATCGTCATTAACAGTTGGTTTTGGTTGCAGGCGTCGTTTACGTCTAAATTCATTGCGTTCTAGGGTTACTGCTCTTTTTTTAACATCACTTGTATCTATATATGAGTATCTATTCTCATTAAATTTGGATTTACTAAATCTGTCTAGTGTTTTAG ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||