These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6336#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 378 fasta sequence [ATGGATCTGAATTAAAATAGCATTTAATGAGAATTTACGATCTGGTAAATCAAATTAAAATGAGTAATAAAGGCATACTTTCAGTAACGGGAATATTCACGAAATCAAATGGTCATTACTATGTTTCCTTATGAAGAATAGCTGACATTTTGTTGAGATTATTTAAGTCGAGCCTGAAGCCGATAAGTCACTTTAAAGTGTGTTAGAGAGTAGGTTAATAGTGATTAACAATGGAACAGAGGATTTGAATTTCGTCCTGCTTTTGACTCGTCAGATGAATGCACTTTCATCTCATTGTTGTTC-TTCACACTGGAACTCGAAC-TTTGTACGTAACAATGTAATAGAAAGTGTTTCAGTCATCATATTTCATTTGTATTC] [+] EMBL CD198855 [ATGGATCTGAATTAAAATAGCATTTAATGAGAATTTACGATCTGGTAAATCAAATTAAAATGAGTAATAAAGGCATACTTTCAGTAACGGGAATATTCACGAAATCAAATGGTCATTACTATGTTTCCTTATGAAGAATAGCTGACATTTTGTTGAGATTATTTAAGTCGAGCCTGAAGCCGATAAGTCACTTTAAAGTGTGTTAGAGAGTAGGTTAATAGTGATTAACAATGGAACAGAGGATTTGAATTTCGTCCTGCTTTTGACTCGTCAGATGAATGCACTTTCATCTCATTGTTGTTC TTCACACCGGAACTCGAAC TTTGTACGTAACAATGTAATAGAAAGTGTTTCAGTCATCATATTTCATTTGTATTC] [+] EMBL CD199044 [ATGGATCTGAATTAAAATAGCATTTAATGAGAATTTACGATCTGGTAAATCAAATTAAAATGAGTAATAAAGGCATACTTTCAGTAACGGGAATATTCACGAAATCAAATGGTCATTACTATGTTTCCTTATGAAGAATAGCTGACATTTTGTTGAGATTATTTAAGTCGAGCCTGAAGCCGATAAGTCACTTTAAAGTGTGTTAGAGAGTAGGTTAATAGTGATTAACAATGGAACAGAGGATTTGAATTTCGTCCTGCTTTTGACTCGTCAGATGAATGCACTTTCATCTCATTGTTGTTC TTCACACTGGAACTCGAAC TTTGTACGTAACAATGTAATAGAAAGTGT ] [+] EMBL CD198997 [ATGGATCTGAATTAAAATAGCATTTAATGAGAATTTACGATCTGGTAAATCAAATTAAAATGAGTAATAAAGGCATACTTTCAGTAACGGGAATATTCACGAAATCAAATGGTCATTACTATGTTTCCTTATGAAGAATAGCTGACATTTTGTTGAGATTATTTAAGTCGAGCCTGAAGCCGATAAGTCACTTTAAAGTGTGTTAGAGAGTAGGTTAATAGTGATTAACAATNGGACAGAGGATTTGAATTTCGTCCTGCTTTTGACTCGTCAGATGAATGCACTTTCATCTCATTGTTGTTCTTTCACACTGG ACTCGAACTTTTGTACG ] [+] EMBL CD199162 [ATGGATCTGAATTAAAATAGCATTTAATGAGAATTTACGATCTGGTAAATCAAATTAAAATGAGTAATAAAGGCATACTTTCAGTAACGGGAATATTCACGAGATCAAATGGTCATTACTATGTTTCCTTATGAAGAATAGCTGACATTTTGTTGAGATTATTTAAGTCGAGCCTGAAGCCGATAAGTCACTTTAAAGTGTGTTAGAGAGTAGGTTAATAGTGATTAACAATGGAACAGAGGATTTGAATTTCGTCCTGCTTTTGACTCGTCAGATGAATGCACTTTCATCTCATTGNTGTTC TTC ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||