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Schistosoma mansoni
cluster # 6362 cluster # 6362       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6362#0 length = 715 sequences # 4  

consensusID : consensus_6362#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 715
fasta sequence
                              [AAAGCGAAAGTTGTCTGAAACTGTTAAAAGTAATTCATTGTCTAGTAATATTGACTCTACAATAGACCATTCTACTTCACCAGATGGCGATACAGAACCCTCCGGATCATTACTAATAGACTTAGCTGCCTCTGATTTTTCACCTAAGGTTGTGTCGGAAGCAATGAATTCACATCTTAAGGATGTTCCTCACTTCTTGTCATGCAATACTAGTTCTGATTGTATTCAATCTGTTAAAGAATGTGGACGTGATGATTCTGTAGATCGGTGGTCACATGCATACGGAAATCAGAACAGTATAGATTGTAATCATAGTTCAACAGGATTGCTAGGAAATTGTAATGTCGACTCTTCGGATTCAGCTCCATTAAACTCACTTTAAATGTCTATTTTGTATCTATGAATAAAGAAATATATTAATGTATTTTGAAATGTTTCTATGGTTACATATGTACTGTAAGAAATGTTGGAATTTTAGTTTTTCTTTTTAACTAACTTAGTTCCAAATCTTCTTGTTTTAAACCAACATTTATTTAAAATCAAATCGCCAAACATTGAATTTCAGTATCATTTTTGATGTGTCCTATCGATTCATCGGTTATAGTTTATTTTTCTTTTTTGCACTTGTGTTTTCTTTTTTGTAGTTCACATTTTTTTGTAATTTTTTGAATACATGTATGCTCTTGGCTTACAAACAGTGCAACAAAATTTATTT]

[+] EMBL CD196778             [AAAGCGAAAGTTGTCTGAAACTGTTAAAAGTAATTCATTGTCTAGTAATATTGACTCTACAATAGACCATTCTACTTCACCAGATGGCGATACAGAACCCTCCGGATCATTACTAATAGACTTAGCTGCCTCTGATTTTTCACCTAAGGTTGTGTCGGAAGCAATGAATTCACATCTTAAGGATGTTCCTCACTTCTTGTCATGCAATACTAGTTCTGATTGTATTCAATCTGTTAAAGAATGTGGACGTGATGATTCTGTAGATCGGTGGTCACATGCATACGGAAATCAGAACAGTATAGATTGTAATCATAGTTCAACAGGATTGCTAGGAAATTGTAATGTCGACTCTTCGGATTCAGCTCCATTAAACTCACTTTAAATGTCTATTTTGTATCTATGAATAAAGAAATATATTAATGTATTTTGAAATGTTTCTATGGTTACATATGTACT                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL AW017224             [                                                                                                                                                                  AATGAATTCACATCTTAAGGATGTTCCTCACTTCTTGTCATGCAATACTAGTTCTGATTGTATTCAATCTGTTAAAGAATGTGGACGTGATGATTCTGTAGATCGGTGGTCACATGCATACGGAAATCAGAACAGTATAGATTGTAATCATAGTTCAACAGGATTGCTAGGAAATTGTAATGTCGACTCTTCGGATTCAGCTCCATTAAACTCACTTTAAATGTCTATTTTGTATCTATGAATAAAGAAATATATTAATGTATTTTGAAATGTTTCTATGGTTACATATGTACTGTAAGAAATGTTGGAATTTTAGTTTTTCTTTTTAACTAACTTAGTTCCAAATCTTCTTGTTTTAAACCAACATTTATTTAAAATCAAATCGCCAAACATTGAATTTCAGTATCATTTTTGATGTGTCCTATCGATTCATCGGTTATAGTTTATTTTTCTTTTTTGCACTTGTGTTTTCTTTTTTGTAGTTCACATTATTTTGTAATTTTTTGAATACATGTATGCTCTTGGCTTACAAACAGTGCAACAAAATTTATTT]
[+] EMBL CD083653             [                                                                                                                                                                                                         gTGCAATACTAGTTCTGATTGTATTCAATCTGTTAAAGAATGTGGACGTGATGATTCTGTAGATCGGTGGTCACATGCATACGGAAATCAGAACAGTATAGATTGTAATCATAGTTCAACAGGATTGCTAGGAAATTGTAATGTCGACTCTTCGGATTCAGCTCCATTAAACTCACTTTAAATGTCTATTTTGTATCTATGAATAAAGAAATATATTAATGTATTTTGAAATGTTTCTATGGTTACATATGTACTGTAAGAAATGTTGGAATTTTAGTTTTTCTTTTTAACTAACTTAGTTCCAAATCTTCTTGTTTTAAACCAACATTTATTTAAAATCAAATCGCCAAACATTGAATTTCAGTATCATTTTTGATGTGTCCTATCGATTCATCGGTTATAGTTTATTTTTCTTTTTTGCACTTGTGTTTTCTTTTTTGTAGTTCACATTTTTTTGTAATTTTTTGAATACATGTATGCTCTTGGCTTACAAACA                  ]
[-] EMBL CD196555             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AACAGTATAGATTGTAATCATAGTTCAACAGGATTGCTAGGAAATTGTAATGTCGACTCTTCGGATTCAGCTCCATTAAACTCACTTTAAATGTCTATTTTGTATCTATGAATAAAGAAATATATTAATGTATTTTGAAATGTTTCTATGGTTACATATGTACTGTAAGAAATGTTGGAATTTTAGTTTTTCTTTTCAACTAACTTAGTTCCAAATCTTCTTGTTTTAAACCAACATTTATTTAAAATCAAATCGCCAAACATTGAATTTCAGTATCATTTTTGATGTGTCCTATCGATTCATCGGTTATAGTTTATTTTTCTTTTTTGCACTTGTGTTTTCTTTTTTGTAGTTCACATTTTTTTGTAATTTTTTGAAT                                            ]


>consensus_6362#0 AAAGCGAAAGTTGTCTGAAACTGTTAAAAGTAATTCATTGTCTAGTAATATTGACTCTAC AATAGACCATTCTACTTCACCAGATGGCGATACAGAACCCTCCGGATCATTACTAATAGA CTTAGCTGCCTCTGATTTTTCACCTAAGGTTGTGTCGGAAGCAATGAATTCACATCTTAA GGATGTTCCTCACTTCTTGTCATGCAATACTAGTTCTGATTGTATTCAATCTGTTAAAGA ATGTGGACGTGATGATTCTGTAGATCGGTGGTCACATGCATACGGAAATCAGAACAGTAT AGATTGTAATCATAGTTCAACAGGATTGCTAGGAAATTGTAATGTCGACTCTTCGGATTC AGCTCCATTAAACTCACTTTAAATGTCTATTTTGTATCTATGAATAAAGAAATATATTAA TGTATTTTGAAATGTTTCTATGGTTACATATGTACTGTAAGAAATGTTGGAATTTTAGTT TTTCTTTTTAACTAACTTAGTTCCAAATCTTCTTGTTTTAAACCAACATTTATTTAAAAT CAAATCGCCAAACATTGAATTTCAGTATCATTTTTGATGTGTCCTATCGATTCATCGGTT ATAGTTTATTTTTCTTTTTTGCACTTGTGTTTTCTTTTTTGTAGTTCACATTTTTTTGTA ATTTTTTGAATACATGTATGCTCTTGGCTTACAAACAGTGCAACAAAATTTATTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)