|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6389#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 953 fasta sequence
[TTGAATTAATAAGCTGTCCTAATAAGGATGCATCCCACCCAGGTCAAATACTGTCATCGATTCCTCCACCTCTCGCTTCGCTGACTTCTCCAACACCACAATCTAAACCACGAGGAAATATGGGAGCTTGTTTTTCATTAGTATTTCAAGGTTGTCCATTAAAAATTAATTCAACTGCAACATGGATTAATCCAGCTAATAATGGTCAAGTTATTCTATTGGGTACAAATGATGGTATATATTGTTTACAATTGAAAGGACTTTCTGAGAATTCTCTAGAATTACTATTTCCACGTCGTTGTTTATGGTTATCTGTTACTCGAGATACTATGATGTCACTATCTGGTCGTCATCCTCAATTGTATGCACACCATTTGGTTTCTTTGATGAAATTAAAATCTCAAGGTCACTCTATGAGTGGTGGTGGTAGTACAGTTGGAGGCAGTGGCGGAGGTAGCGGTGGAAATGTTAGTGGTCTTGGTGGAGCTGCATCAAAATTTGGCAAATTTGTTAAACTGTTTCCTAAACGATTTTCACCATCGAAAAAAATGCCTGATACAAAAGGATGTTTACGTGCTAATGTTACACGTAATCCATTTAATGGTGCTAAATATTTATGTGCAGCTATGACAAATGAAATTTTAGTAATGGAATGGTTTAATCCTGTATCATCATTTATTGAAATTAAAAGAATATTTGTTCCTGATATGCCTTCACCTTTATTGAATTTTGATTTATTAATTGTGAAAAATCTTCCTTTACCATTTGTTTGTGTTGGAGTCTATCGACATCATTCTCGTAAAGGTCGAGAAGGTCAACGTTTTCGTTTACATTTAATTGATTTAAATAGTTCTGGACCTAATCCACCACAGATACCTCCAATAGTTTCATCTATTACTCCTCCTATTTCAATATCCTCTGTTACTGCTGTTTCTATCACTGCAATGGCATCA]
[+] EMBL CD117218 [TTGAATTAATAAGCTGTCCTAATAAGGATGCATCCCACCCAGGTCAAATACTGTCATCGATTCCTCCACCTCTCGCTTCGCTGACTTCTCCAACACCACAATCTAAACCACGAGGAAATATGGGAGCTTGTTTTTCATTAGTATTTCAAGGTTGTCCATTAAAAATTAATTCAACTGCAACATGGATTAATCCAGCTAATAATGGTCAAGTTATTCTATTGGGTACAAATGATGGTATATATTGTTTACAATTGAAAGGACTTTCTGAGAATTCTCTAGAATTACTATTTCCACGTCGTTGTTTATGGTTATCTGTTACTCGAGATACTATGATGTCACTATCTGGTCGTCATCCTCAATTGTATGCACACCATTTGGTTTCTTTGATGAAATTAAAATCTCAAGGTCACTCTATGAGTGGTGGTGGTAGTACAGTTGGAGGCAGTGGCGGAGGTAGCGGTGGAAATGTTAGTGGTCTTGGTGGAGCTGCATCAAAATTTGGCAAATTTGTTAAACTGTTTCCTAAACGATTTTCAC ]
[+] EMBL CD150749 [ AAATTTGGCAAATTTGTTAAACTGTTTCCTAAACGATTTTCACCATCGAAAAAAATGCCTGATACAAAAGGATGTTTACGTGCTAATGTTACACGTAATCCATTTAATGGTGCTAAATATTTATGTGCAGCTATGACAAATGAAATTTTAGTAATGGAATGGTTTAATCCTGTATCATCATTTATTGAAATTAAAAGAATATTTGTTCCTGATATGCCTTCACCTTTATTGAATTTTGATTTATTAATTGTGAAAAATCTTCCTTTACCATTTGTTTGTGTTGGAGTCTATCGACATCATTCTCGTAAAGGTCGAGAAGGTCAACGTTTTCGTTTACATTTAATTGATTTAAATAGTTCTGGACCTAATCCACCACAGATACCTCCAATAGTTTCATCTATTACTCCTCC ]
[-] EMBL SMRAP071 [ CGTGCTAATGTTACACGTAATCCATTTA GTGCTAAATATTTATGTGCAGCTATGACAAATGAAATTT GTAATGGAATGGTT ATCCTGTATCATCATTTATTGAAATTAAAAGAATATTTGTTCCTGATATGCCTTCACCTTTATTGAATTTTGATTTATTAATTG ]
[+] EMBL CD190219 [ ATTTTAGTAATGGAATGGTTTAATCCTGTATCATCATTTATTGAAATTAAAAGAATATTTGTTCCTGATATGCCTTCACCTTTATTGAATTTTGATTTATTAATTGTGAAAAATCTTCCTTTACCATTTGTTTGTGTTGGAGTCTATCGACATCATTCTCGTAAAGGTCGAGAAGGTCAACGTTTTCGTTTACATTTAATTGATTTAAATAGTTCTGGACCTAATCCACCACAGATACCTCCAATAGTTTCATCTATTACTCCTCCTATTTCAATATCCTCTGTTACTGCTGTTTCTATCACTGCAATGGCATCA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||