These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6389#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 953 fasta sequence [TTGAATTAATAAGCTGTCCTAATAAGGATGCATCCCACCCAGGTCAAATACTGTCATCGATTCCTCCACCTCTCGCTTCGCTGACTTCTCCAACACCACAATCTAAACCACGAGGAAATATGGGAGCTTGTTTTTCATTAGTATTTCAAGGTTGTCCATTAAAAATTAATTCAACTGCAACATGGATTAATCCAGCTAATAATGGTCAAGTTATTCTATTGGGTACAAATGATGGTATATATTGTTTACAATTGAAAGGACTTTCTGAGAATTCTCTAGAATTACTATTTCCACGTCGTTGTTTATGGTTATCTGTTACTCGAGATACTATGATGTCACTATCTGGTCGTCATCCTCAATTGTATGCACACCATTTGGTTTCTTTGATGAAATTAAAATCTCAAGGTCACTCTATGAGTGGTGGTGGTAGTACAGTTGGAGGCAGTGGCGGAGGTAGCGGTGGAAATGTTAGTGGTCTTGGTGGAGCTGCATCAAAATTTGGCAAATTTGTTAAACTGTTTCCTAAACGATTTTCACCATCGAAAAAAATGCCTGATACAAAAGGATGTTTACGTGCTAATGTTACACGTAATCCATTTAATGGTGCTAAATATTTATGTGCAGCTATGACAAATGAAATTTTAGTAATGGAATGGTTTAATCCTGTATCATCATTTATTGAAATTAAAAGAATATTTGTTCCTGATATGCCTTCACCTTTATTGAATTTTGATTTATTAATTGTGAAAAATCTTCCTTTACCATTTGTTTGTGTTGGAGTCTATCGACATCATTCTCGTAAAGGTCGAGAAGGTCAACGTTTTCGTTTACATTTAATTGATTTAAATAGTTCTGGACCTAATCCACCACAGATACCTCCAATAGTTTCATCTATTACTCCTCCTATTTCAATATCCTCTGTTACTGCTGTTTCTATCACTGCAATGGCATCA] [+] EMBL CD117218 [TTGAATTAATAAGCTGTCCTAATAAGGATGCATCCCACCCAGGTCAAATACTGTCATCGATTCCTCCACCTCTCGCTTCGCTGACTTCTCCAACACCACAATCTAAACCACGAGGAAATATGGGAGCTTGTTTTTCATTAGTATTTCAAGGTTGTCCATTAAAAATTAATTCAACTGCAACATGGATTAATCCAGCTAATAATGGTCAAGTTATTCTATTGGGTACAAATGATGGTATATATTGTTTACAATTGAAAGGACTTTCTGAGAATTCTCTAGAATTACTATTTCCACGTCGTTGTTTATGGTTATCTGTTACTCGAGATACTATGATGTCACTATCTGGTCGTCATCCTCAATTGTATGCACACCATTTGGTTTCTTTGATGAAATTAAAATCTCAAGGTCACTCTATGAGTGGTGGTGGTAGTACAGTTGGAGGCAGTGGCGGAGGTAGCGGTGGAAATGTTAGTGGTCTTGGTGGAGCTGCATCAAAATTTGGCAAATTTGTTAAACTGTTTCCTAAACGATTTTCAC ] [+] EMBL CD150749 [ AAATTTGGCAAATTTGTTAAACTGTTTCCTAAACGATTTTCACCATCGAAAAAAATGCCTGATACAAAAGGATGTTTACGTGCTAATGTTACACGTAATCCATTTAATGGTGCTAAATATTTATGTGCAGCTATGACAAATGAAATTTTAGTAATGGAATGGTTTAATCCTGTATCATCATTTATTGAAATTAAAAGAATATTTGTTCCTGATATGCCTTCACCTTTATTGAATTTTGATTTATTAATTGTGAAAAATCTTCCTTTACCATTTGTTTGTGTTGGAGTCTATCGACATCATTCTCGTAAAGGTCGAGAAGGTCAACGTTTTCGTTTACATTTAATTGATTTAAATAGTTCTGGACCTAATCCACCACAGATACCTCCAATAGTTTCATCTATTACTCCTCC ] [-] EMBL SMRAP071 [ CGTGCTAATGTTACACGTAATCCATTTA GTGCTAAATATTTATGTGCAGCTATGACAAATGAAATTT GTAATGGAATGGTT ATCCTGTATCATCATTTATTGAAATTAAAAGAATATTTGTTCCTGATATGCCTTCACCTTTATTGAATTTTGATTTATTAATTG ] [+] EMBL CD190219 [ ATTTTAGTAATGGAATGGTTTAATCCTGTATCATCATTTATTGAAATTAAAAGAATATTTGTTCCTGATATGCCTTCACCTTTATTGAATTTTGATTTATTAATTGTGAAAAATCTTCCTTTACCATTTGTTTGTGTTGGAGTCTATCGACATCATTCTCGTAAAGGTCGAGAAGGTCAACGTTTTCGTTTACATTTAATTGATTTAAATAGTTCTGGACCTAATCCACCACAGATACCTCCAATAGTTTCATCTATTACTCCTCCTATTTCAATATCCTCTGTTACTGCTGTTTCTATCACTGCAATGGCATCA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||