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Schistosoma mansoni
cluster # 6389 cluster # 6389       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6389#0 length = 953 sequences # 4  

consensusID : consensus_6389#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 953
fasta sequence
                              [TTGAATTAATAAGCTGTCCTAATAAGGATGCATCCCACCCAGGTCAAATACTGTCATCGATTCCTCCACCTCTCGCTTCGCTGACTTCTCCAACACCACAATCTAAACCACGAGGAAATATGGGAGCTTGTTTTTCATTAGTATTTCAAGGTTGTCCATTAAAAATTAATTCAACTGCAACATGGATTAATCCAGCTAATAATGGTCAAGTTATTCTATTGGGTACAAATGATGGTATATATTGTTTACAATTGAAAGGACTTTCTGAGAATTCTCTAGAATTACTATTTCCACGTCGTTGTTTATGGTTATCTGTTACTCGAGATACTATGATGTCACTATCTGGTCGTCATCCTCAATTGTATGCACACCATTTGGTTTCTTTGATGAAATTAAAATCTCAAGGTCACTCTATGAGTGGTGGTGGTAGTACAGTTGGAGGCAGTGGCGGAGGTAGCGGTGGAAATGTTAGTGGTCTTGGTGGAGCTGCATCAAAATTTGGCAAATTTGTTAAACTGTTTCCTAAACGATTTTCACCATCGAAAAAAATGCCTGATACAAAAGGATGTTTACGTGCTAATGTTACACGTAATCCATTTAATGGTGCTAAATATTTATGTGCAGCTATGACAAATGAAATTTTAGTAATGGAATGGTTTAATCCTGTATCATCATTTATTGAAATTAAAAGAATATTTGTTCCTGATATGCCTTCACCTTTATTGAATTTTGATTTATTAATTGTGAAAAATCTTCCTTTACCATTTGTTTGTGTTGGAGTCTATCGACATCATTCTCGTAAAGGTCGAGAAGGTCAACGTTTTCGTTTACATTTAATTGATTTAAATAGTTCTGGACCTAATCCACCACAGATACCTCCAATAGTTTCATCTATTACTCCTCCTATTTCAATATCCTCTGTTACTGCTGTTTCTATCACTGCAATGGCATCA]

[+] EMBL CD117218             [TTGAATTAATAAGCTGTCCTAATAAGGATGCATCCCACCCAGGTCAAATACTGTCATCGATTCCTCCACCTCTCGCTTCGCTGACTTCTCCAACACCACAATCTAAACCACGAGGAAATATGGGAGCTTGTTTTTCATTAGTATTTCAAGGTTGTCCATTAAAAATTAATTCAACTGCAACATGGATTAATCCAGCTAATAATGGTCAAGTTATTCTATTGGGTACAAATGATGGTATATATTGTTTACAATTGAAAGGACTTTCTGAGAATTCTCTAGAATTACTATTTCCACGTCGTTGTTTATGGTTATCTGTTACTCGAGATACTATGATGTCACTATCTGGTCGTCATCCTCAATTGTATGCACACCATTTGGTTTCTTTGATGAAATTAAAATCTCAAGGTCACTCTATGAGTGGTGGTGGTAGTACAGTTGGAGGCAGTGGCGGAGGTAGCGGTGGAAATGTTAGTGGTCTTGGTGGAGCTGCATCAAAATTTGGCAAATTTGTTAAACTGTTTCCTAAACGATTTTCAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD150749             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAATTTGGCAAATTTGTTAAACTGTTTCCTAAACGATTTTCACCATCGAAAAAAATGCCTGATACAAAAGGATGTTTACGTGCTAATGTTACACGTAATCCATTTAATGGTGCTAAATATTTATGTGCAGCTATGACAAATGAAATTTTAGTAATGGAATGGTTTAATCCTGTATCATCATTTATTGAAATTAAAAGAATATTTGTTCCTGATATGCCTTCACCTTTATTGAATTTTGATTTATTAATTGTGAAAAATCTTCCTTTACCATTTGTTTGTGTTGGAGTCTATCGACATCATTCTCGTAAAGGTCGAGAAGGTCAACGTTTTCGTTTACATTTAATTGATTTAAATAGTTCTGGACCTAATCCACCACAGATACCTCCAATAGTTTCATCTATTACTCCTCC                                                 ]
[-] EMBL SMRAP071             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CGTGCTAATGTTACACGTAATCCATTTA   GTGCTAAATATTTATGTGCAGCTATGACAAATGAAATTT  GTAATGGAATGGTT  ATCCTGTATCATCATTTATTGAAATTAAAAGAATATTTGTTCCTGATATGCCTTCACCTTTATTGAATTTTGATTTATTAATTG                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD190219             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATTTTAGTAATGGAATGGTTTAATCCTGTATCATCATTTATTGAAATTAAAAGAATATTTGTTCCTGATATGCCTTCACCTTTATTGAATTTTGATTTATTAATTGTGAAAAATCTTCCTTTACCATTTGTTTGTGTTGGAGTCTATCGACATCATTCTCGTAAAGGTCGAGAAGGTCAACGTTTTCGTTTACATTTAATTGATTTAAATAGTTCTGGACCTAATCCACCACAGATACCTCCAATAGTTTCATCTATTACTCCTCCTATTTCAATATCCTCTGTTACTGCTGTTTCTATCACTGCAATGGCATCA]


>consensus_6389#0 TTGAATTAATAAGCTGTCCTAATAAGGATGCATCCCACCCAGGTCAAATACTGTCATCGA TTCCTCCACCTCTCGCTTCGCTGACTTCTCCAACACCACAATCTAAACCACGAGGAAATA TGGGAGCTTGTTTTTCATTAGTATTTCAAGGTTGTCCATTAAAAATTAATTCAACTGCAA CATGGATTAATCCAGCTAATAATGGTCAAGTTATTCTATTGGGTACAAATGATGGTATAT ATTGTTTACAATTGAAAGGACTTTCTGAGAATTCTCTAGAATTACTATTTCCACGTCGTT GTTTATGGTTATCTGTTACTCGAGATACTATGATGTCACTATCTGGTCGTCATCCTCAAT TGTATGCACACCATTTGGTTTCTTTGATGAAATTAAAATCTCAAGGTCACTCTATGAGTG GTGGTGGTAGTACAGTTGGAGGCAGTGGCGGAGGTAGCGGTGGAAATGTTAGTGGTCTTG GTGGAGCTGCATCAAAATTTGGCAAATTTGTTAAACTGTTTCCTAAACGATTTTCACCAT CGAAAAAAATGCCTGATACAAAAGGATGTTTACGTGCTAATGTTACACGTAATCCATTTA ATGGTGCTAAATATTTATGTGCAGCTATGACAAATGAAATTTTAGTAATGGAATGGTTTA ATCCTGTATCATCATTTATTGAAATTAAAAGAATATTTGTTCCTGATATGCCTTCACCTT TATTGAATTTTGATTTATTAATTGTGAAAAATCTTCCTTTACCATTTGTTTGTGTTGGAG TCTATCGACATCATTCTCGTAAAGGTCGAGAAGGTCAACGTTTTCGTTTACATTTAATTG ATTTAAATAGTTCTGGACCTAATCCACCACAGATACCTCCAATAGTTTCATCTATTACTC CTCCTATTTCAATATCCTCTGTTACTGCTGTTTCTATCACTGCAATGGCATCA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)