These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6390#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 573 fasta sequence [GAGGAAAGCCAAATTTACTATGTATACATTTTATAAAATGGTCACATACATAAAAAGAATCTCAATTACATATTGGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGACACAAAATACCTAAATACATTTTCATAAAAACAAACAAATGAGACCTTTTTTGCAAAAAATGGGAAAACAAAAAACCCAGTTAGATATACAATAAATTGGG-TTAAAAAAAAAACAAACAAGAAATGTATGTTATAAAGATTATAAAAGACCTGAAATCCATGTTAAACGTATAACATGATCCACTTTTCGACGAGTTGATTTAATACAACCTAAATATTGTAATTCTGCTAATCCTTGTAAGAAACGACATTGAGTCTCTTGAGATGGAGGATTTTCTGAGTCGACCGCCTCTCCCAGTATACTTGCAAATGCCATAAGCCAATCATATAAATTTACCATTTTATTTGTTTCAATTAATAATTTATATAAAATGCATAAATCAAATAATTTCGATGAAATACTACTTGAATTAGATAGTTTTAAATCAGTAATCTGTAAATATACACCAGGATTCACAAGTGCTTGATGTAA] [+] EMBL CD145194 [GAGGAAAGCCAAATTTACTATGTATACATTTTATAAAATGGTCACATACATAAAAAGAATCTCAATTACATATTGGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGACACAAAATACCTAAATACATTTTCATAAAAACAAACAAATGAGACCTTTTTTGCAAAATATGGGATAACAAAAAACCCAGTTAGATATACAATAAATTGGG TTAAAAAAAAAACAAACAAAAAATGTATGTTATAAAGATTATAAAAGACCTGAAATCCATGTTAAACGTATAACATGATCCACTTTTCGACGAGTTGATTTAATACAACCTAAATATTGTAATTCTGCTAATCCTTGTAAGAAACGACATTGAGTCTCTTGAGATGGAGGATTTTCTGAGTCGACCGCCTCTCCCAGTATACTTGCAAATGCCATAAGCCAATCATATAAATTTACCATTTTATTTGTTTCAATTAATAATTTATATAAAATGCATAAATCAAATAATTTCGATGAAATACTACTTGAATTAGATAGTTTTAAATCAGTAATCTGTAGATATACACCAGGATTCACAAGTGCTTGATGTA ] [+] EMBL CD145248 [ ATGTATACATTTTATAAAATGGTCACATACATAAAAAGAATCTCAATTACATATTGGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGACACAAAATACCTAAATACATTTTCATAAAAACAAACAAATGAGACCTTTTTTGCAAAAAATGGGAAAACAAAAAACCCAGTTAGATATACAATAAATTGGG TTTAAAAAAAAACAAACAAGAAATGTATGTTATAAAGATTATAAAAGACCTGAAATCCATGTTAAACGTATAACATGATCCACTTTTCGACGAGTTGATTTAATACAACCTAAATATTGTAATTCTGCTAATCCTTGTAAGAAACGACATTGAGTCTCTTGAGATGGAGGATTTTCTGAGTCGACCGCCTCTCCCAGTATACTTGCAAATGCCATAAGCCAATCATATAAATTTACCATTTTATTTGTTTCAATTAATAATTTATATAAAATGCATAAATCAAATAATTTCGATGAAATACTACTTGAATTAGATAGTTNTAAATCAGTAATCTGTAAATATACACCAGGATTCACAAGTGCTTGATGTA ] [+] EMBL CD145184 [ ATGTATACATTTTATAAAATGGTCACATACATAAAAAGAATCTCAATTACATATTGGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGACACAAAATACCTAAATACATTTTCATAAAAACAAACAAATGAGACCTTTTTTGCAAAAAATGGGAAAACAAAAAACCCAGTTAGATATACAATAAATTGGGTTTAAAAAAAAAACAAACAAGAAATGTTTGTTATAAAGATTATAAAAGACCTGAAATCCATGTTAAACGTATAACATGATCCACTTTTCGACGAGTTGATTTAATACAACCTAAGTATTGTAATTCTGCTAATCCTTGTAAGAAACGACATTGAGTC ] [-] EMBL CD145158 [ AATGAGACCTTTTTTGCAAAAAATGGGAAAACAAAAAACCCAGTTAGATATACAATAAATTGGGTTTAAAAAAAAAACAAACAAGAAATGTATGTTATAAAGATTATAAAAGACCTGAAATCCATGTTAAACGTATAACATGATCCACTTTTCGACGAGTTGATTTAATACAACCTAAATATTGTAATTCTGCTAATCCTTGTAAGAAACGACATTGAGTCTCTTGAGATGGAGTATTTTCTGAGTCGACCGCCTCTCCCAGTATACTTGCAAATGCCATAAGCCAATCATATAAATTTACCATTTTATTTGTTTCAATTAATAATTTATATAAAATGCATAAATCAAATAATTTCGATGAAATACTACTTGAATTAGATAGTTTTAAATCAGTAATCTGTAAATATACACCAGGATTCACAAGTGCTTGATGTAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||