cluster # 6395

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Schistosoma mansoni
cluster # 6395 cluster # 6395 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6395#0 length = 452 sequences # 4

consensusID : consensus_6395#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 452
fasta sequence

                              [CAGGTTTTCGTAATCCTGTTGTTAATTCAGTTGAAATGAGCTCAGATGGTTATTATCTAGCAGCTGTAACTGATAACAATCTTGTATGTATATGGCGTTATGCTCCACCGCAACAACAACAATACTCTCAAATAATTCAACAAACCACAACACCATCATTACATCAAACTACTACTATGCAACATAATAATAATCAATTAACAGCTATCAATAATTCTATGGTTACTGTTCCCAATGTTGCTAGCATAGTGGACGATGATACATCATCGTCAACGATAGCATGCATGGAGCTTTTAAACAATACTAATAATTCATCAATTGCTTTAAAATCTAGTGCCATAGAACTTGTTACTACCGGTCAACATTTGTTAGAATAAATATCATTATCATTATGATGATGTTATACTATTTGTTTTGTATTTTTGTTATTATTGTACCATGATTTATGTAGA]

[+] EMBL CD122290             [CAGGTTTTCGTAATCCTGTTGTTAATTCAGTTGAAATGAGCTCAAATGGTTGTTATCTAGCAGCTGTAACTGATAACAATCTTGTATGTATATGGCGTTATGCTCCACCGCAACAACAACAATACTCTCAAATAATTCAACAAACCACAACACCATCATTACATCAAACTACTACTATGCAACATAATAATAATCAATTAACAGCTATCAATAATTCTATGGTTACTGTTCCCAATGTTGCTAGCATAGTGGACGATGATACATCATCGTCAACGATAGCATGCATGGAGCTTTTAAACAATACTAATAATTCATCAATTGCTTTAAAATCTAGTGCCATAGAACTTGTTACTACCGGTCAACATTTGTTAGAATAAATATCATTATCATTATGATGATGTTATACTATTTGTTTTGTATTATTGTTATTATTGTACCATGATTTATGTAG ]
[+] EMBL CD122282             [CAGGTTTTCGTAATCCTGCTGTTAATTCAGTTGAAATGAGCTCAGATGGTTATTATCTAGCAGCTGTAACTGATAACAATCTTGTATGTATATGGCGTTATGCTCCACCGCAACAACAACAATACTCTCAAATAATTCAACAAACCACAACACCATCATTACATCAAACTACTACTATGCAACATAATAATAATCAATTAACAGCTATCAATAATTCTATGGTTACTGTTCCCAATGTTGCTAGCATAGTGGACGATGATACATCATCGTCAACGATAGCATGCATGGAGCTTTTAAACAATACTAATAATTCATCAATTGCTTTAAAATCTAGTGCCATAGAACTTGTTACTACCGGTCAACATTTGTTAGAATAAATATCATTATCATTATGATGATGTTATACTATTTGTTTTGTATTTTTGTTATTATTGTACCATGATTTATGTAG ]
[-] EMBL CD122369             [ AGGTTTTCGTAATCCTGTTGTTAATTCAGTTGAAATGAGCTCAGATGGTTATTATCTAGCAGCTGTAACTGATAACAATCTTGTATGTATATGGCGTTATGCTCCACCGCAACAACAACAATACTCTCAAATAATTCAACAAACCACAACACCATCATTACATCAAACTACTACTATGCAACATAATAATAATCAATTAACAGCTATCAATAATTCTATGGTTACTGTTCCCAATGTTGCTAGCATAGTGGACGATGATACATCGTCGTCAACGATAGCATGCATGGAGCTTTTAAACAATACTAATAATTCATCAATTGCTTAAAAATCTAGTGCCATAGAACTTGTTACTACCGGTCAACATTTGTTAGAATAAATATCATTATCATTATGATGATGTTATACTATTTGTTTCGTATTTTTGTTATTATTGTACCATGATTTATGTAGA]
[-] EMBL CD122339             [ AGGTTTTCGTAATCCTGTTGTTAATTCAGTTGAAATGAGCTCAGATGGTTATTATCTAGCAGCTGTAACTGATAACAATCTTGTATGTATATGGCGTTATGCTCCACCGCAACAACAACAATACTCTCAAATAATTCAACAAGCCACAACACCATCATTACATCAAACTACTACTATGCAACATAATAATAATCAATTAACAGCTATCAATAATTCTACGGTTACTGTTCCCAATGTTGCTAGCATAGTGGACGATGATACATCATCGTCAACGATAGCATGCATGGAGCTTTTAAACAATACTAATAATTCATCAATTGCTTTAAAATCTAGTGCCATAGAACTTGTTACTACCGGTCAACATTTGTTAGAATAAATATCATTATCATTATGATGATGTTATACTATTTGTTTTGTATTTTTGTTATTATTGTACCATGATTTATGTAGA]




>consensus_6395#0
CAGGTTTTCGTAATCCTGTTGTTAATTCAGTTGAAATGAGCTCAGATGGTTATTATCTAG
CAGCTGTAACTGATAACAATCTTGTATGTATATGGCGTTATGCTCCACCGCAACAACAAC
AATACTCTCAAATAATTCAACAAACCACAACACCATCATTACATCAAACTACTACTATGC
AACATAATAATAATCAATTAACAGCTATCAATAATTCTATGGTTACTGTTCCCAATGTTG
CTAGCATAGTGGACGATGATACATCATCGTCAACGATAGCATGCATGGAGCTTTTAAACA
ATACTAATAATTCATCAATTGCTTTAAAATCTAGTGCCATAGAACTTGTTACTACCGGTC
AACATTTGTTAGAATAAATATCATTATCATTATGATGATGTTATACTATTTGTTTTGTAT
TTTTGTTATTATTGTACCATGATTTATGTAGA

clustalw multiple alignements is not computed in this case