cluster # 6397

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Schistosoma mansoni
cluster # 6397 cluster # 6397 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6397#0 length = 454 sequences # 4

consensusID : consensus_6397#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 454
fasta sequence

                              [GAGTGGATAATTCTAAAGGAAGATCTTGAT-AGATC-AGTGTGACCAAAGTTTACGAACTGTTTTAAAATCAAGTTTTTAACTGATTTGCAAGTTTGCTTAAACAACCAGACAGAGGATTACTCGGAAATGCGTTCCGTAAAACCTCGCTTTATGCGATCAATCGGACACGTTTTAAAAGAGCAAGTAAACTTATAGATACACGTTCATATGGATTAAACTGGGACCCTATCCTCCACACACGCTCGAATCAAAAGCCATCTAGATAAAGCAGTACGAAATTTAACTCAATTTTATGTTTTACTCAAGGATGTTGACAGTTTGTTTTTAGGATCTTTGCTACACTCTCATTTAGATCCAGTTTATA-TAAAAAAAACATCTTTGGTAATGTGGACACTCTTACCGTTTTTGTGTCTAGCAGACTAATATTTATGTACATTAAAACACCACTCACTAA]

[+] EMBL CD122383             [GAGTGGATAATTCTAAAGGAAGATCTTGAT ATATC AGTGTGACCAAAGTTTACAAACTGTTTTAAAATCAAGTTTTTAACTGATTTGCAAGTTTGCTTAAACAACCACACAGAGGATTACTCGGAAATGCGTTCCGTAAAACCTCGCTTTATGCGATCAATCGGACACGTTTTAAAAGAGCAAGTAAACTTGTAGATACACGTTCATATGGATTAAACTGGGACCCTATCCTCCACACACGCTCGAATCAAAAGCCATCTAGATAAAGCAGTCCGAAATTTAACTCAATTTTATGTGTTACTCAAGGATGTTGACAGTTTGCTTTTAAGATCTTTGCTACACTCTCATTTAGATCCAGTCTATACTAAAAAAAACATCTATGGTAATGTGGACACTCTTACCGTTTAAGTGTCTAGCAGACTAATATTGATGTACATAAAAACACCACTCACTA ]
[+] EMBL CD122375             [GAGTGGATAATTCTAAAGGAAGATCTTGAT AGATC AGTGTGACCAAAGTTTACGAACTGTTTTAAAATCAAGTTTTTAACTGATTTGCAAGTTTGCTTAAACAACCAGACAGAGGATTACTCGGAAATGCGTTCCGTAAAACCTCGCTTTATGCGATCAATCGGACACGTTTTAAAAGAGCAAGTAAACTTATAGATACACGTTCATATGGATTAAACTGGGACCCTATCCTCCACACACGCTCGAATCAAAAGCCATCTAGATAAAGCAGTACGAAATTTAACTCAATTTTATGTTTTACTCAAGGATGTTGACAGTTTG TTTTAGGATCTTTGCTACACTCTCATTTAGATCCAGTTTATA TAAAAAAAACATCTTTGGTAATGTGGACACTCTTACCGTTTTTGTGTCTAGCAGACTAATATTTATGTACATTAAAACACCACTCACTA ]
[-] EMBL CD122296             [ AGTGGATAA TGTAAAGGAAGATCTTGATAAGATCAAGTGTGACCAAAGTTTACGAACTGTTTTAAAATCAAGTTTTTGACTGATTTGCAAGTTTGCTTAAACAACCAGACAGAGGATTACTCGGAAATGCGTTCCGTAAAACCTCGCTTTATGCGATCAATCGGACACGTTTTAAAAGAGCAAGTAAACTTATAGATACACGTTCATATGGATTAAACTGGGACCCTATCCTCCACACACGCTTGAATCAAAAGCCATCTAGATAAAGCAGTACGAAATTTAACTCAATTTTATGTTTTACTCAAGGATGTTGACAGTTTGTTTTTAGGATCTTTGCTACACTCTCATTTAGATCCAGTTTATA TAAAAAAAACATCTTTGGTAATGTGGACACTCTTACCGTTTTTGTGTCTAGCAGACTAATATTTATGTACATTAAAACACCACTCACTAA]
[-] EMBL CD122284             [ AGTGGATAATTCTAAAGGAAGATCTTGAT AGATC AGTGTGACCAAAGTTTACGAACTGTTTTAAAATCAAGTTTTTAACTGATTTGCAAGTTTGCTTAAACAACCAGACAGAGGATTACTCGGAAATGCGTTCCGTAAAACCTCGCTTTATGCGATCAATCGGACACGTTTTAAAAGAGCAAGTAAACTTATAGATACACGTTCATATGGATTAAACTGGGACCCTATCCTCCACACACGCTCGAATCAAAAGCCATCTAGATAAAGCAGTACGAAATTTAACTCAATTTTATGTTTTACTCAAGGATGTTGACAGTTTGTTTTTAGGATCTTTGCTACACTCTCATTTAGATCCAGTTTATA TAAAAAAAACATCTTTGGTAATGTGGACACTCTTACCGTTTTTGTGTCTAGCAGACTAATATTTATGTACATTGAAACACCACTCACTAA]




>consensus_6397#0
GAGTGGATAATTCTAAAGGAAGATCTTGATAGATCAGTGTGACCAAAGTTTACGAACTGT
TTTAAAATCAAGTTTTTAACTGATTTGCAAGTTTGCTTAAACAACCAGACAGAGGATTAC
TCGGAAATGCGTTCCGTAAAACCTCGCTTTATGCGATCAATCGGACACGTTTTAAAAGAG
CAAGTAAACTTATAGATACACGTTCATATGGATTAAACTGGGACCCTATCCTCCACACAC
GCTCGAATCAAAAGCCATCTAGATAAAGCAGTACGAAATTTAACTCAATTTTATGTTTTA
CTCAAGGATGTTGACAGTTTGTTTTTAGGATCTTTGCTACACTCTCATTTAGATCCAGTT
TATATAAAAAAAACATCTTTGGTAATGTGGACACTCTTACCGTTTTTGTGTCTAGCAGAC
TAATATTTATGTACATTAAAACACCACTCACTAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case