cluster # 6401

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Schistosoma mansoni
cluster # 6401 cluster # 6401 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6401#0 length = 761 sequences # 4

consensusID : consensus_6401#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 761
fasta sequence

                              [AGATGAAGAACCAGCGAGTTCTGAGTCCTCCATTCAAAATGAAAAATGTGCTACCAGTGATTTCAGTGCTGCCAATAAGTCATTGGGTTCTAATATAAACCAGCTTGGAGAATGCGGTTTCCAGAAGTTTATTAATGGTTTAAGATGTTTCGAAGCCGAAACTGTCGAAGAACTCCGTGCAGTTGCTTTCTCGTTACTTCCTCAAATAAAATCAAAGTATGGAGTATTATGCTTCCTTTATTCTGTTTTGTTCACACATGGACTTCAGTCACTTATAAATGAAATGAATGGTGAGATGGATGCATTGATTGATCCGATCCATGGACATGCTAGTCAGTGTCTGATTAATTTATTAATTACCGGGGAGAGTACGCCATATTTATTTGATGGTGAAAGAGATCTCGGAGGATTTACATTGAAAGGTATATCCAGGCAACCGAAAACCGGTTTCTTGACTTTTGTTGAAGCAATGAGATATTGTGAGGTGGGATGGTTCTTGAAAAATCCATATTACCCAGTTTGGATTTTGGGATCTGAGACACACTTGACCGTTTTAGCGTCGCCAGATATGTCGTTGGTGTCAAAAAATGTAAAATCAGAAACTAACTCCATATCAGGTATACGTCAAGCTGAAATTGAGTTTAATTATCTGAGCCCAGATCAAGATACTGGTGGTTTCATCAGTTCGTCAGATTTCGAAAAATTACTGACTAAATTACGTCTGTCTACAGGATCCCAACAAGTAAATGATTTAGTTACAA]

[+] EMBL CD155214             [AGATGAAGAACCAGCGAGTTCTGAGTCCTCCATTCAAAATGAAAAATGTGCTACCAGTGATTTCAGTGCTGCCAATAAGTCATTGGGTTCTAATATAAACCAGCTTGGAGAATGCGGTTTCCAGAAGTTTATTAATGGTTTAAGATGTTTCGAAGCCGAAACTGTCGAAGAACTCCGTGCAGTTGCTTTCTCGTTACTTCCTCAAATAAAATCAAAGTATGGAGTATTATGCTTCCTTTATTCTGTTTTGTTCACACATGGACTTCAGTCACTTATAAATGAAATGAATGGTGAGATGGATGCATTGATTGATCCGATCCATGGACATGCTAGTCAGTGTCTGATTAGTTTATTAATTACCGGGGAGAGTACGCCATATTTATTTGATGGTGAAAGAGATCTCGGAGGATTTACATTGAAAGGTATATCCAGGCAACCGAAAACCGGTTTCTTGACTTTTGTTGAAGCAATGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD191395             [   TGAAGAACCAGCGAGTTCTGAGTCCTCCATTCAAAATGAAAAATGTGCTACCAGTGATTTCAGTGCTGCCAATAAGTCATTGGGTTCTAATATAAACCAGCTTGGAGAATGCGGTTTCCAGAAGTTTATTAATGGTTTAAGATGTTTCGAAGCCGAAACTGTCGAAGAACTCCGTGCAGTTGCTTTCTCGTTACTTCCTCAAATAAAATCAAAGTATGGAGTATTATGCTTCCTTTATTCTGTTTTGTTCACACATGGACTTCAGTCACTTATAAATGAAATGAATGGTGAGATGGATGCATTGATTGATCCGATCCATGGACATGCTAGTCAGTGTCTGATTAATTTATTAATTACCGGGGAGAGTACGCCATATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD163260             [                                    AAATGAAAAATGTGCTACCAGTGATTTCAGTGCTGCCAATAAGTCATTGGGTTCTAATATAAACCAGCTTGGAGAATGCGGTTTCCAGAAGTTTATTAATGGTTTAAGATGTTTCGAAGCCGAAACTGTCGAAGAACTCCGTGCAGTTGCTTTCTCGTTACTTCCTCAAATAAAATCAAAGTATGGAGTATTATGCTTCCTTTATTCTGTTTCGTTCACACATGGACTTCAGTCACTTATAAATGAAATGAATGGTGAGATGGATGCATTGATTGATCCGATCCATGGACATGCTAGTCAGTGTCTGATTAATTTATTAATTACCGGGGAGAGTACGCCATATTTATTTGATGGTGAAAGAGATCTCGGAGGATTTACATTGAAAGGTATATCCAGGCAACCGAAAACCGGTTTCTTGACTTTTGTTGAAGCAATGAGATATTGTGAGG                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD121475             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GATCCATGGACATGCTAGTCAGTGTCTGATTAATTTATTAATTACCGGGGAGAGTACGCCATATTTATTTGATGGTGAAAGAGATCTCGGAGGATTTACATTGAAAGGTATATCCAGGCAACCGAAAACCGGTTTCTTGACTTTTGTTGAAGCAATGAGATATTGTGAAGTGGGATGGTTCTTGAAAAATCCATATTACCCAGTTTGGATTTTGGGATCTGAGACACACTTGACCGTTTTAGCGTCGCCAGATATGTCGTTGGTGTCAAAAAATGTAAAATCAGAAACTAACTCCATATCAGGTATACGTCAAGCTGAAATTGAGTTTAATTATCTGAGCCCAGATCAAGATACTGGTGGTTTCATCAGTTCGTCAGATTTCGAAAAATTACTGACTAAATTACGTCTGTCTACAGGATCCCAACAAGTAAATGATTTAGTTACAA]




>consensus_6401#0
AGATGAAGAACCAGCGAGTTCTGAGTCCTCCATTCAAAATGAAAAATGTGCTACCAGTGA
TTTCAGTGCTGCCAATAAGTCATTGGGTTCTAATATAAACCAGCTTGGAGAATGCGGTTT
CCAGAAGTTTATTAATGGTTTAAGATGTTTCGAAGCCGAAACTGTCGAAGAACTCCGTGC
AGTTGCTTTCTCGTTACTTCCTCAAATAAAATCAAAGTATGGAGTATTATGCTTCCTTTA
TTCTGTTTTGTTCACACATGGACTTCAGTCACTTATAAATGAAATGAATGGTGAGATGGA
TGCATTGATTGATCCGATCCATGGACATGCTAGTCAGTGTCTGATTAATTTATTAATTAC
CGGGGAGAGTACGCCATATTTATTTGATGGTGAAAGAGATCTCGGAGGATTTACATTGAA
AGGTATATCCAGGCAACCGAAAACCGGTTTCTTGACTTTTGTTGAAGCAATGAGATATTG
TGAGGTGGGATGGTTCTTGAAAAATCCATATTACCCAGTTTGGATTTTGGGATCTGAGAC
ACACTTGACCGTTTTAGCGTCGCCAGATATGTCGTTGGTGTCAAAAAATGTAAAATCAGA
AACTAACTCCATATCAGGTATACGTCAAGCTGAAATTGAGTTTAATTATCTGAGCCCAGA
TCAAGATACTGGTGGTTTCATCAGTTCGTCAGATTTCGAAAAATTACTGACTAAATTACG
TCTGTCTACAGGATCCCAACAAGTAAATGATTTAGTTACAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case